Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.53■□□□□ 0.08
HEF3P53978 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.53■□□□□ 0.08
HEF3P53978 RPP2AYOL039W 321 nt15.52■□□□□ 0.08
HEF3P53978 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.47■□□□□ 0.07
HEF3P53978 CAC2YML102W 1407 nt15.45■□□□□ 0.06
HEF3P53978 PUS2YGL063W 1113 nt15.44■□□□□ 0.06
HEF3P53978 TIR4YOR009W 1464 nt15.43■□□□□ 0.06
HEF3P53978 ART5YGR068C 1761 nt15.41■□□□□ 0.06
HEF3P53978 YJL152WYJL152W 360 nt15.41■□□□□ 0.06
HEF3P53978 SSA4YER103W 1929 nt15.39■□□□□ 0.05
HEF3P53978 YCH1YGR203W 447 nt15.34■□□□□ 0.05
HEF3P53978 GFD2YCL036W 1701 nt15.34■□□□□ 0.05
HEF3P53978 EMI2YDR516C 1503 nt15.33■□□□□ 0.04
HEF3P53978 YPR011CYPR011C 981 nt15.29■□□□□ 0.04
HEF3P53978 YLR236CYLR236C 324 nt15.27■□□□□ 0.04
HEF3P53978 YMR057CYMR057C 372 nt15.26■□□□□ 0.03
HEF3P53978 RTS2YOR077W 699 nt15.26■□□□□ 0.03
HEF3P53978 YDL221WYDL221W 552 nt15.2■□□□□ 0.02
HEF3P53978 PET9YBL030C 957 nt15.2■□□□□ 0.02
HEF3P53978 IRC15YPL017C 1500 nt15.18■□□□□ 0.02
HEF3P53978 DSK2YMR276W 1122 nt15.18■□□□□ 0.02
HEF3P53978 FMP45YDL222C 930 nt15.09■□□□□ 0.01
HEF3P53978 GIS3YLR094C 1509 nt15.07■□□□□ 0
HEF3P53978 YMR090WYMR090W 684 nt15.06■□□□□ 0
HEF3P53978 IDH1YNL037C 1083 nt15.04■□□□□ -0
HEF3P53978 FPS1YLL043W 2010 nt15.02■□□□□ -0
HEF3P53978 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.02■□□□□ -0
HEF3P53978 YBR220CYBR220C 1683 nt15.02□□□□□ -0.01
HEF3P53978 LPX1YOR084W 1164 nt15□□□□□ -0.01
HEF3P53978 SDH1YKL148C 1923 nt15□□□□□ -0.01
HEF3P53978 IMP2'YIL154C 1041 nt14.99□□□□□ -0.01
HEF3P53978 GBP2YCL011C 1284 nt14.98□□□□□ -0.01
HEF3P53978 YDR433WYDR433W 441 nt14.95□□□□□ -0.02
HEF3P53978 CUE1YMR264W 612 nt14.94□□□□□ -0.02
HEF3P53978 MXR2YCL033C 507 nt14.94□□□□□ -0.02
HEF3P53978 SCC4YER147C 1875 nt14.93□□□□□ -0.02
HEF3P53978 MOT3YMR070W 1473 nt14.91□□□□□ -0.02
HEF3P53978 ERV46YAL042W 1248 nt14.84□□□□□ -0.03
HEF3P53978 RRD1YIL153W 1182 nt14.81□□□□□ -0.04
HEF3P53978 DED1YOR204W 1815 nt14.8□□□□□ -0.04
HEF3P53978 SPP1YPL138C 1062 nt14.79□□□□□ -0.04
HEF3P53978 TCD2YKL027W 1344 nt14.76□□□□□ -0.05
HEF3P53978 BDF1YLR399C 2061 nt14.75□□□□□ -0.05
HEF3P53978 YIL100WYIL100W 354 nt14.74□□□□□ -0.05
HEF3P53978 YKR040CYKR040C 504 nt14.72□□□□□ -0.05
HEF3P53978 FMT1YBL013W 1206 nt14.68□□□□□ -0.06
HEF3P53978 RRT12YCR045C 1476 nt14.64□□□□□ -0.07
HEF3P53978 YSC84YHR016C 1407 nt14.61□□□□□ -0.07
HEF3P53978 FRD1YEL047C 1413 nt14.58□□□□□ -0.08
HEF3P53978 TAT1YBR069C 1860 nt14.55□□□□□ -0.08
HEF3P53978 YHL050CYHL050C 2094 nt14.54□□□□□ -0.08
HEF3P53978 CWP1YKL096W 720 nt14.51□□□□□ -0.09
HEF3P53978 ADH2YMR303C 1047 nt14.5□□□□□ -0.09
HEF3P53978 YNL195CYNL195C 786 nt14.48□□□□□ -0.09
HEF3P53978 YCL042WYCL042W 360 nt14.47□□□□□ -0.09
HEF3P53978 SOR2YDL246C 1074 nt14.45□□□□□ -0.1
HEF3P53978 SOR1YJR159W 1074 nt14.45□□□□□ -0.1
HEF3P53978 FMP52YER004W 696 nt14.43□□□□□ -0.1
HEF3P53978 PTH1YHR189W 573 nt14.43□□□□□ -0.1
HEF3P53978 PCM1YEL058W 1674 nt14.4□□□□□ -0.1
HEF3P53978 RTG1YOL067C 534 nt14.36□□□□□ -0.11
HEF3P53978 PCH2YBR186W 1695 nt14.33□□□□□ -0.11
HEF3P53978 SNF6YHL025W 999 nt14.31□□□□□ -0.12
HEF3P53978 SEC11YIR022W 504 nt14.31□□□□□ -0.12
HEF3P53978 GUT2YIL155C 1950 nt14.26□□□□□ -0.13
HEF3P53978 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.22□□□□□ -0.13
HEF3P53978 YEL076CYEL076C 651 nt14.22□□□□□ -0.13
HEF3P53978 YLR464WYLR464W 651 nt14.22□□□□□ -0.13
HEF3P53978 LCB1YMR296C 1677 nt14.22□□□□□ -0.13
HEF3P53978 SIM1YIL123W 1431 nt14.19□□□□□ -0.14
HEF3P53978 DIC1YLR348C 897 nt14.19□□□□□ -0.14
HEF3P53978 BIO4YNR057C 714 nt14.17□□□□□ -0.14
HEF3P53978 YLR235CYLR235C 399 nt14.15□□□□□ -0.14
HEF3P53978 MRPL8YJL063C 717 nt14.14□□□□□ -0.15
HEF3P53978 YIH1YCR059C 777 nt14.13□□□□□ -0.15
HEF3P53978 YKL030WYKL030W 606 nt14.12□□□□□ -0.15
HEF3P53978 RNQ1YCL028W 1218 nt14.11□□□□□ -0.15
HEF3P53978 PIB2YGL023C 1908 nt14.11□□□□□ -0.15
HEF3P53978 NCP1YHR042W 2076 nt14.08□□□□□ -0.15
HEF3P53978 YLL053CYLL053C 459 nt14.08□□□□□ -0.16
HEF3P53978 TIM23YNR017W 669 nt14.06□□□□□ -0.16
HEF3P53978 RTF1YGL244W 1677 nt14.04□□□□□ -0.16
HEF3P53978 ADO1YJR105W 1023 nt14.03□□□□□ -0.16
HEF3P53978 YLR179CYLR179C 606 nt14.01□□□□□ -0.17
HEF3P53978 HUA1YGR268C 597 nt14□□□□□ -0.17
HEF3P53978 BOP3YNL042W 1191 nt13.99□□□□□ -0.17
HEF3P53978 FTR1YER145C 1215 nt13.95□□□□□ -0.18
HEF3P53978 GAL1YBR020W 1587 nt13.93□□□□□ -0.18
HEF3P53978 TRM5YHR070W 1500 nt13.93□□□□□ -0.18
HEF3P53978 ATF2YGR177C 1608 nt13.91□□□□□ -0.18
HEF3P53978 WSC2YNL283C 1512 nt13.9□□□□□ -0.18
HEF3P53978 LYS4YDR234W 2082 nt13.87□□□□□ -0.19
HEF3P53978 PTK1YKL198C 1989 nt13.87□□□□□ -0.19
HEF3P53978 CRR1YLR213C 1269 nt13.84□□□□□ -0.19
HEF3P53978 ERF2YLR246W 1080 nt13.83□□□□□ -0.2
HEF3P53978 AHT1YHR093W 549 nt13.81□□□□□ -0.2
HEF3P53978 UBX6YJL048C 1191 nt13.81□□□□□ -0.2
HEF3P53978 MIC10YCL057C-A 294 nt13.81□□□□□ -0.2
HEF3P53978 YPR064WYPR064W 420 nt13.8□□□□□ -0.2
HEF3P53978 DDR2YOL052C-A 186 nt13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms