Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.72□□□□□ -0.69
SKO1Q02100 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.72□□□□□ -0.69
SKO1Q02100 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.7□□□□□ -0.7
SKO1Q02100 YLR281CYLR281C 468 nt10.68□□□□□ -0.7
SKO1Q02100 CCT6YDR188W 1641 nt10.68□□□□□ -0.7
SKO1Q02100 YJL225CYJL225C 5277 nt10.67□□□□□ -0.7
SKO1Q02100 FPS1YLL043W 2010 nt10.65□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 PTP1YDL230W 1008 nt10.64□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 CAC2YML102W 1407 nt10.62□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 YDL221WYDL221W 552 nt10.62□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 SDH1YKL148C 1923 nt10.61□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 WHI5YOR083W 888 nt10.61□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 PUS2YGL063W 1113 nt10.59□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 ALF1YNL148C 765 nt10.59□□□□□ -0.71
SKO1Q02100 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.58□□□□□ -0.72
SKO1Q02100 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.58□□□□□ -0.72
SKO1Q02100 YMR090WYMR090W 684 nt10.58□□□□□ -0.72
SKO1Q02100 PAC11YDR488C 1602 nt10.55□□□□□ -0.72
SKO1Q02100 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.51□□□□□ -0.73
SKO1Q02100 RPP2AYOL039W 321 nt10.5□□□□□ -0.73
SKO1Q02100 IRC15YPL017C 1500 nt10.48□□□□□ -0.73
SKO1Q02100 GUT2YIL155C 1950 nt10.46□□□□□ -0.73
SKO1Q02100 PCH2YBR186W 1695 nt10.46□□□□□ -0.74
SKO1Q02100 SIS1YNL007C 1059 nt10.45□□□□□ -0.74
SKO1Q02100 SCC4YER147C 1875 nt10.44□□□□□ -0.74
SKO1Q02100 PIB2YGL023C 1908 nt10.43□□□□□ -0.74
SKO1Q02100 DSK2YMR276W 1122 nt10.41□□□□□ -0.74
SKO1Q02100 IMP2'YIL154C 1041 nt10.4□□□□□ -0.74
SKO1Q02100 NVJ2YPR091C 2313 nt10.39□□□□□ -0.75
SKO1Q02100 GIS3YLR094C 1509 nt10.38□□□□□ -0.75
SKO1Q02100 YPR011CYPR011C 981 nt10.38□□□□□ -0.75
SKO1Q02100 SEC11YIR022W 504 nt10.37□□□□□ -0.75
SKO1Q02100 YLR236CYLR236C 324 nt10.36□□□□□ -0.75
SKO1Q02100 YJL152WYJL152W 360 nt10.35□□□□□ -0.75
SKO1Q02100 FMP45YDL222C 930 nt10.32□□□□□ -0.76
SKO1Q02100 TIR4YOR009W 1464 nt10.31□□□□□ -0.76
SKO1Q02100 YCH1YGR203W 447 nt10.31□□□□□ -0.76
SKO1Q02100 GFD2YCL036W 1701 nt10.29□□□□□ -0.76
SKO1Q02100 YHL050CYHL050C 2094 nt10.29□□□□□ -0.76
SKO1Q02100 ART5YGR068C 1761 nt10.26□□□□□ -0.77
SKO1Q02100 YSC84YHR016C 1407 nt10.25□□□□□ -0.77
SKO1Q02100 IDH1YNL037C 1083 nt10.25□□□□□ -0.77
SKO1Q02100 PET9YBL030C 957 nt10.23□□□□□ -0.77
SKO1Q02100 ERV46YAL042W 1248 nt10.18□□□□□ -0.78
SKO1Q02100 YMR057CYMR057C 372 nt10.17□□□□□ -0.78
SKO1Q02100 RTS2YOR077W 699 nt10.17□□□□□ -0.78
SKO1Q02100 LPX1YOR084W 1164 nt10.17□□□□□ -0.78
SKO1Q02100 RTF1YGL244W 1677 nt10.15□□□□□ -0.78
SKO1Q02100 GBP2YCL011C 1284 nt10.14□□□□□ -0.79
SKO1Q02100 RRT12YCR045C 1476 nt10.14□□□□□ -0.79
SKO1Q02100 YDR433WYDR433W 441 nt10.12□□□□□ -0.79
SKO1Q02100 PTK1YKL198C 1989 nt10.12□□□□□ -0.79
SKO1Q02100 CUE1YMR264W 612 nt10.11□□□□□ -0.79
SKO1Q02100 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.11□□□□□ -0.79
SKO1Q02100 YKR040CYKR040C 504 nt10.08□□□□□ -0.8
SKO1Q02100 NCP1YHR042W 2076 nt10.04□□□□□ -0.8
SKO1Q02100 MXR2YCL033C 507 nt10.03□□□□□ -0.8
SKO1Q02100 BOP3YNL042W 1191 nt10.02□□□□□ -0.81
SKO1Q02100 SPP1YPL138C 1062 nt10.02□□□□□ -0.81
SKO1Q02100 MRPL8YJL063C 717 nt10.01□□□□□ -0.81
SKO1Q02100 TCD2YKL027W 1344 nt10.01□□□□□ -0.81
SKO1Q02100 RRD1YIL153W 1182 nt9.95□□□□□ -0.82
SKO1Q02100 DED1YOR204W 1815 nt9.94□□□□□ -0.82
SKO1Q02100 RTG1YOL067C 534 nt9.91□□□□□ -0.82
SKO1Q02100 YNL195CYNL195C 786 nt9.9□□□□□ -0.82
SKO1Q02100 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.89□□□□□ -0.83
SKO1Q02100 YEL076CYEL076C 651 nt9.89□□□□□ -0.83
SKO1Q02100 YLR464WYLR464W 651 nt9.89□□□□□ -0.83
SKO1Q02100 YIL100WYIL100W 354 nt9.88□□□□□ -0.83
SKO1Q02100 ADO1YJR105W 1023 nt9.87□□□□□ -0.83
SKO1Q02100 FRD1YEL047C 1413 nt9.87□□□□□ -0.83
SKO1Q02100 FMT1YBL013W 1206 nt9.84□□□□□ -0.83
SKO1Q02100 SOR2YDL246C 1074 nt9.83□□□□□ -0.84
SKO1Q02100 SOR1YJR159W 1074 nt9.83□□□□□ -0.84
SKO1Q02100 FMP52YER004W 696 nt9.81□□□□□ -0.84
SKO1Q02100 YCL042WYCL042W 360 nt9.81□□□□□ -0.84
SKO1Q02100 SPT8YLR055C 1809 nt9.78□□□□□ -0.84
SKO1Q02100 LCB1YMR296C 1677 nt9.77□□□□□ -0.84
SKO1Q02100 YFL054CYFL054C 1941 nt9.75□□□□□ -0.85
SKO1Q02100 HUA1YGR268C 597 nt9.72□□□□□ -0.85
SKO1Q02100 PTH1YHR189W 573 nt9.72□□□□□ -0.85
SKO1Q02100 CWP1YKL096W 720 nt9.72□□□□□ -0.85
SKO1Q02100 UME6YDR207C 2511 nt9.71□□□□□ -0.85
SKO1Q02100 YLR235CYLR235C 399 nt9.71□□□□□ -0.86
SKO1Q02100 RPM1RPM1 483 nt9.7□□□□□ -0.86
SKO1Q02100 ADH2YMR303C 1047 nt9.69□□□□□ -0.86
SKO1Q02100 YKL030WYKL030W 606 nt9.67□□□□□ -0.86
SKO1Q02100 PCM1YEL058W 1674 nt9.65□□□□□ -0.86
SKO1Q02100 LYS4YDR234W 2082 nt9.64□□□□□ -0.87
SKO1Q02100 BOR1YNL275W 1731 nt9.64□□□□□ -0.87
SKO1Q02100 SNF6YHL025W 999 nt9.61□□□□□ -0.87
SKO1Q02100 UBX6YJL048C 1191 nt9.61□□□□□ -0.87
SKO1Q02100 SWE1YJL187C 2460 nt9.59□□□□□ -0.87
SKO1Q02100 DIC1YLR348C 897 nt9.57□□□□□ -0.88
SKO1Q02100 TIM23YNR017W 669 nt9.55□□□□□ -0.88
SKO1Q02100 RNQ1YCL028W 1218 nt9.55□□□□□ -0.88
SKO1Q02100 YIH1YCR059C 777 nt9.54□□□□□ -0.88
SKO1Q02100 YDR094WYDR094W 336 nt9.54□□□□□ -0.88
SKO1Q02100 HSP60YLR259C 1719 nt9.5□□□□□ -0.89
SKO1Q02100 YLR179CYLR179C 606 nt9.48□□□□□ -0.89
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