Protein–RNA interactions for Protein: Q03579

LIP1, Ceramide synthase subunit LIP1, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LIP1Q03579 PTK1YKL198C 1989 nt7.65□□□□□ -1.18
LIP1Q03579 ALF1YNL148C 765 nt7.61□□□□□ -1.19
LIP1Q03579 FUN26YAL022C 1554 nt7.57□□□□□ -1.2
LIP1Q03579 TIR1YER011W 765 nt7.53□□□□□ -1.2
LIP1Q03579 MCH5YOR306C 1566 nt7.52□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 SIS1YNL007C 1059 nt7.52□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 RRT12YCR045C 1476 nt7.5□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 YER088W-BYER088W-B 147 nt7.49□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 YNL195CYNL195C 786 nt7.48□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 BDH2YAL061W 1254 nt7.47□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 GFD2YCL036W 1701 nt7.47□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 SPT8YLR055C 1809 nt7.46□□□□□ -1.21
LIP1Q03579 ALG12YNR030W 1656 nt7.46□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 YFL054CYFL054C 1941 nt7.45□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 TRM9YML014W 840 nt7.44□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 NCP1YHR042W 2076 nt7.43□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 CCT6YDR188W 1641 nt7.42□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 SUF2tP(AGG)C 72 nt7.42□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 SUF10tP(AGG)N 72 nt7.42□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 CUE1YMR264W 612 nt7.42□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 RTS2YOR077W 699 nt7.42□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 RSB1YOR049C 1065 nt7.41□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 HSP60YLR259C 1719 nt7.41□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 ART5YGR068C 1761 nt7.41□□□□□ -1.22
LIP1Q03579 PET9YBL030C 957 nt7.38□□□□□ -1.23
LIP1Q03579 YIL100WYIL100W 354 nt7.33□□□□□ -1.24
LIP1Q03579 FRE6YLL051C 2139 nt7.31□□□□□ -1.24
LIP1Q03579 ATS1YAL020C 1002 nt7.31□□□□□ -1.24
LIP1Q03579 YCH1YGR203W 447 nt7.3□□□□□ -1.24
LIP1Q03579 LSM3YLR438C-A 270 nt7.28□□□□□ -1.24
LIP1Q03579 SWE1YJL187C 2460 nt7.27□□□□□ -1.24
LIP1Q03579 GLK1YCL040W 1503 nt7.27□□□□□ -1.25
LIP1Q03579 SRB2YHR041C 633 nt7.26□□□□□ -1.25
LIP1Q03579 DSK2YMR276W 1122 nt7.23□□□□□ -1.25
LIP1Q03579 NAR1YNL240C 1476 nt7.21□□□□□ -1.26
LIP1Q03579 YLR236CYLR236C 324 nt7.2□□□□□ -1.26
LIP1Q03579 LCB1YMR296C 1677 nt7.16□□□□□ -1.26
LIP1Q03579 AAC1YMR056C 930 nt7.14□□□□□ -1.27
LIP1Q03579 SSN3YPL042C 1668 nt7.13□□□□□ -1.27
LIP1Q03579 TIR4YOR009W 1464 nt7.13□□□□□ -1.27
LIP1Q03579 YMR057CYMR057C 372 nt7.11□□□□□ -1.27
LIP1Q03579 FUR4YBR021W 1902 nt7.1□□□□□ -1.27
LIP1Q03579 BIO4YNR057C 714 nt7.09□□□□□ -1.27
LIP1Q03579 PRP4YPR178W 1398 nt7.08□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt7.06□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 YEL076CYEL076C 651 nt7.06□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 WWM1YFL010C 636 nt7.06□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 YLR464WYLR464W 651 nt7.06□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 CYT2YKL087C 675 nt7.05□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 BSP1YPR171W 1731 nt7.04□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 DPS1YLL018C 1674 nt7.04□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 LYS4YDR234W 2082 nt7.04□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 CMP2YML057W 1815 nt7.04□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 PBP1YGR178C 2169 nt7.03□□□□□ -1.28
LIP1Q03579 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt7.02□□□□□ -1.29
LIP1Q03579 HSL7YBR133C 2484 nt7.01□□□□□ -1.29
LIP1Q03579 BIO5YNR056C 1686 nt7□□□□□ -1.29
LIP1Q03579 BMT6YLR063W 1098 nt6.99□□□□□ -1.29
LIP1Q03579 GID7YCL039W 2238 nt6.97□□□□□ -1.29
LIP1Q03579 YGR021WYGR021W 873 nt6.97□□□□□ -1.29
LIP1Q03579 UBX6YJL048C 1191 nt6.94□□□□□ -1.3
LIP1Q03579 RDN25-1RDN25-1 3396 nt6.93□□□□□ -1.3
LIP1Q03579 RDN25-2RDN25-2 3396 nt6.93□□□□□ -1.3
LIP1Q03579 SNF1YDR477W 1902 nt6.93□□□□□ -1.3
LIP1Q03579 SIM1YIL123W 1431 nt6.92□□□□□ -1.3
LIP1Q03579 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt6.91□□□□□ -1.3
LIP1Q03579 YKR005CYKR005C 1578 nt6.9□□□□□ -1.31
LIP1Q03579 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt6.87□□□□□ -1.31
LIP1Q03579 DED1YOR204W 1815 nt6.86□□□□□ -1.31
LIP1Q03579 CCA1YER168C 1641 nt6.86□□□□□ -1.31
LIP1Q03579 NDI1YML120C 1542 nt6.86□□□□□ -1.31
LIP1Q03579 IRC24YIR036C 792 nt6.85□□□□□ -1.31
LIP1Q03579 HOM6YJR139C 1080 nt6.83□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 HEL2YDR266C 1920 nt6.82□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 PST2YDR032C 597 nt6.82□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 FMP52YER004W 696 nt6.82□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 WSC2YNL283C 1512 nt6.81□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 NPL3YDR432W 1245 nt6.8□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 MNP1YGL068W 585 nt6.8□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 YJL152WYJL152W 360 nt6.8□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 RAX1YOR301W 1308 nt6.79□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 YGR259CYGR259C 441 nt6.79□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 ERF2YLR246W 1080 nt6.79□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 PCM1YEL058W 1674 nt6.79□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 CRR1YLR213C 1269 nt6.78□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 YAT1YAR035W 2064 nt6.78□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 MET2YNL277W 1461 nt6.78□□□□□ -1.32
LIP1Q03579 ESBP6YNL125C 2022 nt6.77□□□□□ -1.33
LIP1Q03579 RKM5YLR137W 1104 nt6.75□□□□□ -1.33
LIP1Q03579 SPT20YOL148C 1815 nt6.73□□□□□ -1.33
LIP1Q03579 SFP1YLR403W 2052 nt6.72□□□□□ -1.33
LIP1Q03579 NPP1YCR026C 2229 nt6.71□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 RRD1YIL153W 1182 nt6.71□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 SNG1YGR197C 1644 nt6.71□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 ILV2YMR108W 2064 nt6.7□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 YCL074WYCL074W 927 nt6.7□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 HEM12YDR047W 1089 nt6.7□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt6.7□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 YLR281CYLR281C 468 nt6.7□□□□□ -1.34
LIP1Q03579 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms