Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 MNP1YGL068W 585 nt13.39□□□□□ -0.27
VPS38Q05919 ART5YGR068C 1761 nt13.37□□□□□ -0.27
VPS38Q05919 SCC4YER147C 1875 nt13.36□□□□□ -0.27
VPS38Q05919 GFD2YCL036W 1701 nt13.35□□□□□ -0.27
VPS38Q05919 GIS3YLR094C 1509 nt13.32□□□□□ -0.28
VPS38Q05919 RKM5YLR137W 1104 nt13.3□□□□□ -0.28
VPS38Q05919 YKL097CYKL097C 411 nt13.28□□□□□ -0.28
VPS38Q05919 PET9YBL030C 957 nt13.25□□□□□ -0.29
VPS38Q05919 RTS2YOR077W 699 nt13.25□□□□□ -0.29
VPS38Q05919 TIR4YOR009W 1464 nt13.2□□□□□ -0.3
VPS38Q05919 YCH1YGR203W 447 nt13.17□□□□□ -0.3
VPS38Q05919 PCH2YBR186W 1695 nt13.15□□□□□ -0.31
VPS38Q05919 SEC11YIR022W 504 nt13.14□□□□□ -0.31
VPS38Q05919 YMR057CYMR057C 372 nt13.11□□□□□ -0.31
VPS38Q05919 CUE1YMR264W 612 nt13.11□□□□□ -0.31
VPS38Q05919 YSC84YHR016C 1407 nt13.09□□□□□ -0.31
VPS38Q05919 GUT2YIL155C 1950 nt13.09□□□□□ -0.31
VPS38Q05919 NPL3YDR432W 1245 nt13.05□□□□□ -0.32
VPS38Q05919 YHL050CYHL050C 2094 nt13.01□□□□□ -0.33
VPS38Q05919 RRT12YCR045C 1476 nt12.98□□□□□ -0.33
VPS38Q05919 FPS1YLL043W 2010 nt12.98□□□□□ -0.33
VPS38Q05919 YJL152WYJL152W 360 nt12.98□□□□□ -0.33
VPS38Q05919 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.98□□□□□ -0.33
VPS38Q05919 YOL037CYOL037C 354 nt12.97□□□□□ -0.33
VPS38Q05919 YIL100WYIL100W 354 nt12.95□□□□□ -0.34
VPS38Q05919 YNL195CYNL195C 786 nt12.91□□□□□ -0.34
VPS38Q05919 YLR236CYLR236C 324 nt12.89□□□□□ -0.35
VPS38Q05919 PIB2YGL023C 1908 nt12.89□□□□□ -0.35
VPS38Q05919 YOR139CYOR139C 393 nt12.85□□□□□ -0.35
VPS38Q05919 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.85□□□□□ -0.35
VPS38Q05919 PAC11YDR488C 1602 nt12.81□□□□□ -0.36
VPS38Q05919 RTF1YGL244W 1677 nt12.81□□□□□ -0.36
VPS38Q05919 WHI5YOR083W 888 nt12.75□□□□□ -0.37
VPS38Q05919 BOP3YNL042W 1191 nt12.74□□□□□ -0.37
VPS38Q05919 YLR281CYLR281C 468 nt12.72□□□□□ -0.37
VPS38Q05919 PTK1YKL198C 1989 nt12.63□□□□□ -0.39
VPS38Q05919 NCP1YHR042W 2076 nt12.62□□□□□ -0.39
VPS38Q05919 IDH1YNL037C 1083 nt12.6□□□□□ -0.39
VPS38Q05919 RRD1YIL153W 1182 nt12.59□□□□□ -0.39
VPS38Q05919 GBP2YCL011C 1284 nt12.57□□□□□ -0.4
VPS38Q05919 LCB1YMR296C 1677 nt12.51□□□□□ -0.41
VPS38Q05919 DED1YOR204W 1815 nt12.51□□□□□ -0.41
VPS38Q05919 TCD2YKL027W 1344 nt12.48□□□□□ -0.41
VPS38Q05919 PUS2YGL063W 1113 nt12.48□□□□□ -0.41
VPS38Q05919 FMP52YER004W 696 nt12.46□□□□□ -0.41
VPS38Q05919 IMP2'YIL154C 1041 nt12.45□□□□□ -0.42
VPS38Q05919 FMT1YBL013W 1206 nt12.43□□□□□ -0.42
VPS38Q05919 DSK2YMR276W 1122 nt12.43□□□□□ -0.42
VPS38Q05919 PCM1YEL058W 1674 nt12.42□□□□□ -0.42
VPS38Q05919 YFL054CYFL054C 1941 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 YPR011CYPR011C 981 nt12.38□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 YDR433WYDR433W 441 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 SIM1YIL123W 1431 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 ADH2YMR303C 1047 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 MXR2YCL033C 507 nt12.34□□□□□ -0.43
VPS38Q05919 FMP45YDL222C 930 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS38Q05919 CWP1YKL096W 720 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS38Q05919 SNF6YHL025W 999 nt12.29□□□□□ -0.44
VPS38Q05919 SPT8YLR055C 1809 nt12.29□□□□□ -0.44
VPS38Q05919 Q0182Q0182 405 nt12.27□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 BIO4YNR057C 714 nt12.27□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 LYS4YDR234W 2082 nt12.25□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 SOR2YDL246C 1074 nt12.24□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 SOR1YJR159W 1074 nt12.24□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 ERV46YAL042W 1248 nt12.23□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 LPX1YOR084W 1164 nt12.23□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 NVJ2YPR091C 2313 nt12.22□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 YCL042WYCL042W 360 nt12.21□□□□□ -0.45
VPS38Q05919 YKR040CYKR040C 504 nt12.19□□□□□ -0.46
VPS38Q05919 FRD1YEL047C 1413 nt12.15□□□□□ -0.46
VPS38Q05919 YIH1YCR059C 777 nt12.13□□□□□ -0.47
VPS38Q05919 ERF2YLR246W 1080 nt12.1□□□□□ -0.47
VPS38Q05919 SWE1YJL187C 2460 nt12.1□□□□□ -0.47
VPS38Q05919 YLL053CYLL053C 459 nt12.08□□□□□ -0.48
VPS38Q05919 RNQ1YCL028W 1218 nt12.08□□□□□ -0.48
VPS38Q05919 CRR1YLR213C 1269 nt12.07□□□□□ -0.48
VPS38Q05919 ATF2YGR177C 1608 nt12□□□□□ -0.49
VPS38Q05919 DIC1YLR348C 897 nt11.97□□□□□ -0.49
VPS38Q05919 MIC10YCL057C-A 294 nt11.97□□□□□ -0.49
VPS38Q05919 HEM12YDR047W 1089 nt11.96□□□□□ -0.49
VPS38Q05919 FTR1YER145C 1215 nt11.96□□□□□ -0.49
VPS38Q05919 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.96□□□□□ -0.49
VPS38Q05919 BOR1YNL275W 1731 nt11.96□□□□□ -0.49
VPS38Q05919 YFL067WYFL067W 528 nt11.93□□□□□ -0.5
VPS38Q05919 SNG1YGR197C 1644 nt11.93□□□□□ -0.5
VPS38Q05919 GAL1YBR020W 1587 nt11.92□□□□□ -0.5
VPS38Q05919 TRM5YHR070W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
VPS38Q05919 DDR2YOL052C-A 186 nt11.87□□□□□ -0.51
VPS38Q05919 RAX1YOR301W 1308 nt11.86□□□□□ -0.51
VPS38Q05919 YJL225CYJL225C 5277 nt11.85□□□□□ -0.51
VPS38Q05919 PTH1YHR189W 573 nt11.85□□□□□ -0.51
VPS38Q05919 SPP1YPL138C 1062 nt11.85□□□□□ -0.51
VPS38Q05919 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.83□□□□□ -0.52
VPS38Q05919 HSP60YLR259C 1719 nt11.83□□□□□ -0.52
VPS38Q05919 CCA1YER168C 1641 nt11.81□□□□□ -0.52
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