Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 TAT1YBR069C 1860 nt12.08□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 YLR281CYLR281C 468 nt12.07□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 YMR090WYMR090W 684 nt12.07□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 WHI5YOR083W 888 nt12.05□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 YBR220CYBR220C 1683 nt12.04□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.04□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 ART5YGR068C 1761 nt12.04□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 TIR4YOR009W 1464 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.03□□□□□ -0.48
TRM12Q04235 YDL221WYDL221W 552 nt12.02□□□□□ -0.49
TRM12Q04235 GFD2YCL036W 1701 nt12□□□□□ -0.49
TRM12Q04235 YCH1YGR203W 447 nt11.96□□□□□ -0.49
TRM12Q04235 PUS2YGL063W 1113 nt11.95□□□□□ -0.5
TRM12Q04235 SDH1YKL148C 1923 nt11.94□□□□□ -0.5
TRM12Q04235 YJL152WYJL152W 360 nt11.93□□□□□ -0.5
TRM12Q04235 IRC15YPL017C 1500 nt11.92□□□□□ -0.5
TRM12Q04235 PET9YBL030C 957 nt11.92□□□□□ -0.5
TRM12Q04235 YMR057CYMR057C 372 nt11.89□□□□□ -0.51
TRM12Q04235 RTS2YOR077W 699 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM12Q04235 YPR011CYPR011C 981 nt11.84□□□□□ -0.51
TRM12Q04235 GIS3YLR094C 1509 nt11.83□□□□□ -0.52
TRM12Q04235 YLR236CYLR236C 324 nt11.82□□□□□ -0.52
TRM12Q04235 SCC4YER147C 1875 nt11.81□□□□□ -0.52
TRM12Q04235 DSK2YMR276W 1122 nt11.77□□□□□ -0.53
TRM12Q04235 FPS1YLL043W 2010 nt11.76□□□□□ -0.53
TRM12Q04235 IMP2'YIL154C 1041 nt11.74□□□□□ -0.53
TRM12Q04235 CUE1YMR264W 612 nt11.72□□□□□ -0.53
TRM12Q04235 IDH1YNL037C 1083 nt11.69□□□□□ -0.54
TRM12Q04235 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.69□□□□□ -0.54
TRM12Q04235 PCH2YBR186W 1695 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM12Q04235 SEC11YIR022W 504 nt11.66□□□□□ -0.54
TRM12Q04235 FMP45YDL222C 930 nt11.65□□□□□ -0.54
TRM12Q04235 GBP2YCL011C 1284 nt11.64□□□□□ -0.55
TRM12Q04235 GUT2YIL155C 1950 nt11.61□□□□□ -0.55
TRM12Q04235 LPX1YOR084W 1164 nt11.6□□□□□ -0.55
TRM12Q04235 MOT3YMR070W 1473 nt11.58□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 YDR433WYDR433W 441 nt11.57□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 YSC84YHR016C 1407 nt11.57□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 RRD1YIL153W 1182 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 MXR2YCL033C 507 nt11.56□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 DED1YOR204W 1815 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 ERV46YAL042W 1248 nt11.54□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 YIL100WYIL100W 354 nt11.53□□□□□ -0.56
TRM12Q04235 YHL050CYHL050C 2094 nt11.51□□□□□ -0.57
TRM12Q04235 TCD2YKL027W 1344 nt11.49□□□□□ -0.57
TRM12Q04235 RRT12YCR045C 1476 nt11.48□□□□□ -0.57
TRM12Q04235 YKR040CYKR040C 504 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM12Q04235 FMT1YBL013W 1206 nt11.45□□□□□ -0.58
TRM12Q04235 PIB2YGL023C 1908 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM12Q04235 PAC11YDR488C 1602 nt11.43□□□□□ -0.58
TRM12Q04235 SPP1YPL138C 1062 nt11.41□□□□□ -0.58
TRM12Q04235 YNL195CYNL195C 786 nt11.4□□□□□ -0.58
TRM12Q04235 RTF1YGL244W 1677 nt11.36□□□□□ -0.59
TRM12Q04235 FRD1YEL047C 1413 nt11.34□□□□□ -0.59
TRM12Q04235 FMP52YER004W 696 nt11.32□□□□□ -0.6
TRM12Q04235 SOR2YDL246C 1074 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM12Q04235 SOR1YJR159W 1074 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM12Q04235 CWP1YKL096W 720 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM12Q04235 ADH2YMR303C 1047 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM12Q04235 BOP3YNL042W 1191 nt11.29□□□□□ -0.6
TRM12Q04235 PCM1YEL058W 1674 nt11.26□□□□□ -0.61
TRM12Q04235 YCL042WYCL042W 360 nt11.24□□□□□ -0.61
TRM12Q04235 PTK1YKL198C 1989 nt11.2□□□□□ -0.62
TRM12Q04235 NCP1YHR042W 2076 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM12Q04235 MRPL8YJL063C 717 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM12Q04235 SNF6YHL025W 999 nt11.16□□□□□ -0.62
TRM12Q04235 LCB1YMR296C 1677 nt11.15□□□□□ -0.62
TRM12Q04235 PTH1YHR189W 573 nt11.15□□□□□ -0.62
TRM12Q04235 RTG1YOL067C 534 nt11.11□□□□□ -0.63
TRM12Q04235 SIM1YIL123W 1431 nt11.09□□□□□ -0.63
TRM12Q04235 BIO4YNR057C 714 nt11.08□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.07□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 YEL076CYEL076C 651 nt11.07□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 ADO1YJR105W 1023 nt11.07□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 YLR464WYLR464W 651 nt11.07□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 YIH1YCR059C 777 nt11.06□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 DIC1YLR348C 897 nt11.04□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 RNQ1YCL028W 1218 nt11.03□□□□□ -0.64
TRM12Q04235 YLR235CYLR235C 399 nt11□□□□□ -0.65
TRM12Q04235 YLL053CYLL053C 459 nt10.99□□□□□ -0.65
TRM12Q04235 YFL054CYFL054C 1941 nt10.97□□□□□ -0.65
TRM12Q04235 YKL030WYKL030W 606 nt10.96□□□□□ -0.65
TRM12Q04235 NVJ2YPR091C 2313 nt10.94□□□□□ -0.66
TRM12Q04235 HUA1YGR268C 597 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM12Q04235 TIM23YNR017W 669 nt10.92□□□□□ -0.66
TRM12Q04235 LYS4YDR234W 2082 nt10.92□□□□□ -0.66
TRM12Q04235 YJL225CYJL225C 5277 nt10.91□□□□□ -0.66
TRM12Q04235 FTR1YER145C 1215 nt10.9□□□□□ -0.66
TRM12Q04235 SPT8YLR055C 1809 nt10.9□□□□□ -0.66
TRM12Q04235 GAL1YBR020W 1587 nt10.88□□□□□ -0.67
TRM12Q04235 ATF2YGR177C 1608 nt10.87□□□□□ -0.67
TRM12Q04235 YLR179CYLR179C 606 nt10.87□□□□□ -0.67
TRM12Q04235 CRR1YLR213C 1269 nt10.86□□□□□ -0.67
TRM12Q04235 TRM5YHR070W 1500 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM12Q04235 ERF2YLR246W 1080 nt10.84□□□□□ -0.67
TRM12Q04235 WSC2YNL283C 1512 nt10.83□□□□□ -0.68
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