Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 MNP1YGL068W 585 nt10.71□□□□□ -0.69
UFD1P53044 SIS1YNL007C 1059 nt10.71□□□□□ -0.69
UFD1P53044 SDH1YKL148C 1923 nt10.7□□□□□ -0.7
UFD1P53044 CAC2YML102W 1407 nt10.69□□□□□ -0.7
UFD1P53044 RKM5YLR137W 1104 nt10.65□□□□□ -0.7
UFD1P53044 YJL225CYJL225C 5277 nt10.61□□□□□ -0.71
UFD1P53044 NPL3YDR432W 1245 nt10.59□□□□□ -0.71
UFD1P53044 YOR139CYOR139C 393 nt10.57□□□□□ -0.72
UFD1P53044 SCC4YER147C 1875 nt10.56□□□□□ -0.72
UFD1P53044 YOL037CYOL037C 354 nt10.56□□□□□ -0.72
UFD1P53044 SEC11YIR022W 504 nt10.55□□□□□ -0.72
UFD1P53044 IRC15YPL017C 1500 nt10.54□□□□□ -0.72
UFD1P53044 ART5YGR068C 1761 nt10.54□□□□□ -0.72
UFD1P53044 PCH2YBR186W 1695 nt10.53□□□□□ -0.72
UFD1P53044 GFD2YCL036W 1701 nt10.53□□□□□ -0.72
UFD1P53044 PET9YBL030C 957 nt10.48□□□□□ -0.73
UFD1P53044 GUT2YIL155C 1950 nt10.47□□□□□ -0.73
UFD1P53044 GIS3YLR094C 1509 nt10.45□□□□□ -0.74
UFD1P53044 TIR4YOR009W 1464 nt10.44□□□□□ -0.74
UFD1P53044 YCH1YGR203W 447 nt10.44□□□□□ -0.74
UFD1P53044 RTS2YOR077W 699 nt10.4□□□□□ -0.74
UFD1P53044 UME6YDR207C 2511 nt10.37□□□□□ -0.75
UFD1P53044 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.36□□□□□ -0.75
UFD1P53044 YMR057CYMR057C 372 nt10.35□□□□□ -0.75
UFD1P53044 CUE1YMR264W 612 nt10.34□□□□□ -0.75
UFD1P53044 YSC84YHR016C 1407 nt10.33□□□□□ -0.76
UFD1P53044 YJL152WYJL152W 360 nt10.29□□□□□ -0.76
UFD1P53044 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.29□□□□□ -0.76
UFD1P53044 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.29□□□□□ -0.76
UFD1P53044 PIB2YGL023C 1908 nt10.27□□□□□ -0.77
UFD1P53044 YHL050CYHL050C 2094 nt10.26□□□□□ -0.77
UFD1P53044 YLR281CYLR281C 468 nt10.24□□□□□ -0.77
UFD1P53044 RTF1YGL244W 1677 nt10.24□□□□□ -0.77
UFD1P53044 WHI5YOR083W 888 nt10.23□□□□□ -0.77
UFD1P53044 YNL195CYNL195C 786 nt10.22□□□□□ -0.77
UFD1P53044 YIL100WYIL100W 354 nt10.19□□□□□ -0.78
UFD1P53044 YLR236CYLR236C 324 nt10.18□□□□□ -0.78
UFD1P53044 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 BOP3YNL042W 1191 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 RRT12YCR045C 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
UFD1P53044 PUS2YGL063W 1113 nt10.13□□□□□ -0.79
UFD1P53044 IMP2'YIL154C 1041 nt10.13□□□□□ -0.79
UFD1P53044 IDH1YNL037C 1083 nt10.06□□□□□ -0.8
UFD1P53044 PTK1YKL198C 1989 nt10.05□□□□□ -0.8
UFD1P53044 DSK2YMR276W 1122 nt10.04□□□□□ -0.8
UFD1P53044 GBP2YCL011C 1284 nt10.01□□□□□ -0.81
UFD1P53044 RRD1YIL153W 1182 nt10□□□□□ -0.81
UFD1P53044 NCP1YHR042W 2076 nt9.95□□□□□ -0.82
UFD1P53044 DED1YOR204W 1815 nt9.94□□□□□ -0.82
UFD1P53044 YPR011CYPR011C 981 nt9.94□□□□□ -0.82
UFD1P53044 TCD2YKL027W 1344 nt9.93□□□□□ -0.82
UFD1P53044 FMP52YER004W 696 nt9.91□□□□□ -0.82
UFD1P53044 FMP45YDL222C 930 nt9.87□□□□□ -0.83
UFD1P53044 FMT1YBL013W 1206 nt9.87□□□□□ -0.83
UFD1P53044 YFL054CYFL054C 1941 nt9.86□□□□□ -0.83
UFD1P53044 YDR433WYDR433W 441 nt9.86□□□□□ -0.83
UFD1P53044 ERV46YAL042W 1248 nt9.84□□□□□ -0.83
UFD1P53044 BOR1YNL275W 1731 nt9.84□□□□□ -0.83
UFD1P53044 LCB1YMR296C 1677 nt9.83□□□□□ -0.84
UFD1P53044 MXR2YCL033C 507 nt9.83□□□□□ -0.84
UFD1P53044 PCM1YEL058W 1674 nt9.83□□□□□ -0.84
UFD1P53044 MOT3YMR070W 1473 nt9.82□□□□□ -0.84
UFD1P53044 MCH5YOR306C 1566 nt9.82□□□□□ -0.84
UFD1P53044 SPT8YLR055C 1809 nt9.82□□□□□ -0.84
UFD1P53044 LPX1YOR084W 1164 nt9.8□□□□□ -0.84
UFD1P53044 YKR040CYKR040C 504 nt9.78□□□□□ -0.84
UFD1P53044 ADH2YMR303C 1047 nt9.78□□□□□ -0.84
UFD1P53044 SOR2YDL246C 1074 nt9.77□□□□□ -0.85
UFD1P53044 SOR1YJR159W 1074 nt9.77□□□□□ -0.85
UFD1P53044 CWP1YKL096W 720 nt9.77□□□□□ -0.85
UFD1P53044 SIM1YIL123W 1431 nt9.74□□□□□ -0.85
UFD1P53044 SNF6YHL025W 999 nt9.73□□□□□ -0.85
UFD1P53044 YCL042WYCL042W 360 nt9.72□□□□□ -0.85
UFD1P53044 FRD1YEL047C 1413 nt9.71□□□□□ -0.86
UFD1P53044 BIO4YNR057C 714 nt9.69□□□□□ -0.86
UFD1P53044 LYS4YDR234W 2082 nt9.64□□□□□ -0.87
UFD1P53044 YIH1YCR059C 777 nt9.64□□□□□ -0.87
UFD1P53044 SWE1YJL187C 2460 nt9.62□□□□□ -0.87
UFD1P53044 RNQ1YCL028W 1218 nt9.61□□□□□ -0.87
UFD1P53044 YLL053CYLL053C 459 nt9.56□□□□□ -0.88
UFD1P53044 ERF2YLR246W 1080 nt9.56□□□□□ -0.88
UFD1P53044 CRR1YLR213C 1269 nt9.54□□□□□ -0.88
UFD1P53044 RPM1RPM1 483 nt9.54□□□□□ -0.88
UFD1P53044 HSP60YLR259C 1719 nt9.53□□□□□ -0.88
UFD1P53044 MRPL8YJL063C 717 nt9.53□□□□□ -0.88
UFD1P53044 DIC1YLR348C 897 nt9.52□□□□□ -0.89
UFD1P53044 SPP1YPL138C 1062 nt9.52□□□□□ -0.89
UFD1P53044 FTR1YER145C 1215 nt9.49□□□□□ -0.89
UFD1P53044 ATF2YGR177C 1608 nt9.49□□□□□ -0.89
UFD1P53044 YLR235CYLR235C 399 nt9.47□□□□□ -0.89
UFD1P53044 ALG12YNR030W 1656 nt9.47□□□□□ -0.89
UFD1P53044 GAL1YBR020W 1587 nt9.46□□□□□ -0.9
UFD1P53044 YFL067WYFL067W 528 nt9.45□□□□□ -0.9
UFD1P53044 PTH1YHR189W 573 nt9.45□□□□□ -0.9
UFD1P53044 ADO1YJR105W 1023 nt9.45□□□□□ -0.9
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