Protein–RNA interactions for Protein: Q06149

PDR8, Transcription factor PDR8, yeastyeast

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR8Q06149 YLR281CYLR281C 468 nt11.7□□□□□ -0.54
PDR8Q06149 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.65□□□□□ -0.54
PDR8Q06149 WHI5YOR083W 888 nt11.65□□□□□ -0.54
PDR8Q06149 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.61□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.61□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.61□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.61□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.61□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 FPS1YLL043W 2010 nt11.6□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 CAC2YML102W 1407 nt11.59□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 ART5YGR068C 1761 nt11.59□□□□□ -0.55
PDR8Q06149 NVJ2YPR091C 2313 nt11.58□□□□□ -0.56
PDR8Q06149 EMI2YDR516C 1503 nt11.58□□□□□ -0.56
PDR8Q06149 TIR4YOR009W 1464 nt11.57□□□□□ -0.56
PDR8Q06149 PUS2YGL063W 1113 nt11.56□□□□□ -0.56
PDR8Q06149 GFD2YCL036W 1701 nt11.54□□□□□ -0.56
PDR8Q06149 YJL152WYJL152W 360 nt11.53□□□□□ -0.56
PDR8Q06149 PET9YBL030C 957 nt11.53□□□□□ -0.56
PDR8Q06149 YCH1YGR203W 447 nt11.52□□□□□ -0.57
PDR8Q06149 YDL221WYDL221W 552 nt11.51□□□□□ -0.57
PDR8Q06149 YMR090WYMR090W 684 nt11.49□□□□□ -0.57
PDR8Q06149 Q0182Q0182 405 nt11.47□□□□□ -0.57
PDR8Q06149 YMR057CYMR057C 372 nt11.43□□□□□ -0.58
PDR8Q06149 DSK2YMR276W 1122 nt11.43□□□□□ -0.58
PDR8Q06149 IRC15YPL017C 1500 nt11.43□□□□□ -0.58
PDR8Q06149 IMP2'YIL154C 1041 nt11.42□□□□□ -0.58
PDR8Q06149 RTS2YOR077W 699 nt11.39□□□□□ -0.59
PDR8Q06149 YBR220CYBR220C 1683 nt11.39□□□□□ -0.59
PDR8Q06149 YLR236CYLR236C 324 nt11.38□□□□□ -0.59
PDR8Q06149 SDH1YKL148C 1923 nt11.37□□□□□ -0.59
PDR8Q06149 IDH1YNL037C 1083 nt11.36□□□□□ -0.59
PDR8Q06149 GIS3YLR094C 1509 nt11.35□□□□□ -0.59
PDR8Q06149 YPR011CYPR011C 981 nt11.34□□□□□ -0.59
PDR8Q06149 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.33□□□□□ -0.6
PDR8Q06149 SCC4YER147C 1875 nt11.3□□□□□ -0.6
PDR8Q06149 CUE1YMR264W 612 nt11.29□□□□□ -0.6
PDR8Q06149 FMP45YDL222C 930 nt11.27□□□□□ -0.61
PDR8Q06149 GBP2YCL011C 1284 nt11.26□□□□□ -0.61
PDR8Q06149 YDR433WYDR433W 441 nt11.19□□□□□ -0.62
PDR8Q06149 ERV46YAL042W 1248 nt11.19□□□□□ -0.62
PDR8Q06149 PCH2YBR186W 1695 nt11.18□□□□□ -0.62
PDR8Q06149 LPX1YOR084W 1164 nt11.18□□□□□ -0.62
PDR8Q06149 GUT2YIL155C 1950 nt11.17□□□□□ -0.62
PDR8Q06149 MOT3YMR070W 1473 nt11.15□□□□□ -0.62
PDR8Q06149 YIL100WYIL100W 354 nt11.15□□□□□ -0.62
PDR8Q06149 TCD2YKL027W 1344 nt11.13□□□□□ -0.63
PDR8Q06149 RRD1YIL153W 1182 nt11.12□□□□□ -0.63
PDR8Q06149 MXR2YCL033C 507 nt11.11□□□□□ -0.63
PDR8Q06149 DED1YOR204W 1815 nt11.1□□□□□ -0.63
PDR8Q06149 SEC11YIR022W 504 nt11.09□□□□□ -0.63
PDR8Q06149 YKR040CYKR040C 504 nt11.09□□□□□ -0.63
PDR8Q06149 PIB2YGL023C 1908 nt11.02□□□□□ -0.65
PDR8Q06149 YSC84YHR016C 1407 nt11.01□□□□□ -0.65
PDR8Q06149 YNL195CYNL195C 786 nt11□□□□□ -0.65
PDR8Q06149 FMP52YER004W 696 nt10.99□□□□□ -0.65
PDR8Q06149 FMT1YBL013W 1206 nt10.97□□□□□ -0.65
PDR8Q06149 RRT12YCR045C 1476 nt10.97□□□□□ -0.65
PDR8Q06149 YHL050CYHL050C 2094 nt10.97□□□□□ -0.65
PDR8Q06149 SPP1YPL138C 1062 nt10.94□□□□□ -0.66
PDR8Q06149 FRD1YEL047C 1413 nt10.93□□□□□ -0.66
PDR8Q06149 SOR2YDL246C 1074 nt10.93□□□□□ -0.66
PDR8Q06149 SOR1YJR159W 1074 nt10.93□□□□□ -0.66
PDR8Q06149 YJL225CYJL225C 5277 nt10.91□□□□□ -0.66
PDR8Q06149 YCL042WYCL042W 360 nt10.91□□□□□ -0.66
PDR8Q06149 CWP1YKL096W 720 nt10.87□□□□□ -0.67
PDR8Q06149 ADH2YMR303C 1047 nt10.85□□□□□ -0.67
PDR8Q06149 PCM1YEL058W 1674 nt10.85□□□□□ -0.67
PDR8Q06149 RTF1YGL244W 1677 nt10.81□□□□□ -0.68
PDR8Q06149 SNF6YHL025W 999 nt10.79□□□□□ -0.68
PDR8Q06149 UME6YDR207C 2511 nt10.79□□□□□ -0.68
PDR8Q06149 RTG1YOL067C 534 nt10.73□□□□□ -0.69
PDR8Q06149 PTH1YHR189W 573 nt10.72□□□□□ -0.69
PDR8Q06149 MRPL8YJL063C 717 nt10.71□□□□□ -0.69
PDR8Q06149 LCB1YMR296C 1677 nt10.7□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 YLR235CYLR235C 399 nt10.7□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 PTK1YKL198C 1989 nt10.7□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 SIM1YIL123W 1431 nt10.68□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 YIH1YCR059C 777 nt10.68□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 NCP1YHR042W 2076 nt10.68□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.67□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 YEL076CYEL076C 651 nt10.67□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 DIC1YLR348C 897 nt10.67□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 YLR464WYLR464W 651 nt10.67□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 BIO4YNR057C 714 nt10.67□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 BOP3YNL042W 1191 nt10.66□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 RNQ1YCL028W 1218 nt10.66□□□□□ -0.7
PDR8Q06149 YKL030WYKL030W 606 nt10.63□□□□□ -0.71
PDR8Q06149 BOR1YNL275W 1731 nt10.62□□□□□ -0.71
PDR8Q06149 ADO1YJR105W 1023 nt10.61□□□□□ -0.71
PDR8Q06149 YLL053CYLL053C 459 nt10.58□□□□□ -0.72
PDR8Q06149 TIM23YNR017W 669 nt10.57□□□□□ -0.72
PDR8Q06149 HUA1YGR268C 597 nt10.54□□□□□ -0.72
PDR8Q06149 FTR1YER145C 1215 nt10.52□□□□□ -0.73
PDR8Q06149 YLR179CYLR179C 606 nt10.52□□□□□ -0.73
PDR8Q06149 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.51□□□□□ -0.73
PDR8Q06149 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.51□□□□□ -0.73
PDR8Q06149 LYS4YDR234W 2082 nt10.5□□□□□ -0.73
PDR8Q06149 ERF2YLR246W 1080 nt10.5□□□□□ -0.73
PDR8Q06149 GAL1YBR020W 1587 nt10.48□□□□□ -0.73
PDR8Q06149 CRR1YLR213C 1269 nt10.47□□□□□ -0.73
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