Protein–RNA interactions for Protein: P43607

RRT5, Regulator of rDNA transcription protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT5P43607 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.62□□□□□ -0.39
RRT5P43607 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.62□□□□□ -0.39
RRT5P43607 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.62□□□□□ -0.39
RRT5P43607 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.62□□□□□ -0.39
RRT5P43607 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.62□□□□□ -0.39
RRT5P43607 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.62□□□□□ -0.39
RRT5P43607 TIR4YOR009W 1464 nt12.58□□□□□ -0.4
RRT5P43607 ART5YGR068C 1761 nt12.57□□□□□ -0.4
RRT5P43607 EMI2YDR516C 1503 nt12.57□□□□□ -0.4
RRT5P43607 PUS2YGL063W 1113 nt12.54□□□□□ -0.4
RRT5P43607 GFD2YCL036W 1701 nt12.53□□□□□ -0.4
RRT5P43607 YCH1YGR203W 447 nt12.5□□□□□ -0.41
RRT5P43607 YJL152WYJL152W 360 nt12.5□□□□□ -0.41
RRT5P43607 PET9YBL030C 957 nt12.48□□□□□ -0.41
RRT5P43607 YDL221WYDL221W 552 nt12.47□□□□□ -0.41
RRT5P43607 IRC15YPL017C 1500 nt12.43□□□□□ -0.42
RRT5P43607 YMR057CYMR057C 372 nt12.42□□□□□ -0.42
RRT5P43607 YMR090WYMR090W 684 nt12.4□□□□□ -0.42
RRT5P43607 YPR011CYPR011C 981 nt12.4□□□□□ -0.42
RRT5P43607 RTS2YOR077W 699 nt12.39□□□□□ -0.43
RRT5P43607 YLR236CYLR236C 324 nt12.37□□□□□ -0.43
RRT5P43607 DSK2YMR276W 1122 nt12.36□□□□□ -0.43
RRT5P43607 YBR220CYBR220C 1683 nt12.34□□□□□ -0.43
RRT5P43607 GIS3YLR094C 1509 nt12.32□□□□□ -0.44
RRT5P43607 SDH1YKL148C 1923 nt12.31□□□□□ -0.44
RRT5P43607 IMP2'YIL154C 1041 nt12.3□□□□□ -0.44
RRT5P43607 FPS1YLL043W 2010 nt12.27□□□□□ -0.44
RRT5P43607 IDH1YNL037C 1083 nt12.27□□□□□ -0.45
RRT5P43607 CUE1YMR264W 612 nt12.25□□□□□ -0.45
RRT5P43607 SCC4YER147C 1875 nt12.24□□□□□ -0.45
RRT5P43607 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.24□□□□□ -0.45
RRT5P43607 FMP45YDL222C 930 nt12.23□□□□□ -0.45
RRT5P43607 GBP2YCL011C 1284 nt12.19□□□□□ -0.46
RRT5P43607 BDF1YLR399C 2061 nt12.16□□□□□ -0.46
RRT5P43607 LPX1YOR084W 1164 nt12.16□□□□□ -0.46
RRT5P43607 YDR433WYDR433W 441 nt12.12□□□□□ -0.47
RRT5P43607 ERV46YAL042W 1248 nt12.12□□□□□ -0.47
RRT5P43607 MOT3YMR070W 1473 nt12.09□□□□□ -0.47
RRT5P43607 RRD1YIL153W 1182 nt12.09□□□□□ -0.47
RRT5P43607 MXR2YCL033C 507 nt12.09□□□□□ -0.47
RRT5P43607 YIL100WYIL100W 354 nt12.06□□□□□ -0.48
RRT5P43607 DED1YOR204W 1815 nt12.06□□□□□ -0.48
RRT5P43607 TCD2YKL027W 1344 nt12.04□□□□□ -0.48
RRT5P43607 YKR040CYKR040C 504 nt12.02□□□□□ -0.49
RRT5P43607 TAT1YBR069C 1860 nt12.01□□□□□ -0.49
RRT5P43607 FMT1YBL013W 1206 nt11.97□□□□□ -0.49
RRT5P43607 RRT12YCR045C 1476 nt11.95□□□□□ -0.5
RRT5P43607 YSC84YHR016C 1407 nt11.95□□□□□ -0.5
RRT5P43607 SPP1YPL138C 1062 nt11.95□□□□□ -0.5
RRT5P43607 YHL050CYHL050C 2094 nt11.91□□□□□ -0.5
RRT5P43607 YNL195CYNL195C 786 nt11.88□□□□□ -0.51
RRT5P43607 FRD1YEL047C 1413 nt11.87□□□□□ -0.51
RRT5P43607 FMP52YER004W 696 nt11.86□□□□□ -0.51
RRT5P43607 SOR2YDL246C 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
RRT5P43607 SOR1YJR159W 1074 nt11.84□□□□□ -0.51
RRT5P43607 SEC11YIR022W 504 nt11.83□□□□□ -0.52
RRT5P43607 CWP1YKL096W 720 nt11.8□□□□□ -0.52
RRT5P43607 ADH2YMR303C 1047 nt11.8□□□□□ -0.52
RRT5P43607 PCH2YBR186W 1695 nt11.8□□□□□ -0.52
RRT5P43607 YCL042WYCL042W 360 nt11.79□□□□□ -0.52
RRT5P43607 PCM1YEL058W 1674 nt11.76□□□□□ -0.53
RRT5P43607 GUT2YIL155C 1950 nt11.74□□□□□ -0.53
RRT5P43607 SNF6YHL025W 999 nt11.68□□□□□ -0.54
RRT5P43607 PTH1YHR189W 573 nt11.67□□□□□ -0.54
RRT5P43607 RTG1YOL067C 534 nt11.67□□□□□ -0.54
RRT5P43607 LCB1YMR296C 1677 nt11.62□□□□□ -0.55
RRT5P43607 PIB2YGL023C 1908 nt11.6□□□□□ -0.55
RRT5P43607 YIH1YCR059C 777 nt11.59□□□□□ -0.55
RRT5P43607 BIO4YNR057C 714 nt11.58□□□□□ -0.56
RRT5P43607 SIM1YIL123W 1431 nt11.58□□□□□ -0.56
RRT5P43607 NCP1YHR042W 2076 nt11.58□□□□□ -0.56
RRT5P43607 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.56□□□□□ -0.56
RRT5P43607 YEL076CYEL076C 651 nt11.56□□□□□ -0.56
RRT5P43607 MRPL8YJL063C 717 nt11.56□□□□□ -0.56
RRT5P43607 YLR235CYLR235C 399 nt11.56□□□□□ -0.56
RRT5P43607 DIC1YLR348C 897 nt11.56□□□□□ -0.56
RRT5P43607 YLR464WYLR464W 651 nt11.56□□□□□ -0.56
RRT5P43607 RNQ1YCL028W 1218 nt11.56□□□□□ -0.56
RRT5P43607 RTF1YGL244W 1677 nt11.55□□□□□ -0.56
RRT5P43607 BOP3YNL042W 1191 nt11.52□□□□□ -0.57
RRT5P43607 YKL030WYKL030W 606 nt11.51□□□□□ -0.57
RRT5P43607 YLL053CYLL053C 459 nt11.5□□□□□ -0.57
RRT5P43607 TIM23YNR017W 669 nt11.46□□□□□ -0.57
RRT5P43607 ADO1YJR105W 1023 nt11.44□□□□□ -0.58
RRT5P43607 PTK1YKL198C 1989 nt11.41□□□□□ -0.58
RRT5P43607 FTR1YER145C 1215 nt11.4□□□□□ -0.58
RRT5P43607 YLR179CYLR179C 606 nt11.4□□□□□ -0.58
RRT5P43607 HUA1YGR268C 597 nt11.38□□□□□ -0.59
RRT5P43607 GAL1YBR020W 1587 nt11.37□□□□□ -0.59
RRT5P43607 LYS4YDR234W 2082 nt11.37□□□□□ -0.59
RRT5P43607 ATF2YGR177C 1608 nt11.36□□□□□ -0.59
RRT5P43607 ERF2YLR246W 1080 nt11.36□□□□□ -0.59
RRT5P43607 TRM5YHR070W 1500 nt11.35□□□□□ -0.59
RRT5P43607 CRR1YLR213C 1269 nt11.34□□□□□ -0.59
RRT5P43607 WSC2YNL283C 1512 nt11.34□□□□□ -0.59
RRT5P43607 AHT1YHR093W 549 nt11.31□□□□□ -0.6
RRT5P43607 AQY1YPR192W 918 nt11.29□□□□□ -0.6
RRT5P43607 YPR064WYPR064W 420 nt11.27□□□□□ -0.61
RRT5P43607 YFL067WYFL067W 528 nt11.26□□□□□ -0.61
RRT5P43607 DDR2YOL052C-A 186 nt11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms