Protein–RNA interactions for Protein: P40505

SDS3, Transcriptional regulatory protein SDS3, yeastyeast

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Length 327 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDS3P40505 ART5YGR068C 1761 nt13.21□□□□□ -0.29
SDS3P40505 YDL221WYDL221W 552 nt13.17□□□□□ -0.3
SDS3P40505 GFD2YCL036W 1701 nt13.15□□□□□ -0.3
SDS3P40505 YJL152WYJL152W 360 nt13.14□□□□□ -0.31
SDS3P40505 TIR4YOR009W 1464 nt13.14□□□□□ -0.31
SDS3P40505 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.13□□□□□ -0.31
SDS3P40505 PET9YBL030C 957 nt13.09□□□□□ -0.31
SDS3P40505 RTS2YOR077W 699 nt13.09□□□□□ -0.31
SDS3P40505 WHI5YOR083W 888 nt13.06□□□□□ -0.32
SDS3P40505 IRC15YPL017C 1500 nt13.06□□□□□ -0.32
SDS3P40505 YBR220CYBR220C 1683 nt13.05□□□□□ -0.32
SDS3P40505 YCH1YGR203W 447 nt13.04□□□□□ -0.32
SDS3P40505 YLR281CYLR281C 468 nt13.04□□□□□ -0.32
SDS3P40505 YMR057CYMR057C 372 nt13.04□□□□□ -0.32
SDS3P40505 SDH1YKL148C 1923 nt13.03□□□□□ -0.32
SDS3P40505 GIS3YLR094C 1509 nt12.99□□□□□ -0.33
SDS3P40505 SCC4YER147C 1875 nt12.96□□□□□ -0.33
SDS3P40505 PUS2YGL063W 1113 nt12.94□□□□□ -0.34
SDS3P40505 BDF1YLR399C 2061 nt12.92□□□□□ -0.34
SDS3P40505 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.9□□□□□ -0.34
SDS3P40505 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SDS3P40505 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SDS3P40505 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SDS3P40505 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SDS3P40505 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.89□□□□□ -0.35
SDS3P40505 CUE1YMR264W 612 nt12.87□□□□□ -0.35
SDS3P40505 FPS1YLL043W 2010 nt12.82□□□□□ -0.36
SDS3P40505 IDH1YNL037C 1083 nt12.81□□□□□ -0.36
SDS3P40505 YIL100WYIL100W 354 nt12.78□□□□□ -0.36
SDS3P40505 DSK2YMR276W 1122 nt12.78□□□□□ -0.36
SDS3P40505 YLR236CYLR236C 324 nt12.76□□□□□ -0.37
SDS3P40505 TAT1YBR069C 1860 nt12.75□□□□□ -0.37
SDS3P40505 GBP2YCL011C 1284 nt12.74□□□□□ -0.37
SDS3P40505 IMP2'YIL154C 1041 nt12.73□□□□□ -0.37
SDS3P40505 PAC11YDR488C 1602 nt12.71□□□□□ -0.37
SDS3P40505 YPR011CYPR011C 981 nt12.69□□□□□ -0.38
SDS3P40505 NVJ2YPR091C 2313 nt12.69□□□□□ -0.38
SDS3P40505 YSC84YHR016C 1407 nt12.67□□□□□ -0.38
SDS3P40505 YNL195CYNL195C 786 nt12.66□□□□□ -0.38
SDS3P40505 YDR433WYDR433W 441 nt12.65□□□□□ -0.38
SDS3P40505 RRT12YCR045C 1476 nt12.62□□□□□ -0.39
SDS3P40505 FMP45YDL222C 930 nt12.62□□□□□ -0.39
SDS3P40505 TCD2YKL027W 1344 nt12.6□□□□□ -0.39
SDS3P40505 SEC11YIR022W 504 nt12.59□□□□□ -0.39
SDS3P40505 YHL050CYHL050C 2094 nt12.57□□□□□ -0.4
SDS3P40505 RRD1YIL153W 1182 nt12.56□□□□□ -0.4
SDS3P40505 MXR2YCL033C 507 nt12.56□□□□□ -0.4
SDS3P40505 LPX1YOR084W 1164 nt12.55□□□□□ -0.4
SDS3P40505 PCH2YBR186W 1695 nt12.54□□□□□ -0.4
SDS3P40505 DED1YOR204W 1815 nt12.51□□□□□ -0.41
SDS3P40505 ERV46YAL042W 1248 nt12.48□□□□□ -0.41
SDS3P40505 GUT2YIL155C 1950 nt12.45□□□□□ -0.42
SDS3P40505 YKR040CYKR040C 504 nt12.43□□□□□ -0.42
SDS3P40505 FMT1YBL013W 1206 nt12.41□□□□□ -0.42
SDS3P40505 FMP52YER004W 696 nt12.39□□□□□ -0.43
SDS3P40505 MOT3YMR070W 1473 nt12.38□□□□□ -0.43
SDS3P40505 CWP1YKL096W 720 nt12.37□□□□□ -0.43
SDS3P40505 YCL042WYCL042W 360 nt12.36□□□□□ -0.43
SDS3P40505 ADH2YMR303C 1047 nt12.33□□□□□ -0.44
SDS3P40505 PCM1YEL058W 1674 nt12.32□□□□□ -0.44
SDS3P40505 FRD1YEL047C 1413 nt12.28□□□□□ -0.44
SDS3P40505 RTF1YGL244W 1677 nt12.27□□□□□ -0.45
SDS3P40505 SOR2YDL246C 1074 nt12.27□□□□□ -0.45
SDS3P40505 SNF6YHL025W 999 nt12.27□□□□□ -0.45
SDS3P40505 SOR1YJR159W 1074 nt12.27□□□□□ -0.45
SDS3P40505 SPP1YPL138C 1062 nt12.26□□□□□ -0.45
SDS3P40505 BOP3YNL042W 1191 nt12.25□□□□□ -0.45
SDS3P40505 SIM1YIL123W 1431 nt12.22□□□□□ -0.45
SDS3P40505 PIB2YGL023C 1908 nt12.22□□□□□ -0.45
SDS3P40505 LCB1YMR296C 1677 nt12.22□□□□□ -0.45
SDS3P40505 MRPL8YJL063C 717 nt12.19□□□□□ -0.46
SDS3P40505 NCP1YHR042W 2076 nt12.14□□□□□ -0.47
SDS3P40505 PTH1YHR189W 573 nt12.13□□□□□ -0.47
SDS3P40505 BIO4YNR057C 714 nt12.13□□□□□ -0.47
SDS3P40505 DIC1YLR348C 897 nt12.06□□□□□ -0.48
SDS3P40505 YIH1YCR059C 777 nt12.05□□□□□ -0.48
SDS3P40505 RNQ1YCL028W 1218 nt12.05□□□□□ -0.48
SDS3P40505 PTK1YKL198C 1989 nt12.05□□□□□ -0.48
SDS3P40505 YLL053CYLL053C 459 nt12.02□□□□□ -0.49
SDS3P40505 YLR235CYLR235C 399 nt12□□□□□ -0.49
SDS3P40505 ERF2YLR246W 1080 nt11.94□□□□□ -0.5
SDS3P40505 ADO1YJR105W 1023 nt11.93□□□□□ -0.5
SDS3P40505 YFL054CYFL054C 1941 nt11.93□□□□□ -0.5
SDS3P40505 LYS4YDR234W 2082 nt11.92□□□□□ -0.5
SDS3P40505 TIM23YNR017W 669 nt11.92□□□□□ -0.5
SDS3P40505 FTR1YER145C 1215 nt11.91□□□□□ -0.5
SDS3P40505 YKL030WYKL030W 606 nt11.91□□□□□ -0.5
SDS3P40505 YLR179CYLR179C 606 nt11.9□□□□□ -0.5
SDS3P40505 TRM5YHR070W 1500 nt11.89□□□□□ -0.51
SDS3P40505 GAL1YBR020W 1587 nt11.88□□□□□ -0.51
SDS3P40505 UBX6YJL048C 1191 nt11.88□□□□□ -0.51
SDS3P40505 CRR1YLR213C 1269 nt11.88□□□□□ -0.51
SDS3P40505 ATF2YGR177C 1608 nt11.88□□□□□ -0.51
SDS3P40505 RTG1YOL067C 534 nt11.87□□□□□ -0.51
SDS3P40505 DDR2YOL052C-A 186 nt11.84□□□□□ -0.51
SDS3P40505 YFL067WYFL067W 528 nt11.82□□□□□ -0.52
SDS3P40505 HEM12YDR047W 1089 nt11.81□□□□□ -0.52
SDS3P40505 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.8□□□□□ -0.52
SDS3P40505 YEL076CYEL076C 651 nt11.8□□□□□ -0.52
SDS3P40505 YLR464WYLR464W 651 nt11.8□□□□□ -0.52
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