Protein–RNA interactions for Protein: Q04658

SMA2, Spore membrane assembly protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMA2Q04658 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.36□□□□□ -0.59
SMA2Q04658 PTP1YDL230W 1008 nt11.33□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.33□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 PUS2YGL063W 1113 nt11.32□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 YJL152WYJL152W 360 nt11.32□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 BDF1YLR399C 2061 nt11.32□□□□□ -0.6
SMA2Q04658 ART5YGR068C 1761 nt11.26□□□□□ -0.61
SMA2Q04658 CAC2YML102W 1407 nt11.26□□□□□ -0.61
SMA2Q04658 TIR4YOR009W 1464 nt11.25□□□□□ -0.61
SMA2Q04658 EMI2YDR516C 1503 nt11.25□□□□□ -0.61
SMA2Q04658 YCH1YGR203W 447 nt11.21□□□□□ -0.61
SMA2Q04658 PET9YBL030C 957 nt11.21□□□□□ -0.61
SMA2Q04658 NVJ2YPR091C 2313 nt11.2□□□□□ -0.62
SMA2Q04658 YMR090WYMR090W 684 nt11.2□□□□□ -0.62
SMA2Q04658 GFD2YCL036W 1701 nt11.2□□□□□ -0.62
SMA2Q04658 YDL221WYDL221W 552 nt11.16□□□□□ -0.62
SMA2Q04658 YMR057CYMR057C 372 nt11.15□□□□□ -0.62
SMA2Q04658 DSK2YMR276W 1122 nt11.14□□□□□ -0.63
SMA2Q04658 TAT1YBR069C 1860 nt11.14□□□□□ -0.63
SMA2Q04658 IMP2'YIL154C 1041 nt11.13□□□□□ -0.63
SMA2Q04658 RTS2YOR077W 699 nt11.1□□□□□ -0.63
SMA2Q04658 IDH1YNL037C 1083 nt11.09□□□□□ -0.63
SMA2Q04658 IRC15YPL017C 1500 nt11.08□□□□□ -0.64
SMA2Q04658 YLR236CYLR236C 324 nt11.07□□□□□ -0.64
SMA2Q04658 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.07□□□□□ -0.64
SMA2Q04658 YPR011CYPR011C 981 nt11.05□□□□□ -0.64
SMA2Q04658 FMP45YDL222C 930 nt11.03□□□□□ -0.64
SMA2Q04658 GIS3YLR094C 1509 nt11.01□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 SDH1YKL148C 1923 nt11□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 GBP2YCL011C 1284 nt11□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 MOT3YMR070W 1473 nt11□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 YBR220CYBR220C 1683 nt10.99□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 CUE1YMR264W 612 nt10.98□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 FPS1YLL043W 2010 nt10.96□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 SCC4YER147C 1875 nt10.96□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 YDR433WYDR433W 441 nt10.96□□□□□ -0.65
SMA2Q04658 LPX1YOR084W 1164 nt10.91□□□□□ -0.66
SMA2Q04658 YIL100WYIL100W 354 nt10.89□□□□□ -0.67
SMA2Q04658 ERV46YAL042W 1248 nt10.88□□□□□ -0.67
SMA2Q04658 TCD2YKL027W 1344 nt10.87□□□□□ -0.67
SMA2Q04658 MXR2YCL033C 507 nt10.85□□□□□ -0.67
SMA2Q04658 YKR040CYKR040C 504 nt10.82□□□□□ -0.68
SMA2Q04658 RRD1YIL153W 1182 nt10.8□□□□□ -0.68
SMA2Q04658 DED1YOR204W 1815 nt10.76□□□□□ -0.69
SMA2Q04658 YNL195CYNL195C 786 nt10.75□□□□□ -0.69
SMA2Q04658 YSC84YHR016C 1407 nt10.69□□□□□ -0.7
SMA2Q04658 SPP1YPL138C 1062 nt10.69□□□□□ -0.7
SMA2Q04658 FMP52YER004W 696 nt10.67□□□□□ -0.7
SMA2Q04658 FMT1YBL013W 1206 nt10.67□□□□□ -0.7
SMA2Q04658 YCL042WYCL042W 360 nt10.67□□□□□ -0.7
SMA2Q04658 RRT12YCR045C 1476 nt10.67□□□□□ -0.7
SMA2Q04658 FRD1YEL047C 1413 nt10.63□□□□□ -0.71
SMA2Q04658 SEC11YIR022W 504 nt10.62□□□□□ -0.71
SMA2Q04658 CWP1YKL096W 720 nt10.62□□□□□ -0.71
SMA2Q04658 SOR2YDL246C 1074 nt10.6□□□□□ -0.71
SMA2Q04658 SOR1YJR159W 1074 nt10.6□□□□□ -0.71
SMA2Q04658 YHL050CYHL050C 2094 nt10.6□□□□□ -0.71
SMA2Q04658 ADH2YMR303C 1047 nt10.58□□□□□ -0.72
SMA2Q04658 PCM1YEL058W 1674 nt10.55□□□□□ -0.72
SMA2Q04658 SNF6YHL025W 999 nt10.53□□□□□ -0.72
SMA2Q04658 PCH2YBR186W 1695 nt10.53□□□□□ -0.72
SMA2Q04658 PTH1YHR189W 573 nt10.49□□□□□ -0.73
SMA2Q04658 YLR235CYLR235C 399 nt10.45□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 GUT2YIL155C 1950 nt10.45□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 MRPL8YJL063C 717 nt10.44□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 RTG1YOL067C 534 nt10.44□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 SIM1YIL123W 1431 nt10.41□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.41□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 YEL076CYEL076C 651 nt10.41□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 YLR464WYLR464W 651 nt10.41□□□□□ -0.74
SMA2Q04658 DIC1YLR348C 897 nt10.39□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 YIH1YCR059C 777 nt10.38□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 ADO1YJR105W 1023 nt10.38□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 YKL030WYKL030W 606 nt10.38□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 RNQ1YCL028W 1218 nt10.37□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 BIO4YNR057C 714 nt10.36□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 LCB1YMR296C 1677 nt10.36□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 UME6YDR207C 2511 nt10.36□□□□□ -0.75
SMA2Q04658 BOP3YNL042W 1191 nt10.33□□□□□ -0.76
SMA2Q04658 RTF1YGL244W 1677 nt10.32□□□□□ -0.76
SMA2Q04658 TIM23YNR017W 669 nt10.32□□□□□ -0.76
SMA2Q04658 HUA1YGR268C 597 nt10.31□□□□□ -0.76
SMA2Q04658 YLL053CYLL053C 459 nt10.31□□□□□ -0.76
SMA2Q04658 YLR179CYLR179C 606 nt10.28□□□□□ -0.76
SMA2Q04658 NCP1YHR042W 2076 nt10.27□□□□□ -0.77
SMA2Q04658 PIB2YGL023C 1908 nt10.25□□□□□ -0.77
SMA2Q04658 FTR1YER145C 1215 nt10.23□□□□□ -0.77
SMA2Q04658 ERF2YLR246W 1080 nt10.22□□□□□ -0.77
SMA2Q04658 GAL1YBR020W 1587 nt10.2□□□□□ -0.78
SMA2Q04658 YPR064WYPR064W 420 nt10.19□□□□□ -0.78
SMA2Q04658 TRM5YHR070W 1500 nt10.18□□□□□ -0.78
SMA2Q04658 AQY1YPR192W 918 nt10.18□□□□□ -0.78
SMA2Q04658 BOR1YNL275W 1731 nt10.17□□□□□ -0.78
SMA2Q04658 DDR2YOL052C-A 186 nt10.16□□□□□ -0.78
SMA2Q04658 ATF2YGR177C 1608 nt10.15□□□□□ -0.78
SMA2Q04658 YFL067WYFL067W 528 nt10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms