Protein–RNA interactions for Protein: P40967

PMEL, Melanocyte protein PMEL, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMELP40967 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMELP40967 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMELP40967 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMELP40967 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMELP40967 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMELP40967 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMELP40967 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PMELP40967 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMELP40967 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMELP40967 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMELP40967 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMELP40967 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMELP40967 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMELP40967 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMELP40967 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMELP40967 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMELP40967 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMELP40967 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMELP40967 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMELP40967 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMELP40967 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMELP40967 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMELP40967 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMELP40967 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMELP40967 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMELP40967 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMELP40967 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMELP40967 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMELP40967 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMELP40967 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMELP40967 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMELP40967 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMELP40967 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMELP40967 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMELP40967 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PMELP40967 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMELP40967 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMELP40967 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMELP40967 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMELP40967 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMELP40967 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMELP40967 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMELP40967 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMELP40967 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PMELP40967 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMELP40967 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMELP40967 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMELP40967 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMELP40967 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMELP40967 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMELP40967 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMELP40967 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMELP40967 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMELP40967 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMELP40967 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMELP40967 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMELP40967 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMELP40967 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMELP40967 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMELP40967 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMELP40967 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMELP40967 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMELP40967 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMELP40967 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMELP40967 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMELP40967 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMELP40967 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMELP40967 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMELP40967 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMELP40967 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMELP40967 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMELP40967 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PMELP40967 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMELP40967 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMELP40967 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMELP40967 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMELP40967 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMELP40967 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMELP40967 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMELP40967 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMELP40967 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMELP40967 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMELP40967 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMELP40967 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMELP40967 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMELP40967 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMELP40967 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMELP40967 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMELP40967 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMELP40967 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMELP40967 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMELP40967 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMELP40967 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMELP40967 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMELP40967 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMELP40967 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMELP40967 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMELP40967 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMELP40967 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMELP40967 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms