Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 YLR281CYLR281C 468 nt11.36□□□□□ -0.59
SEH1P53011 MEP2YNL142W 1500 nt11.33□□□□□ -0.6
SEH1P53011 WHI5YOR083W 888 nt11.32□□□□□ -0.6
SEH1P53011 PUS2YGL063W 1113 nt11.3□□□□□ -0.6
SEH1P53011 SIS1YNL007C 1059 nt11.28□□□□□ -0.6
SEH1P53011 BDF1YLR399C 2061 nt11.25□□□□□ -0.61
SEH1P53011 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.25□□□□□ -0.61
SEH1P53011 RPP2AYOL039W 321 nt11.23□□□□□ -0.61
SEH1P53011 PTP1YDL230W 1008 nt11.18□□□□□ -0.62
SEH1P53011 DCW1YKL046C 1350 nt11.15□□□□□ -0.63
SEH1P53011 YJL152WYJL152W 360 nt11.14□□□□□ -0.63
SEH1P53011 IMP2'YIL154C 1041 nt11.1□□□□□ -0.63
SEH1P53011 TIR4YOR009W 1464 nt11.1□□□□□ -0.63
SEH1P53011 ART5YGR068C 1761 nt11.1□□□□□ -0.63
SEH1P53011 DSK2YMR276W 1122 nt11.08□□□□□ -0.64
SEH1P53011 CAC2YML102W 1407 nt11.07□□□□□ -0.64
SEH1P53011 YCH1YGR203W 447 nt11.05□□□□□ -0.64
SEH1P53011 PET9YBL030C 957 nt11.05□□□□□ -0.64
SEH1P53011 TAT1YBR069C 1860 nt11.04□□□□□ -0.64
SEH1P53011 MOT3YMR070W 1473 nt11.04□□□□□ -0.64
SEH1P53011 GFD2YCL036W 1701 nt11.04□□□□□ -0.64
SEH1P53011 YPR011CYPR011C 981 nt11.03□□□□□ -0.64
SEH1P53011 YLR236CYLR236C 324 nt11.02□□□□□ -0.65
SEH1P53011 EMI2YDR516C 1503 nt11.02□□□□□ -0.65
SEH1P53011 FMP45YDL222C 930 nt11□□□□□ -0.65
SEH1P53011 YMR057CYMR057C 372 nt10.99□□□□□ -0.65
SEH1P53011 IDH1YNL037C 1083 nt10.96□□□□□ -0.65
SEH1P53011 YDL221WYDL221W 552 nt10.95□□□□□ -0.66
SEH1P53011 YMR090WYMR090W 684 nt10.95□□□□□ -0.66
SEH1P53011 Q0182Q0182 405 nt10.94□□□□□ -0.66
SEH1P53011 IRC15YPL017C 1500 nt10.9□□□□□ -0.66
SEH1P53011 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.9□□□□□ -0.66
SEH1P53011 RTS2YOR077W 699 nt10.88□□□□□ -0.67
SEH1P53011 GBP2YCL011C 1284 nt10.87□□□□□ -0.67
SEH1P53011 LPX1YOR084W 1164 nt10.84□□□□□ -0.67
SEH1P53011 YDR433WYDR433W 441 nt10.83□□□□□ -0.68
SEH1P53011 ERV46YAL042W 1248 nt10.83□□□□□ -0.68
SEH1P53011 GIS3YLR094C 1509 nt10.83□□□□□ -0.68
SEH1P53011 SDH1YKL148C 1923 nt10.8□□□□□ -0.68
SEH1P53011 CUE1YMR264W 612 nt10.79□□□□□ -0.68
SEH1P53011 YBR220CYBR220C 1683 nt10.79□□□□□ -0.68
SEH1P53011 YKR040CYKR040C 504 nt10.76□□□□□ -0.69
SEH1P53011 SCC4YER147C 1875 nt10.75□□□□□ -0.69
SEH1P53011 UME6YDR207C 2511 nt10.75□□□□□ -0.69
SEH1P53011 MXR2YCL033C 507 nt10.74□□□□□ -0.69
SEH1P53011 TCD2YKL027W 1344 nt10.74□□□□□ -0.69
SEH1P53011 MRPL8YJL063C 717 nt10.72□□□□□ -0.69
SEH1P53011 RRD1YIL153W 1182 nt10.69□□□□□ -0.7
SEH1P53011 DED1YOR204W 1815 nt10.68□□□□□ -0.7
SEH1P53011 YIL100WYIL100W 354 nt10.67□□□□□ -0.7
SEH1P53011 SPP1YPL138C 1062 nt10.65□□□□□ -0.7
SEH1P53011 ADO1YJR105W 1023 nt10.6□□□□□ -0.71
SEH1P53011 FMT1YBL013W 1206 nt10.57□□□□□ -0.72
SEH1P53011 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.56□□□□□ -0.72
SEH1P53011 YEL076CYEL076C 651 nt10.56□□□□□ -0.72
SEH1P53011 YLR464WYLR464W 651 nt10.56□□□□□ -0.72
SEH1P53011 FRD1YEL047C 1413 nt10.56□□□□□ -0.72
SEH1P53011 FMP52YER004W 696 nt10.54□□□□□ -0.72
SEH1P53011 YCL042WYCL042W 360 nt10.53□□□□□ -0.72
SEH1P53011 RTG1YOL067C 534 nt10.52□□□□□ -0.73
SEH1P53011 SOR2YDL246C 1074 nt10.51□□□□□ -0.73
SEH1P53011 SOR1YJR159W 1074 nt10.51□□□□□ -0.73
SEH1P53011 YNL195CYNL195C 786 nt10.51□□□□□ -0.73
SEH1P53011 RRT12YCR045C 1476 nt10.47□□□□□ -0.73
SEH1P53011 CWP1YKL096W 720 nt10.46□□□□□ -0.73
SEH1P53011 YSC84YHR016C 1407 nt10.46□□□□□ -0.74
SEH1P53011 YJL225CYJL225C 5277 nt10.45□□□□□ -0.74
SEH1P53011 ADH2YMR303C 1047 nt10.44□□□□□ -0.74
SEH1P53011 YHL050CYHL050C 2094 nt10.43□□□□□ -0.74
SEH1P53011 PCM1YEL058W 1674 nt10.41□□□□□ -0.74
SEH1P53011 HUA1YGR268C 597 nt10.39□□□□□ -0.75
SEH1P53011 PTH1YHR189W 573 nt10.39□□□□□ -0.75
SEH1P53011 SEC11YIR022W 504 nt10.38□□□□□ -0.75
SEH1P53011 SNF6YHL025W 999 nt10.37□□□□□ -0.75
SEH1P53011 YLR235CYLR235C 399 nt10.35□□□□□ -0.75
SEH1P53011 GUT2YIL155C 1950 nt10.32□□□□□ -0.76
SEH1P53011 YKL030WYKL030W 606 nt10.3□□□□□ -0.76
SEH1P53011 PCH2YBR186W 1695 nt10.3□□□□□ -0.76
SEH1P53011 UBX6YJL048C 1191 nt10.28□□□□□ -0.76
SEH1P53011 DIC1YLR348C 897 nt10.27□□□□□ -0.77
SEH1P53011 LCB1YMR296C 1677 nt10.26□□□□□ -0.77
SEH1P53011 YIH1YCR059C 777 nt10.26□□□□□ -0.77
SEH1P53011 RNQ1YCL028W 1218 nt10.26□□□□□ -0.77
SEH1P53011 SIM1YIL123W 1431 nt10.24□□□□□ -0.77
SEH1P53011 TIM23YNR017W 669 nt10.22□□□□□ -0.77
SEH1P53011 BIO4YNR057C 714 nt10.21□□□□□ -0.77
SEH1P53011 YDR094WYDR094W 336 nt10.19□□□□□ -0.78
SEH1P53011 YLL053CYLL053C 459 nt10.17□□□□□ -0.78
SEH1P53011 YLR179CYLR179C 606 nt10.17□□□□□ -0.78
SEH1P53011 NCP1YHR042W 2076 nt10.15□□□□□ -0.78
SEH1P53011 MCH5YOR306C 1566 nt10.12□□□□□ -0.79
SEH1P53011 FTR1YER145C 1215 nt10.11□□□□□ -0.79
SEH1P53011 RTF1YGL244W 1677 nt10.1□□□□□ -0.79
SEH1P53011 PIB2YGL023C 1908 nt10.1□□□□□ -0.79
SEH1P53011 BOP3YNL042W 1191 nt10.1□□□□□ -0.79
SEH1P53011 YPR064WYPR064W 420 nt10.1□□□□□ -0.79
SEH1P53011 GAL1YBR020W 1587 nt10.08□□□□□ -0.8
SEH1P53011 WSC2YNL283C 1512 nt10.07□□□□□ -0.8
SEH1P53011 AHT1YHR093W 549 nt10.06□□□□□ -0.8
SEH1P53011 AQY1YPR192W 918 nt10.06□□□□□ -0.8
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