Protein–RNA interactions for Protein: Q05027

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, yeastyeast

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF9Q05027 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.97□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.97□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.97□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.97□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.97□□□□□ -0.33
TAF9Q05027 PTP1YDL230W 1008 nt12.95□□□□□ -0.34
TAF9Q05027 WHI5YOR083W 888 nt12.93□□□□□ -0.34
TAF9Q05027 YDL221WYDL221W 552 nt12.91□□□□□ -0.34
TAF9Q05027 YMR090WYMR090W 684 nt12.89□□□□□ -0.35
TAF9Q05027 PUS2YGL063W 1113 nt12.88□□□□□ -0.35
TAF9Q05027 SIS1YNL007C 1059 nt12.87□□□□□ -0.35
TAF9Q05027 SDH1YKL148C 1923 nt12.87□□□□□ -0.35
TAF9Q05027 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.85□□□□□ -0.35
TAF9Q05027 RPP2AYOL039W 321 nt12.85□□□□□ -0.35
TAF9Q05027 IRC15YPL017C 1500 nt12.76□□□□□ -0.37
TAF9Q05027 YJL152WYJL152W 360 nt12.74□□□□□ -0.37
TAF9Q05027 SCC4YER147C 1875 nt12.71□□□□□ -0.37
TAF9Q05027 GIS3YLR094C 1509 nt12.67□□□□□ -0.38
TAF9Q05027 ART5YGR068C 1761 nt12.66□□□□□ -0.38
TAF9Q05027 TIR4YOR009W 1464 nt12.66□□□□□ -0.38
TAF9Q05027 DSK2YMR276W 1122 nt12.66□□□□□ -0.38
TAF9Q05027 IMP2'YIL154C 1041 nt12.64□□□□□ -0.39
TAF9Q05027 PCH2YBR186W 1695 nt12.62□□□□□ -0.39
TAF9Q05027 YCH1YGR203W 447 nt12.61□□□□□ -0.39
TAF9Q05027 PET9YBL030C 957 nt12.61□□□□□ -0.39
TAF9Q05027 GFD2YCL036W 1701 nt12.61□□□□□ -0.39
TAF9Q05027 YPR011CYPR011C 981 nt12.6□□□□□ -0.39
TAF9Q05027 GUT2YIL155C 1950 nt12.59□□□□□ -0.39
TAF9Q05027 PAC11YDR488C 1602 nt12.58□□□□□ -0.4
TAF9Q05027 YLR236CYLR236C 324 nt12.57□□□□□ -0.4
TAF9Q05027 RTS2YOR077W 699 nt12.56□□□□□ -0.4
TAF9Q05027 YMR057CYMR057C 372 nt12.55□□□□□ -0.4
TAF9Q05027 FMP45YDL222C 930 nt12.53□□□□□ -0.4
TAF9Q05027 IDH1YNL037C 1083 nt12.53□□□□□ -0.4
TAF9Q05027 SEC11YIR022W 504 nt12.51□□□□□ -0.41
TAF9Q05027 YSC84YHR016C 1407 nt12.5□□□□□ -0.41
TAF9Q05027 PIB2YGL023C 1908 nt12.47□□□□□ -0.41
TAF9Q05027 MOT3YMR070W 1473 nt12.46□□□□□ -0.42
TAF9Q05027 YHL050CYHL050C 2094 nt12.46□□□□□ -0.42
TAF9Q05027 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.45□□□□□ -0.42
TAF9Q05027 GBP2YCL011C 1284 nt12.42□□□□□ -0.42
TAF9Q05027 YDR433WYDR433W 441 nt12.39□□□□□ -0.43
TAF9Q05027 RRT12YCR045C 1476 nt12.39□□□□□ -0.43
TAF9Q05027 LPX1YOR084W 1164 nt12.38□□□□□ -0.43
TAF9Q05027 ERV46YAL042W 1248 nt12.36□□□□□ -0.43
TAF9Q05027 CUE1YMR264W 612 nt12.36□□□□□ -0.43
TAF9Q05027 FPS1YLL043W 2010 nt12.34□□□□□ -0.43
TAF9Q05027 YKR040CYKR040C 504 nt12.29□□□□□ -0.44
TAF9Q05027 RTF1YGL244W 1677 nt12.27□□□□□ -0.45
TAF9Q05027 MXR2YCL033C 507 nt12.27□□□□□ -0.45
TAF9Q05027 TCD2YKL027W 1344 nt12.27□□□□□ -0.45
TAF9Q05027 RRD1YIL153W 1182 nt12.19□□□□□ -0.46
TAF9Q05027 YIL100WYIL100W 354 nt12.18□□□□□ -0.46
TAF9Q05027 DED1YOR204W 1815 nt12.18□□□□□ -0.46
TAF9Q05027 SPP1YPL138C 1062 nt12.17□□□□□ -0.46
TAF9Q05027 PTK1YKL198C 1989 nt12.16□□□□□ -0.46
TAF9Q05027 YNL195CYNL195C 786 nt12.15□□□□□ -0.46
TAF9Q05027 BOP3YNL042W 1191 nt12.13□□□□□ -0.47
TAF9Q05027 NVJ2YPR091C 2313 nt12.12□□□□□ -0.47
TAF9Q05027 NCP1YHR042W 2076 nt12.08□□□□□ -0.48
TAF9Q05027 FMT1YBL013W 1206 nt12.06□□□□□ -0.48
TAF9Q05027 FRD1YEL047C 1413 nt12.04□□□□□ -0.48
TAF9Q05027 YCL042WYCL042W 360 nt12.04□□□□□ -0.48
TAF9Q05027 FMP52YER004W 696 nt12.02□□□□□ -0.49
TAF9Q05027 MRPL8YJL063C 717 nt11.99□□□□□ -0.49
TAF9Q05027 SOR2YDL246C 1074 nt11.97□□□□□ -0.49
TAF9Q05027 SOR1YJR159W 1074 nt11.97□□□□□ -0.49
TAF9Q05027 CWP1YKL096W 720 nt11.95□□□□□ -0.5
TAF9Q05027 RTG1YOL067C 534 nt11.94□□□□□ -0.5
TAF9Q05027 ADH2YMR303C 1047 nt11.92□□□□□ -0.5
TAF9Q05027 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.91□□□□□ -0.5
TAF9Q05027 YEL076CYEL076C 651 nt11.91□□□□□ -0.5
TAF9Q05027 YLR464WYLR464W 651 nt11.91□□□□□ -0.5
TAF9Q05027 LCB1YMR296C 1677 nt11.91□□□□□ -0.5
TAF9Q05027 ADO1YJR105W 1023 nt11.89□□□□□ -0.51
TAF9Q05027 PCM1YEL058W 1674 nt11.88□□□□□ -0.51
TAF9Q05027 PTH1YHR189W 573 nt11.87□□□□□ -0.51
TAF9Q05027 YFL054CYFL054C 1941 nt11.86□□□□□ -0.51
TAF9Q05027 SNF6YHL025W 999 nt11.83□□□□□ -0.52
TAF9Q05027 YLR235CYLR235C 399 nt11.83□□□□□ -0.52
TAF9Q05027 SPT8YLR055C 1809 nt11.79□□□□□ -0.52
TAF9Q05027 YKL030WYKL030W 606 nt11.78□□□□□ -0.52
TAF9Q05027 HUA1YGR268C 597 nt11.77□□□□□ -0.53
TAF9Q05027 DIC1YLR348C 897 nt11.72□□□□□ -0.53
TAF9Q05027 RNQ1YCL028W 1218 nt11.71□□□□□ -0.53
TAF9Q05027 YIH1YCR059C 777 nt11.7□□□□□ -0.54
TAF9Q05027 SIM1YIL123W 1431 nt11.69□□□□□ -0.54
TAF9Q05027 TIM23YNR017W 669 nt11.67□□□□□ -0.54
TAF9Q05027 LYS4YDR234W 2082 nt11.67□□□□□ -0.54
TAF9Q05027 BIO4YNR057C 714 nt11.64□□□□□ -0.55
TAF9Q05027 YLR179CYLR179C 606 nt11.62□□□□□ -0.55
TAF9Q05027 YLL053CYLL053C 459 nt11.61□□□□□ -0.55
TAF9Q05027 SWE1YJL187C 2460 nt11.6□□□□□ -0.55
TAF9Q05027 BOR1YNL275W 1731 nt11.58□□□□□ -0.56
TAF9Q05027 YPR064WYPR064W 420 nt11.54□□□□□ -0.56
TAF9Q05027 FTR1YER145C 1215 nt11.53□□□□□ -0.56
TAF9Q05027 UBX6YJL048C 1191 nt11.51□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 GAL1YBR020W 1587 nt11.5□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 AHT1YHR093W 549 nt11.48□□□□□ -0.57
TAF9Q05027 AQY1YPR192W 918 nt11.48□□□□□ -0.57
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