Protein–RNA interactions for Protein: P53146

USE1, Protein transport protein USE1, yeastyeast

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USE1P53146 GUT2YIL155C 1950 nt12.23□□□□□ -0.45
USE1P53146 PAC11YDR488C 1602 nt12.21□□□□□ -0.46
USE1P53146 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.2□□□□□ -0.46
USE1P53146 SEC11YIR022W 504 nt12.2□□□□□ -0.46
USE1P53146 RTS2YOR077W 699 nt12.18□□□□□ -0.46
USE1P53146 YSC84YHR016C 1407 nt12.13□□□□□ -0.47
USE1P53146 YGR021WYGR021W 873 nt12.13□□□□□ -0.47
USE1P53146 HOM6YJR139C 1080 nt12.13□□□□□ -0.47
USE1P53146 SHU1YHL006C 453 nt12.11□□□□□ -0.47
USE1P53146 PET9YBL030C 957 nt12.1□□□□□ -0.47
USE1P53146 PIB2YGL023C 1908 nt12.09□□□□□ -0.47
USE1P53146 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.09□□□□□ -0.47
USE1P53146 YHL050CYHL050C 2094 nt12.08□□□□□ -0.48
USE1P53146 TIR4YOR009W 1464 nt12.03□□□□□ -0.48
USE1P53146 CUE1YMR264W 612 nt12.02□□□□□ -0.49
USE1P53146 MNP1YGL068W 585 nt12.01□□□□□ -0.49
USE1P53146 RRT12YCR045C 1476 nt12.01□□□□□ -0.49
USE1P53146 YCH1YGR203W 447 nt11.97□□□□□ -0.49
USE1P53146 YMR057CYMR057C 372 nt11.96□□□□□ -0.49
USE1P53146 RKM5YLR137W 1104 nt11.94□□□□□ -0.5
USE1P53146 RTF1YGL244W 1677 nt11.93□□□□□ -0.5
USE1P53146 FPS1YLL043W 2010 nt11.89□□□□□ -0.51
USE1P53146 YIL100WYIL100W 354 nt11.84□□□□□ -0.51
USE1P53146 YNL195CYNL195C 786 nt11.83□□□□□ -0.52
USE1P53146 NPL3YDR432W 1245 nt11.82□□□□□ -0.52
USE1P53146 BOP3YNL042W 1191 nt11.82□□□□□ -0.52
USE1P53146 PTK1YKL198C 1989 nt11.8□□□□□ -0.52
USE1P53146 NVJ2YPR091C 2313 nt11.76□□□□□ -0.53
USE1P53146 YLR236CYLR236C 324 nt11.75□□□□□ -0.53
USE1P53146 NCP1YHR042W 2076 nt11.73□□□□□ -0.53
USE1P53146 YJL152WYJL152W 360 nt11.7□□□□□ -0.54
USE1P53146 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.69□□□□□ -0.54
USE1P53146 YKL097CYKL097C 411 nt11.67□□□□□ -0.54
USE1P53146 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.63□□□□□ -0.55
USE1P53146 LCB1YMR296C 1677 nt11.55□□□□□ -0.56
USE1P53146 YOL037CYOL037C 354 nt11.54□□□□□ -0.56
USE1P53146 YFL054CYFL054C 1941 nt11.51□□□□□ -0.57
USE1P53146 SPT8YLR055C 1809 nt11.46□□□□□ -0.57
USE1P53146 RRD1YIL153W 1182 nt11.46□□□□□ -0.57
USE1P53146 WHI5YOR083W 888 nt11.4□□□□□ -0.58
USE1P53146 YOR139CYOR139C 393 nt11.37□□□□□ -0.59
USE1P53146 DED1YOR204W 1815 nt11.37□□□□□ -0.59
USE1P53146 YLR281CYLR281C 468 nt11.35□□□□□ -0.59
USE1P53146 PCM1YEL058W 1674 nt11.33□□□□□ -0.6
USE1P53146 FMP52YER004W 696 nt11.33□□□□□ -0.6
USE1P53146 LYS4YDR234W 2082 nt11.32□□□□□ -0.6
USE1P53146 FMT1YBL013W 1206 nt11.32□□□□□ -0.6
USE1P53146 GBP2YCL011C 1284 nt11.32□□□□□ -0.6
USE1P53146 SIM1YIL123W 1431 nt11.32□□□□□ -0.6
USE1P53146 IDH1YNL037C 1083 nt11.31□□□□□ -0.6
USE1P53146 SWE1YJL187C 2460 nt11.26□□□□□ -0.61
USE1P53146 TCD2YKL027W 1344 nt11.26□□□□□ -0.61
USE1P53146 BOR1YNL275W 1731 nt11.26□□□□□ -0.61
USE1P53146 ADH2YMR303C 1047 nt11.24□□□□□ -0.61
USE1P53146 BIO4YNR057C 714 nt11.23□□□□□ -0.61
USE1P53146 CWP1YKL096W 720 nt11.2□□□□□ -0.62
USE1P53146 SNF6YHL025W 999 nt11.16□□□□□ -0.62
USE1P53146 MXR2YCL033C 507 nt11.13□□□□□ -0.63
USE1P53146 YPR011CYPR011C 981 nt11.1□□□□□ -0.63
USE1P53146 HSP60YLR259C 1719 nt11.09□□□□□ -0.63
USE1P53146 SOR2YDL246C 1074 nt11.09□□□□□ -0.63
USE1P53146 SOR1YJR159W 1074 nt11.09□□□□□ -0.63
USE1P53146 YDR433WYDR433W 441 nt11.08□□□□□ -0.64
USE1P53146 IMP2'YIL154C 1041 nt11.08□□□□□ -0.64
USE1P53146 DSK2YMR276W 1122 nt11.08□□□□□ -0.64
USE1P53146 PUS2YGL063W 1113 nt11.07□□□□□ -0.64
USE1P53146 CRR1YLR213C 1269 nt11.07□□□□□ -0.64
USE1P53146 FMP45YDL222C 930 nt11.06□□□□□ -0.64
USE1P53146 ERF2YLR246W 1080 nt11.05□□□□□ -0.64
USE1P53146 YIH1YCR059C 777 nt11.04□□□□□ -0.64
USE1P53146 UME6YDR207C 2511 nt11.02□□□□□ -0.64
USE1P53146 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.01□□□□□ -0.65
USE1P53146 YLL053CYLL053C 459 nt11.01□□□□□ -0.65
USE1P53146 YCL042WYCL042W 360 nt10.99□□□□□ -0.65
USE1P53146 MIC10YCL057C-A 294 nt10.99□□□□□ -0.65
USE1P53146 GLK1YCL040W 1503 nt10.98□□□□□ -0.65
USE1P53146 ATF2YGR177C 1608 nt10.98□□□□□ -0.65
USE1P53146 RNQ1YCL028W 1218 nt10.97□□□□□ -0.65
USE1P53146 FRD1YEL047C 1413 nt10.97□□□□□ -0.65
USE1P53146 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.96□□□□□ -0.65
USE1P53146 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.96□□□□□ -0.65
USE1P53146 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.96□□□□□ -0.65
USE1P53146 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.96□□□□□ -0.65
USE1P53146 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.96□□□□□ -0.65
USE1P53146 LPX1YOR084W 1164 nt10.96□□□□□ -0.65
USE1P53146 ERV46YAL042W 1248 nt10.95□□□□□ -0.66
USE1P53146 FUR4YBR021W 1902 nt10.94□□□□□ -0.66
USE1P53146 HEM12YDR047W 1089 nt10.93□□□□□ -0.66
USE1P53146 YJL225CYJL225C 5277 nt10.93□□□□□ -0.66
USE1P53146 SNG1YGR197C 1644 nt10.92□□□□□ -0.66
USE1P53146 CCA1YER168C 1641 nt10.91□□□□□ -0.66
USE1P53146 YKR040CYKR040C 504 nt10.91□□□□□ -0.66
USE1P53146 ALG12YNR030W 1656 nt10.89□□□□□ -0.67
USE1P53146 FTR1YER145C 1215 nt10.89□□□□□ -0.67
USE1P53146 RAX1YOR301W 1308 nt10.88□□□□□ -0.67
USE1P53146 TRM5YHR070W 1500 nt10.85□□□□□ -0.67
USE1P53146 YFL067WYFL067W 528 nt10.85□□□□□ -0.67
USE1P53146 GAL1YBR020W 1587 nt10.85□□□□□ -0.67
USE1P53146 DIC1YLR348C 897 nt10.82□□□□□ -0.68
USE1P53146 MCH5YOR306C 1566 nt10.82□□□□□ -0.68
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