Protein–RNA interactions for Protein: P40071

TMN3, Transmembrane 9 superfamily member 3, yeastyeast

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMN3P40071 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.82□□□□□ -0.36
TMN3P40071 YLR281CYLR281C 468 nt12.81□□□□□ -0.36
TMN3P40071 TIR4YOR009W 1464 nt12.8□□□□□ -0.36
TMN3P40071 GFD2YCL036W 1701 nt12.79□□□□□ -0.36
TMN3P40071 YDL221WYDL221W 552 nt12.79□□□□□ -0.36
TMN3P40071 WHI5YOR083W 888 nt12.79□□□□□ -0.36
TMN3P40071 YMR090WYMR090W 684 nt12.76□□□□□ -0.37
TMN3P40071 PET9YBL030C 957 nt12.73□□□□□ -0.37
TMN3P40071 YJL152WYJL152W 360 nt12.72□□□□□ -0.37
TMN3P40071 IRC15YPL017C 1500 nt12.71□□□□□ -0.38
TMN3P40071 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.7□□□□□ -0.38
TMN3P40071 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.7□□□□□ -0.38
TMN3P40071 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.7□□□□□ -0.38
TMN3P40071 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.7□□□□□ -0.38
TMN3P40071 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.7□□□□□ -0.38
TMN3P40071 YCH1YGR203W 447 nt12.69□□□□□ -0.38
TMN3P40071 YBR220CYBR220C 1683 nt12.67□□□□□ -0.38
TMN3P40071 YMR057CYMR057C 372 nt12.67□□□□□ -0.38
TMN3P40071 RTS2YOR077W 699 nt12.66□□□□□ -0.38
TMN3P40071 PUS2YGL063W 1113 nt12.65□□□□□ -0.38
TMN3P40071 SDH1YKL148C 1923 nt12.64□□□□□ -0.39
TMN3P40071 GIS3YLR094C 1509 nt12.62□□□□□ -0.39
TMN3P40071 BDF1YLR399C 2061 nt12.58□□□□□ -0.4
TMN3P40071 SCC4YER147C 1875 nt12.57□□□□□ -0.4
TMN3P40071 FPS1YLL043W 2010 nt12.52□□□□□ -0.41
TMN3P40071 CUE1YMR264W 612 nt12.51□□□□□ -0.41
TMN3P40071 DSK2YMR276W 1122 nt12.51□□□□□ -0.41
TMN3P40071 YLR236CYLR236C 324 nt12.49□□□□□ -0.41
TMN3P40071 YPR011CYPR011C 981 nt12.49□□□□□ -0.41
TMN3P40071 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.49□□□□□ -0.41
TMN3P40071 IMP2'YIL154C 1041 nt12.46□□□□□ -0.41
TMN3P40071 IDH1YNL037C 1083 nt12.46□□□□□ -0.41
TMN3P40071 TAT1YBR069C 1860 nt12.4□□□□□ -0.42
TMN3P40071 GBP2YCL011C 1284 nt12.39□□□□□ -0.43
TMN3P40071 NVJ2YPR091C 2313 nt12.39□□□□□ -0.43
TMN3P40071 YIL100WYIL100W 354 nt12.34□□□□□ -0.43
TMN3P40071 PAC11YDR488C 1602 nt12.33□□□□□ -0.43
TMN3P40071 FMP45YDL222C 930 nt12.33□□□□□ -0.44
TMN3P40071 YDR433WYDR433W 441 nt12.3□□□□□ -0.44
TMN3P40071 LPX1YOR084W 1164 nt12.29□□□□□ -0.44
TMN3P40071 RRD1YIL153W 1182 nt12.28□□□□□ -0.44
TMN3P40071 YSC84YHR016C 1407 nt12.27□□□□□ -0.45
TMN3P40071 ERV46YAL042W 1248 nt12.26□□□□□ -0.45
TMN3P40071 DED1YOR204W 1815 nt12.25□□□□□ -0.45
TMN3P40071 MXR2YCL033C 507 nt12.25□□□□□ -0.45
TMN3P40071 TCD2YKL027W 1344 nt12.25□□□□□ -0.45
TMN3P40071 RRT12YCR045C 1476 nt12.24□□□□□ -0.45
TMN3P40071 YHL050CYHL050C 2094 nt12.23□□□□□ -0.45
TMN3P40071 YNL195CYNL195C 786 nt12.19□□□□□ -0.46
TMN3P40071 SEC11YIR022W 504 nt12.18□□□□□ -0.46
TMN3P40071 YKR040CYKR040C 504 nt12.17□□□□□ -0.46
TMN3P40071 FMT1YBL013W 1206 nt12.15□□□□□ -0.46
TMN3P40071 PCH2YBR186W 1695 nt12.15□□□□□ -0.46
TMN3P40071 MOT3YMR070W 1473 nt12.14□□□□□ -0.47
TMN3P40071 GUT2YIL155C 1950 nt12.09□□□□□ -0.47
TMN3P40071 FMP52YER004W 696 nt12.09□□□□□ -0.47
TMN3P40071 Q0182Q0182 405 nt12.09□□□□□ -0.47
TMN3P40071 FRD1YEL047C 1413 nt12.03□□□□□ -0.48
TMN3P40071 SPP1YPL138C 1062 nt12.03□□□□□ -0.48
TMN3P40071 SOR2YDL246C 1074 nt12.02□□□□□ -0.49
TMN3P40071 SOR1YJR159W 1074 nt12.02□□□□□ -0.49
TMN3P40071 CWP1YKL096W 720 nt12.01□□□□□ -0.49
TMN3P40071 ADH2YMR303C 1047 nt12.01□□□□□ -0.49
TMN3P40071 YCL042WYCL042W 360 nt12□□□□□ -0.49
TMN3P40071 PCM1YEL058W 1674 nt12□□□□□ -0.49
TMN3P40071 PIB2YGL023C 1908 nt11.95□□□□□ -0.5
TMN3P40071 SNF6YHL025W 999 nt11.91□□□□□ -0.5
TMN3P40071 LCB1YMR296C 1677 nt11.9□□□□□ -0.5
TMN3P40071 NCP1YHR042W 2076 nt11.88□□□□□ -0.51
TMN3P40071 RTF1YGL244W 1677 nt11.88□□□□□ -0.51
TMN3P40071 BOP3YNL042W 1191 nt11.85□□□□□ -0.51
TMN3P40071 SIM1YIL123W 1431 nt11.84□□□□□ -0.51
TMN3P40071 PTH1YHR189W 573 nt11.81□□□□□ -0.52
TMN3P40071 BIO4YNR057C 714 nt11.81□□□□□ -0.52
TMN3P40071 YIH1YCR059C 777 nt11.78□□□□□ -0.52
TMN3P40071 RNQ1YCL028W 1218 nt11.76□□□□□ -0.53
TMN3P40071 DIC1YLR348C 897 nt11.75□□□□□ -0.53
TMN3P40071 PTK1YKL198C 1989 nt11.74□□□□□ -0.53
TMN3P40071 RTG1YOL067C 534 nt11.73□□□□□ -0.53
TMN3P40071 YLR235CYLR235C 399 nt11.72□□□□□ -0.53
TMN3P40071 YLL053CYLL053C 459 nt11.7□□□□□ -0.54
TMN3P40071 LYS4YDR234W 2082 nt11.66□□□□□ -0.54
TMN3P40071 YKL030WYKL030W 606 nt11.64□□□□□ -0.55
TMN3P40071 TIM23YNR017W 669 nt11.63□□□□□ -0.55
TMN3P40071 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.62□□□□□ -0.55
TMN3P40071 YEL076CYEL076C 651 nt11.62□□□□□ -0.55
TMN3P40071 YLR464WYLR464W 651 nt11.62□□□□□ -0.55
TMN3P40071 FTR1YER145C 1215 nt11.61□□□□□ -0.55
TMN3P40071 MRPL8YJL063C 717 nt11.6□□□□□ -0.55
TMN3P40071 ERF2YLR246W 1080 nt11.6□□□□□ -0.55
TMN3P40071 GAL1YBR020W 1587 nt11.58□□□□□ -0.55
TMN3P40071 YLR179CYLR179C 606 nt11.58□□□□□ -0.56
TMN3P40071 ATF2YGR177C 1608 nt11.57□□□□□ -0.56
TMN3P40071 CRR1YLR213C 1269 nt11.57□□□□□ -0.56
TMN3P40071 TRM5YHR070W 1500 nt11.56□□□□□ -0.56
TMN3P40071 YFL054CYFL054C 1941 nt11.52□□□□□ -0.57
TMN3P40071 YFL067WYFL067W 528 nt11.5□□□□□ -0.57
TMN3P40071 ADO1YJR105W 1023 nt11.5□□□□□ -0.57
TMN3P40071 WSC2YNL283C 1512 nt11.5□□□□□ -0.57
TMN3P40071 HUA1YGR268C 597 nt11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.8 ms