Protein–RNA interactions for Protein: P53904

ALF1, Tubulin-specific chaperone B, yeastyeast

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ALF1P53904 SCC4YER147C 1875 nt13.37□□□□□ -0.27
ALF1P53904 ART5YGR068C 1761 nt13.37□□□□□ -0.27
ALF1P53904 MNP1YGL068W 585 nt13.35□□□□□ -0.27
ALF1P53904 GIS3YLR094C 1509 nt13.33□□□□□ -0.28
ALF1P53904 GFD2YCL036W 1701 nt13.33□□□□□ -0.28
ALF1P53904 RTS2YOR077W 699 nt13.29□□□□□ -0.28
ALF1P53904 RKM5YLR137W 1104 nt13.24□□□□□ -0.29
ALF1P53904 PET9YBL030C 957 nt13.23□□□□□ -0.29
ALF1P53904 YKL097CYKL097C 411 nt13.21□□□□□ -0.29
ALF1P53904 TIR4YOR009W 1464 nt13.17□□□□□ -0.3
ALF1P53904 PCH2YBR186W 1695 nt13.15□□□□□ -0.3
ALF1P53904 SEC11YIR022W 504 nt13.15□□□□□ -0.3
ALF1P53904 YCH1YGR203W 447 nt13.13□□□□□ -0.31
ALF1P53904 YMR057CYMR057C 372 nt13.12□□□□□ -0.31
ALF1P53904 YSC84YHR016C 1407 nt13.12□□□□□ -0.31
ALF1P53904 CUE1YMR264W 612 nt13.09□□□□□ -0.31
ALF1P53904 GUT2YIL155C 1950 nt13.09□□□□□ -0.31
ALF1P53904 YJL152WYJL152W 360 nt13.02□□□□□ -0.33
ALF1P53904 YHL050CYHL050C 2094 nt13□□□□□ -0.33
ALF1P53904 RRT12YCR045C 1476 nt13□□□□□ -0.33
ALF1P53904 NPL3YDR432W 1245 nt12.99□□□□□ -0.33
ALF1P53904 YIL100WYIL100W 354 nt12.99□□□□□ -0.33
ALF1P53904 YNL195CYNL195C 786 nt12.97□□□□□ -0.33
ALF1P53904 FPS1YLL043W 2010 nt12.95□□□□□ -0.34
ALF1P53904 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.94□□□□□ -0.34
ALF1P53904 YLR236CYLR236C 324 nt12.9□□□□□ -0.34
ALF1P53904 PAC11YDR488C 1602 nt12.89□□□□□ -0.35
ALF1P53904 YOL037CYOL037C 354 nt12.89□□□□□ -0.35
ALF1P53904 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.87□□□□□ -0.35
ALF1P53904 PIB2YGL023C 1908 nt12.85□□□□□ -0.35
ALF1P53904 RTF1YGL244W 1677 nt12.83□□□□□ -0.36
ALF1P53904 BOP3YNL042W 1191 nt12.75□□□□□ -0.37
ALF1P53904 YOR139CYOR139C 393 nt12.74□□□□□ -0.37
ALF1P53904 WHI5YOR083W 888 nt12.71□□□□□ -0.37
ALF1P53904 YLR281CYLR281C 468 nt12.64□□□□□ -0.39
ALF1P53904 PTK1YKL198C 1989 nt12.62□□□□□ -0.39
ALF1P53904 IDH1YNL037C 1083 nt12.58□□□□□ -0.4
ALF1P53904 NCP1YHR042W 2076 nt12.58□□□□□ -0.4
ALF1P53904 GBP2YCL011C 1284 nt12.56□□□□□ -0.4
ALF1P53904 RRD1YIL153W 1182 nt12.54□□□□□ -0.4
ALF1P53904 LCB1YMR296C 1677 nt12.5□□□□□ -0.41
ALF1P53904 TCD2YKL027W 1344 nt12.47□□□□□ -0.41
ALF1P53904 DED1YOR204W 1815 nt12.45□□□□□ -0.42
ALF1P53904 YFL054CYFL054C 1941 nt12.45□□□□□ -0.42
ALF1P53904 PUS2YGL063W 1113 nt12.44□□□□□ -0.42
ALF1P53904 FMP52YER004W 696 nt12.41□□□□□ -0.42
ALF1P53904 PCM1YEL058W 1674 nt12.4□□□□□ -0.42
ALF1P53904 SIM1YIL123W 1431 nt12.39□□□□□ -0.43
ALF1P53904 FMT1YBL013W 1206 nt12.38□□□□□ -0.43
ALF1P53904 DSK2YMR276W 1122 nt12.38□□□□□ -0.43
ALF1P53904 YDR433WYDR433W 441 nt12.37□□□□□ -0.43
ALF1P53904 IMP2'YIL154C 1041 nt12.37□□□□□ -0.43
ALF1P53904 Q0182Q0182 405 nt12.36□□□□□ -0.43
ALF1P53904 CWP1YKL096W 720 nt12.34□□□□□ -0.43
ALF1P53904 ADH2YMR303C 1047 nt12.33□□□□□ -0.44
ALF1P53904 MXR2YCL033C 507 nt12.33□□□□□ -0.44
ALF1P53904 SNF6YHL025W 999 nt12.3□□□□□ -0.44
ALF1P53904 SPT8YLR055C 1809 nt12.3□□□□□ -0.44
ALF1P53904 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.29□□□□□ -0.44
ALF1P53904 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.29□□□□□ -0.44
ALF1P53904 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.29□□□□□ -0.44
ALF1P53904 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.29□□□□□ -0.44
ALF1P53904 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.29□□□□□ -0.44
ALF1P53904 YPR011CYPR011C 981 nt12.29□□□□□ -0.44
ALF1P53904 FMP45YDL222C 930 nt12.27□□□□□ -0.45
ALF1P53904 NVJ2YPR091C 2313 nt12.25□□□□□ -0.45
ALF1P53904 BIO4YNR057C 714 nt12.24□□□□□ -0.45
ALF1P53904 YCL042WYCL042W 360 nt12.22□□□□□ -0.45
ALF1P53904 LYS4YDR234W 2082 nt12.22□□□□□ -0.45
ALF1P53904 LPX1YOR084W 1164 nt12.18□□□□□ -0.46
ALF1P53904 SOR2YDL246C 1074 nt12.17□□□□□ -0.46
ALF1P53904 SOR1YJR159W 1074 nt12.17□□□□□ -0.46
ALF1P53904 ERV46YAL042W 1248 nt12.14□□□□□ -0.47
ALF1P53904 YKR040CYKR040C 504 nt12.14□□□□□ -0.47
ALF1P53904 SWE1YJL187C 2460 nt12.1□□□□□ -0.47
ALF1P53904 FRD1YEL047C 1413 nt12.1□□□□□ -0.47
ALF1P53904 YIH1YCR059C 777 nt12.08□□□□□ -0.48
ALF1P53904 ERF2YLR246W 1080 nt12.08□□□□□ -0.48
ALF1P53904 YLL053CYLL053C 459 nt12.07□□□□□ -0.48
ALF1P53904 BOR1YNL275W 1731 nt12.04□□□□□ -0.48
ALF1P53904 RNQ1YCL028W 1218 nt12.04□□□□□ -0.48
ALF1P53904 CRR1YLR213C 1269 nt12.03□□□□□ -0.48
ALF1P53904 ATF2YGR177C 1608 nt11.97□□□□□ -0.49
ALF1P53904 HEM12YDR047W 1089 nt11.97□□□□□ -0.49
ALF1P53904 MIC10YCL057C-A 294 nt11.96□□□□□ -0.49
ALF1P53904 FTR1YER145C 1215 nt11.94□□□□□ -0.5
ALF1P53904 DIC1YLR348C 897 nt11.94□□□□□ -0.5
ALF1P53904 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.93□□□□□ -0.5
ALF1P53904 TRM5YHR070W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
ALF1P53904 YFL067WYFL067W 528 nt11.91□□□□□ -0.5
ALF1P53904 SNG1YGR197C 1644 nt11.9□□□□□ -0.5
ALF1P53904 GAL1YBR020W 1587 nt11.89□□□□□ -0.51
ALF1P53904 DDR2YOL052C-A 186 nt11.89□□□□□ -0.51
ALF1P53904 HSP60YLR259C 1719 nt11.86□□□□□ -0.51
ALF1P53904 RAX1YOR301W 1308 nt11.86□□□□□ -0.51
ALF1P53904 PTH1YHR189W 573 nt11.84□□□□□ -0.51
ALF1P53904 CCA1YER168C 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
ALF1P53904 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.81□□□□□ -0.52
ALF1P53904 SPP1YPL138C 1062 nt11.8□□□□□ -0.52
ALF1P53904 GLK1YCL040W 1503 nt11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms