Protein–RNA interactions for Protein: P40157

VID27, Vacuolar import and degradation protein 27, yeastyeast

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID27P40157 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.19□□□□□ -0.14
VID27P40157 DSK2YMR276W 1122 nt14.17□□□□□ -0.14
VID27P40157 SIS1YNL007C 1059 nt14.17□□□□□ -0.14
VID27P40157 SPT5YML010W 3192 nt14.17□□□□□ -0.14
VID27P40157 YLR236CYLR236C 324 nt14.16□□□□□ -0.14
VID27P40157 MOT3YMR070W 1473 nt14.13□□□□□ -0.15
VID27P40157 IMP2'YIL154C 1041 nt14.1□□□□□ -0.15
VID27P40157 YJL152WYJL152W 360 nt14.1□□□□□ -0.15
VID27P40157 FMP45YDL222C 930 nt14.09□□□□□ -0.15
VID27P40157 MEP2YNL142W 1500 nt14.05□□□□□ -0.16
VID27P40157 YCH1YGR203W 447 nt14.04□□□□□ -0.16
VID27P40157 RPP2AYOL039W 321 nt14.04□□□□□ -0.16
VID27P40157 TIR4YOR009W 1464 nt14.03□□□□□ -0.16
VID27P40157 PTP1YDL230W 1008 nt14□□□□□ -0.17
VID27P40157 ART5YGR068C 1761 nt13.94□□□□□ -0.18
VID27P40157 IDH1YNL037C 1083 nt13.91□□□□□ -0.18
VID27P40157 LPX1YOR084W 1164 nt13.9□□□□□ -0.18
VID27P40157 DCW1YKL046C 1350 nt13.87□□□□□ -0.19
VID27P40157 PET9YBL030C 957 nt13.86□□□□□ -0.19
VID27P40157 GFD2YCL036W 1701 nt13.86□□□□□ -0.19
VID27P40157 ERV46YAL042W 1248 nt13.85□□□□□ -0.19
VID27P40157 CAC2YML102W 1407 nt13.84□□□□□ -0.19
VID27P40157 YMR057CYMR057C 372 nt13.84□□□□□ -0.19
VID27P40157 YDR433WYDR433W 441 nt13.8□□□□□ -0.2
VID27P40157 GBP2YCL011C 1284 nt13.79□□□□□ -0.2
VID27P40157 SPP1YPL138C 1062 nt13.74□□□□□ -0.21
VID27P40157 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.73□□□□□ -0.21
VID27P40157 YKR040CYKR040C 504 nt13.72□□□□□ -0.21
VID27P40157 MXR2YCL033C 507 nt13.71□□□□□ -0.21
VID27P40157 EMI2YDR516C 1503 nt13.69□□□□□ -0.22
VID27P40157 RTS2YOR077W 699 nt13.66□□□□□ -0.22
VID27P40157 SSA4YER103W 1929 nt13.65□□□□□ -0.22
VID27P40157 FPS1YLL043W 2010 nt13.63□□□□□ -0.23
VID27P40157 IRC15YPL017C 1500 nt13.63□□□□□ -0.23
VID27P40157 YDL221WYDL221W 552 nt13.62□□□□□ -0.23
VID27P40157 MRPL8YJL063C 717 nt13.62□□□□□ -0.23
VID27P40157 TCD2YKL027W 1344 nt13.59□□□□□ -0.23
VID27P40157 DED1YOR204W 1815 nt13.55□□□□□ -0.24
VID27P40157 RRD1YIL153W 1182 nt13.54□□□□□ -0.24
VID27P40157 RTG1YOL067C 534 nt13.54□□□□□ -0.24
VID27P40157 YMR090WYMR090W 684 nt13.52□□□□□ -0.25
VID27P40157 GIS3YLR094C 1509 nt13.52□□□□□ -0.25
VID27P40157 CUE1YMR264W 612 nt13.51□□□□□ -0.25
VID27P40157 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.5□□□□□ -0.25
VID27P40157 YEL076CYEL076C 651 nt13.5□□□□□ -0.25
VID27P40157 YLR464WYLR464W 651 nt13.5□□□□□ -0.25
VID27P40157 FRD1YEL047C 1413 nt13.45□□□□□ -0.26
VID27P40157 ADO1YJR105W 1023 nt13.44□□□□□ -0.26
VID27P40157 FMT1YBL013W 1206 nt13.41□□□□□ -0.26
VID27P40157 SDH1YKL148C 1923 nt13.39□□□□□ -0.27
VID27P40157 SCC4YER147C 1875 nt13.36□□□□□ -0.27
VID27P40157 YBR220CYBR220C 1683 nt13.36□□□□□ -0.27
VID27P40157 SOR2YDL246C 1074 nt13.33□□□□□ -0.28
VID27P40157 SOR1YJR159W 1074 nt13.33□□□□□ -0.28
VID27P40157 YIL100WYIL100W 354 nt13.32□□□□□ -0.28
VID27P40157 YCL042WYCL042W 360 nt13.32□□□□□ -0.28
VID27P40157 PTH1YHR189W 573 nt13.28□□□□□ -0.28
VID27P40157 FMP52YER004W 696 nt13.27□□□□□ -0.29
VID27P40157 HUA1YGR268C 597 nt13.23□□□□□ -0.29
VID27P40157 CWP1YKL096W 720 nt13.22□□□□□ -0.29
VID27P40157 BDF1YLR399C 2061 nt13.22□□□□□ -0.29
VID27P40157 UBX6YJL048C 1191 nt13.21□□□□□ -0.29
VID27P40157 ADH2YMR303C 1047 nt13.2□□□□□ -0.3
VID27P40157 YLR235CYLR235C 399 nt13.18□□□□□ -0.3
VID27P40157 YKL030WYKL030W 606 nt13.16□□□□□ -0.3
VID27P40157 LCB1YMR296C 1677 nt13.12□□□□□ -0.31
VID27P40157 PCM1YEL058W 1674 nt13.11□□□□□ -0.31
VID27P40157 RRT12YCR045C 1476 nt13.05□□□□□ -0.32
VID27P40157 SNF6YHL025W 999 nt13.05□□□□□ -0.32
VID27P40157 YNL195CYNL195C 786 nt13.05□□□□□ -0.32
VID27P40157 TAT1YBR069C 1860 nt13.02□□□□□ -0.32
VID27P40157 YDR094WYDR094W 336 nt13.02□□□□□ -0.33
VID27P40157 DIC1YLR348C 897 nt13.02□□□□□ -0.33
VID27P40157 YSC84YHR016C 1407 nt13□□□□□ -0.33
VID27P40157 TIM23YNR017W 669 nt12.99□□□□□ -0.33
VID27P40157 YHL050CYHL050C 2094 nt12.97□□□□□ -0.33
VID27P40157 YIH1YCR059C 777 nt12.95□□□□□ -0.34
VID27P40157 RNQ1YCL028W 1218 nt12.95□□□□□ -0.34
VID27P40157 PAC11YDR488C 1602 nt12.95□□□□□ -0.34
VID27P40157 YLR179CYLR179C 606 nt12.9□□□□□ -0.34
VID27P40157 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.84□□□□□ -0.35
VID27P40157 BIO4YNR057C 714 nt12.84□□□□□ -0.35
VID27P40157 YLL053CYLL053C 459 nt12.83□□□□□ -0.36
VID27P40157 SIM1YIL123W 1431 nt12.82□□□□□ -0.36
VID27P40157 WSC2YNL283C 1512 nt12.82□□□□□ -0.36
VID27P40157 YPR064WYPR064W 420 nt12.81□□□□□ -0.36
VID27P40157 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.79□□□□□ -0.36
VID27P40157 AHT1YHR093W 549 nt12.79□□□□□ -0.36
VID27P40157 SEC11YIR022W 504 nt12.79□□□□□ -0.36
VID27P40157 TAD3YLR316C 969 nt12.77□□□□□ -0.37
VID27P40157 FTR1YER145C 1215 nt12.75□□□□□ -0.37
VID27P40157 YFR018CYFR018C 1092 nt12.73□□□□□ -0.37
VID27P40157 GAL1YBR020W 1587 nt12.72□□□□□ -0.37
VID27P40157 AQY1YPR192W 918 nt12.69□□□□□ -0.38
VID27P40157 PCH2YBR186W 1695 nt12.69□□□□□ -0.38
VID27P40157 PRE6YOL038W 765 nt12.68□□□□□ -0.38
VID27P40157 TRM5YHR070W 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
VID27P40157 PAU16YKL224C 372 nt12.67□□□□□ -0.38
VID27P40157 ATF2YGR177C 1608 nt12.62□□□□□ -0.39
VID27P40157 NCP1YHR042W 2076 nt12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms