Protein–RNA interactions for Protein: P40479

SDP1, Dual-specificity protein phosphatase SDP1, yeastyeast

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDP1P40479 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.15□□□□□ -0.62
SDP1P40479 IRC15YPL017C 1500 nt11.07□□□□□ -0.64
SDP1P40479 MNP1YGL068W 585 nt11.05□□□□□ -0.64
SDP1P40479 YKL097CYKL097C 411 nt11.05□□□□□ -0.64
SDP1P40479 SCC4YER147C 1875 nt11.04□□□□□ -0.64
SDP1P40479 RKM5YLR137W 1104 nt11.04□□□□□ -0.64
SDP1P40479 GFD2YCL036W 1701 nt11.03□□□□□ -0.64
SDP1P40479 ART5YGR068C 1761 nt11.03□□□□□ -0.64
SDP1P40479 PET9YBL030C 957 nt11□□□□□ -0.65
SDP1P40479 GIS3YLR094C 1509 nt10.99□□□□□ -0.65
SDP1P40479 YCH1YGR203W 447 nt10.97□□□□□ -0.65
SDP1P40479 SEC11YIR022W 504 nt10.93□□□□□ -0.66
SDP1P40479 YJL225CYJL225C 5277 nt10.92□□□□□ -0.66
SDP1P40479 TIR4YOR009W 1464 nt10.89□□□□□ -0.67
SDP1P40479 RTS2YOR077W 699 nt10.89□□□□□ -0.67
SDP1P40479 PCH2YBR186W 1695 nt10.87□□□□□ -0.67
SDP1P40479 CUE1YMR264W 612 nt10.86□□□□□ -0.67
SDP1P40479 NPL3YDR432W 1245 nt10.82□□□□□ -0.68
SDP1P40479 YOL037CYOL037C 354 nt10.82□□□□□ -0.68
SDP1P40479 GUT2YIL155C 1950 nt10.82□□□□□ -0.68
SDP1P40479 YMR057CYMR057C 372 nt10.8□□□□□ -0.68
SDP1P40479 YSC84YHR016C 1407 nt10.79□□□□□ -0.68
SDP1P40479 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.76□□□□□ -0.69
SDP1P40479 FPS1YLL043W 2010 nt10.74□□□□□ -0.69
SDP1P40479 YHL050CYHL050C 2094 nt10.74□□□□□ -0.69
SDP1P40479 YIL100WYIL100W 354 nt10.72□□□□□ -0.69
SDP1P40479 YJL152WYJL152W 360 nt10.7□□□□□ -0.7
SDP1P40479 YLR236CYLR236C 324 nt10.69□□□□□ -0.7
SDP1P40479 YNL195CYNL195C 786 nt10.69□□□□□ -0.7
SDP1P40479 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.68□□□□□ -0.7
SDP1P40479 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.68□□□□□ -0.7
SDP1P40479 RRT12YCR045C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
SDP1P40479 PIB2YGL023C 1908 nt10.65□□□□□ -0.7
SDP1P40479 YOR139CYOR139C 393 nt10.65□□□□□ -0.7
SDP1P40479 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.63□□□□□ -0.71
SDP1P40479 RTF1YGL244W 1677 nt10.6□□□□□ -0.71
SDP1P40479 WHI5YOR083W 888 nt10.58□□□□□ -0.72
SDP1P40479 YLR281CYLR281C 468 nt10.57□□□□□ -0.72
SDP1P40479 BOP3YNL042W 1191 nt10.55□□□□□ -0.72
SDP1P40479 PAC11YDR488C 1602 nt10.55□□□□□ -0.72
SDP1P40479 IDH1YNL037C 1083 nt10.46□□□□□ -0.73
SDP1P40479 NCP1YHR042W 2076 nt10.46□□□□□ -0.74
SDP1P40479 PTK1YKL198C 1989 nt10.44□□□□□ -0.74
SDP1P40479 IMP2'YIL154C 1041 nt10.42□□□□□ -0.74
SDP1P40479 RRD1YIL153W 1182 nt10.41□□□□□ -0.74
SDP1P40479 FMP52YER004W 696 nt10.39□□□□□ -0.75
SDP1P40479 NME1NME1 340 nt10.39□□□□□ -0.75
SDP1P40479 GBP2YCL011C 1284 nt10.39□□□□□ -0.75
SDP1P40479 TCD2YKL027W 1344 nt10.34□□□□□ -0.75
SDP1P40479 DED1YOR204W 1815 nt10.34□□□□□ -0.75
SDP1P40479 PUS2YGL063W 1113 nt10.33□□□□□ -0.76
SDP1P40479 DSK2YMR276W 1122 nt10.33□□□□□ -0.76
SDP1P40479 LCB1YMR296C 1677 nt10.33□□□□□ -0.76
SDP1P40479 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.28□□□□□ -0.76
SDP1P40479 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.28□□□□□ -0.76
SDP1P40479 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.28□□□□□ -0.76
SDP1P40479 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.28□□□□□ -0.76
SDP1P40479 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.28□□□□□ -0.76
SDP1P40479 PCM1YEL058W 1674 nt10.28□□□□□ -0.76
SDP1P40479 FMT1YBL013W 1206 nt10.26□□□□□ -0.77
SDP1P40479 YFL054CYFL054C 1941 nt10.21□□□□□ -0.77
SDP1P40479 FMP45YDL222C 930 nt10.21□□□□□ -0.77
SDP1P40479 YDR433WYDR433W 441 nt10.21□□□□□ -0.77
SDP1P40479 YPR011CYPR011C 981 nt10.21□□□□□ -0.77
SDP1P40479 SIM1YIL123W 1431 nt10.21□□□□□ -0.78
SDP1P40479 SOR2YDL246C 1074 nt10.18□□□□□ -0.78
SDP1P40479 SOR1YJR159W 1074 nt10.18□□□□□ -0.78
SDP1P40479 ERV46YAL042W 1248 nt10.18□□□□□ -0.78
SDP1P40479 ADH2YMR303C 1047 nt10.18□□□□□ -0.78
SDP1P40479 SNF6YHL025W 999 nt10.17□□□□□ -0.78
SDP1P40479 CWP1YKL096W 720 nt10.17□□□□□ -0.78
SDP1P40479 MXR2YCL033C 507 nt10.16□□□□□ -0.78
SDP1P40479 SPT8YLR055C 1809 nt10.16□□□□□ -0.78
SDP1P40479 BIO4YNR057C 714 nt10.14□□□□□ -0.79
SDP1P40479 LYS4YDR234W 2082 nt10.14□□□□□ -0.79
SDP1P40479 YKR040CYKR040C 504 nt10.13□□□□□ -0.79
SDP1P40479 YCL042WYCL042W 360 nt10.12□□□□□ -0.79
SDP1P40479 LPX1YOR084W 1164 nt10.1□□□□□ -0.79
SDP1P40479 NVJ2YPR091C 2313 nt10.08□□□□□ -0.8
SDP1P40479 YIH1YCR059C 777 nt10.08□□□□□ -0.8
SDP1P40479 FRD1YEL047C 1413 nt10.07□□□□□ -0.8
SDP1P40479 ERF2YLR246W 1080 nt10.06□□□□□ -0.8
SDP1P40479 RNQ1YCL028W 1218 nt10.04□□□□□ -0.8
SDP1P40479 CRR1YLR213C 1269 nt10.01□□□□□ -0.81
SDP1P40479 YGR139WYGR139W 339 nt10□□□□□ -0.81
SDP1P40479 SWE1YJL187C 2460 nt9.99□□□□□ -0.81
SDP1P40479 YLL053CYLL053C 459 nt9.99□□□□□ -0.81
SDP1P40479 FTR1YER145C 1215 nt9.92□□□□□ -0.82
SDP1P40479 YFL067WYFL067W 528 nt9.91□□□□□ -0.82
SDP1P40479 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.91□□□□□ -0.82
SDP1P40479 ATF2YGR177C 1608 nt9.91□□□□□ -0.82
SDP1P40479 HEM12YDR047W 1089 nt9.9□□□□□ -0.82
SDP1P40479 DIC1YLR348C 897 nt9.9□□□□□ -0.82
SDP1P40479 GAL1YBR020W 1587 nt9.87□□□□□ -0.83
SDP1P40479 BOR1YNL275W 1731 nt9.87□□□□□ -0.83
SDP1P40479 SNG1YGR197C 1644 nt9.85□□□□□ -0.83
SDP1P40479 MIC10YCL057C-A 294 nt9.85□□□□□ -0.83
SDP1P40479 TRM5YHR070W 1500 nt9.84□□□□□ -0.83
SDP1P40479 AQY1YPR192W 918 nt9.83□□□□□ -0.84
SDP1P40479 RAX1YOR301W 1308 nt9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms