Protein–RNA interactions for Protein: P53314

CPD1, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1P53314 RKM5YLR137W 1104 nt9.95□□□□□ -0.82
CPD1P53314 MOT3YMR070W 1473 nt9.95□□□□□ -0.82
CPD1P53314 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.93□□□□□ -0.82
CPD1P53314 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.93□□□□□ -0.82
CPD1P53314 SCC4YER147C 1875 nt9.91□□□□□ -0.82
CPD1P53314 PCH2YBR186W 1695 nt9.9□□□□□ -0.82
CPD1P53314 IRC15YPL017C 1500 nt9.87□□□□□ -0.83
CPD1P53314 YOL037CYOL037C 354 nt9.87□□□□□ -0.83
CPD1P53314 GUT2YIL155C 1950 nt9.86□□□□□ -0.83
CPD1P53314 SEC11YIR022W 504 nt9.85□□□□□ -0.83
CPD1P53314 YOR139CYOR139C 393 nt9.85□□□□□ -0.83
CPD1P53314 SIS1YNL007C 1059 nt9.84□□□□□ -0.83
CPD1P53314 GIS3YLR094C 1509 nt9.83□□□□□ -0.84
CPD1P53314 NPL3YDR432W 1245 nt9.82□□□□□ -0.84
CPD1P53314 ART5YGR068C 1761 nt9.75□□□□□ -0.85
CPD1P53314 YSC84YHR016C 1407 nt9.75□□□□□ -0.85
CPD1P53314 GFD2YCL036W 1701 nt9.73□□□□□ -0.85
CPD1P53314 PIB2YGL023C 1908 nt9.72□□□□□ -0.85
CPD1P53314 RTS2YOR077W 699 nt9.71□□□□□ -0.86
CPD1P53314 YHL050CYHL050C 2094 nt9.69□□□□□ -0.86
CPD1P53314 NVJ2YPR091C 2313 nt9.67□□□□□ -0.86
CPD1P53314 YCH1YGR203W 447 nt9.66□□□□□ -0.86
CPD1P53314 PET9YBL030C 957 nt9.64□□□□□ -0.87
CPD1P53314 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.63□□□□□ -0.87
CPD1P53314 RRT12YCR045C 1476 nt9.63□□□□□ -0.87
CPD1P53314 RTF1YGL244W 1677 nt9.63□□□□□ -0.87
CPD1P53314 YLR281CYLR281C 468 nt9.62□□□□□ -0.87
CPD1P53314 TIR4YOR009W 1464 nt9.59□□□□□ -0.87
CPD1P53314 WHI5YOR083W 888 nt9.59□□□□□ -0.87
CPD1P53314 CUE1YMR264W 612 nt9.58□□□□□ -0.88
CPD1P53314 YJL152WYJL152W 360 nt9.54□□□□□ -0.88
CPD1P53314 YNL195CYNL195C 786 nt9.54□□□□□ -0.88
CPD1P53314 BOP3YNL042W 1191 nt9.53□□□□□ -0.88
CPD1P53314 PTK1YKL198C 1989 nt9.51□□□□□ -0.89
CPD1P53314 YJL225CYJL225C 5277 nt9.5□□□□□ -0.89
CPD1P53314 YMR057CYMR057C 372 nt9.5□□□□□ -0.89
CPD1P53314 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.49□□□□□ -0.89
CPD1P53314 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.49□□□□□ -0.89
CPD1P53314 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.49□□□□□ -0.89
CPD1P53314 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.49□□□□□ -0.89
CPD1P53314 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.49□□□□□ -0.89
CPD1P53314 YIL100WYIL100W 354 nt9.49□□□□□ -0.89
CPD1P53314 PUS2YGL063W 1113 nt9.47□□□□□ -0.89
CPD1P53314 IMP2'YIL154C 1041 nt9.47□□□□□ -0.89
CPD1P53314 FPS1YLL043W 2010 nt9.45□□□□□ -0.9
CPD1P53314 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.41□□□□□ -0.9
CPD1P53314 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.4□□□□□ -0.9
CPD1P53314 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.4□□□□□ -0.9
CPD1P53314 DSK2YMR276W 1122 nt9.4□□□□□ -0.9
CPD1P53314 YLR236CYLR236C 324 nt9.39□□□□□ -0.91
CPD1P53314 IDH1YNL037C 1083 nt9.39□□□□□ -0.91
CPD1P53314 NCP1YHR042W 2076 nt9.38□□□□□ -0.91
CPD1P53314 YFL054CYFL054C 1941 nt9.32□□□□□ -0.92
CPD1P53314 GBP2YCL011C 1284 nt9.3□□□□□ -0.92
CPD1P53314 YPR011CYPR011C 981 nt9.28□□□□□ -0.92
CPD1P53314 SPT8YLR055C 1809 nt9.24□□□□□ -0.93
CPD1P53314 TCD2YKL027W 1344 nt9.24□□□□□ -0.93
CPD1P53314 BOR1YNL275W 1731 nt9.23□□□□□ -0.93
CPD1P53314 ERV46YAL042W 1248 nt9.22□□□□□ -0.93
CPD1P53314 LCB1YMR296C 1677 nt9.22□□□□□ -0.93
CPD1P53314 FMP45YDL222C 930 nt9.21□□□□□ -0.94
CPD1P53314 YDR433WYDR433W 441 nt9.21□□□□□ -0.94
CPD1P53314 RRD1YIL153W 1182 nt9.21□□□□□ -0.94
CPD1P53314 FMP52YER004W 696 nt9.18□□□□□ -0.94
CPD1P53314 DED1YOR204W 1815 nt9.17□□□□□ -0.94
CPD1P53314 YKR040CYKR040C 504 nt9.16□□□□□ -0.94
CPD1P53314 LPX1YOR084W 1164 nt9.15□□□□□ -0.94
CPD1P53314 MXR2YCL033C 507 nt9.11□□□□□ -0.95
CPD1P53314 FMT1YBL013W 1206 nt9.08□□□□□ -0.96
CPD1P53314 SOR2YDL246C 1074 nt9.07□□□□□ -0.96
CPD1P53314 SOR1YJR159W 1074 nt9.07□□□□□ -0.96
CPD1P53314 SWE1YJL187C 2460 nt9.05□□□□□ -0.96
CPD1P53314 YCL042WYCL042W 360 nt9.05□□□□□ -0.96
CPD1P53314 LYS4YDR234W 2082 nt9.04□□□□□ -0.96
CPD1P53314 SIM1YIL123W 1431 nt9.04□□□□□ -0.96
CPD1P53314 UME6YDR207C 2511 nt9.03□□□□□ -0.96
CPD1P53314 PCM1YEL058W 1674 nt9.03□□□□□ -0.96
CPD1P53314 FRD1YEL047C 1413 nt9.02□□□□□ -0.97
CPD1P53314 HSP60YLR259C 1719 nt9□□□□□ -0.97
CPD1P53314 CWP1YKL096W 720 nt9□□□□□ -0.97
CPD1P53314 RPM1RPM1 483 nt9□□□□□ -0.97
CPD1P53314 ADH2YMR303C 1047 nt8.99□□□□□ -0.97
CPD1P53314 SNF6YHL025W 999 nt8.98□□□□□ -0.97
CPD1P53314 BIO4YNR057C 714 nt8.91□□□□□ -0.98
CPD1P53314 GLK1YCL040W 1503 nt8.9□□□□□ -0.98
CPD1P53314 YIH1YCR059C 777 nt8.9□□□□□ -0.98
CPD1P53314 SPP1YPL138C 1062 nt8.9□□□□□ -0.98
CPD1P53314 RNQ1YCL028W 1218 nt8.88□□□□□ -0.99
CPD1P53314 ALG12YNR030W 1656 nt8.88□□□□□ -0.99
CPD1P53314 YLR235CYLR235C 399 nt8.85□□□□□ -0.99
CPD1P53314 MCH5YOR306C 1566 nt8.83□□□□□ -1
CPD1P53314 DIC1YLR348C 897 nt8.82□□□□□ -1
CPD1P53314 FUR4YBR021W 1902 nt8.82□□□□□ -1
CPD1P53314 YLL053CYLL053C 459 nt8.8□□□□□ -1
CPD1P53314 ERF2YLR246W 1080 nt8.8□□□□□ -1
CPD1P53314 PTH1YHR189W 573 nt8.79□□□□□ -1
CPD1P53314 CRR1YLR213C 1269 nt8.78□□□□□ -1
CPD1P53314 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.77□□□□□ -1.01
CPD1P53314 MRPL8YJL063C 717 nt8.76□□□□□ -1.01
CPD1P53314 YKL030WYKL030W 606 nt8.76□□□□□ -1.01
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