Protein–RNA interactions for Protein: P38279

RTC2, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ3, yeastyeast

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTC2P38279 YMR090WYMR090W 684 nt11.3□□□□□ -0.6
RTC2P38279 RKM5YLR137W 1104 nt11.28□□□□□ -0.6
RTC2P38279 IRC15YPL017C 1500 nt11.27□□□□□ -0.61
RTC2P38279 SDH1YKL148C 1923 nt11.27□□□□□ -0.61
RTC2P38279 GFD2YCL036W 1701 nt11.23□□□□□ -0.61
RTC2P38279 ART5YGR068C 1761 nt11.22□□□□□ -0.61
RTC2P38279 GIS3YLR094C 1509 nt11.16□□□□□ -0.62
RTC2P38279 SCC4YER147C 1875 nt11.15□□□□□ -0.62
RTC2P38279 TIR4YOR009W 1464 nt11.14□□□□□ -0.63
RTC2P38279 PET9YBL030C 957 nt11.12□□□□□ -0.63
RTC2P38279 RTS2YOR077W 699 nt11.11□□□□□ -0.63
RTC2P38279 NPL3YDR432W 1245 nt11.07□□□□□ -0.64
RTC2P38279 PAC11YDR488C 1602 nt11.06□□□□□ -0.64
RTC2P38279 YCH1YGR203W 447 nt11.04□□□□□ -0.64
RTC2P38279 YOL037CYOL037C 354 nt11.03□□□□□ -0.64
RTC2P38279 YOR139CYOR139C 393 nt11.03□□□□□ -0.64
RTC2P38279 YMR057CYMR057C 372 nt11.01□□□□□ -0.65
RTC2P38279 CUE1YMR264W 612 nt10.99□□□□□ -0.65
RTC2P38279 SEC11YIR022W 504 nt10.96□□□□□ -0.65
RTC2P38279 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.96□□□□□ -0.65
RTC2P38279 FPS1YLL043W 2010 nt10.96□□□□□ -0.66
RTC2P38279 PCH2YBR186W 1695 nt10.95□□□□□ -0.66
RTC2P38279 YSC84YHR016C 1407 nt10.92□□□□□ -0.66
RTC2P38279 YJL225CYJL225C 5277 nt10.92□□□□□ -0.66
RTC2P38279 GUT2YIL155C 1950 nt10.92□□□□□ -0.66
RTC2P38279 YHL050CYHL050C 2094 nt10.91□□□□□ -0.66
RTC2P38279 YJL152WYJL152W 360 nt10.88□□□□□ -0.67
RTC2P38279 RRT12YCR045C 1476 nt10.86□□□□□ -0.67
RTC2P38279 PIB2YGL023C 1908 nt10.82□□□□□ -0.68
RTC2P38279 YLR281CYLR281C 468 nt10.82□□□□□ -0.68
RTC2P38279 WHI5YOR083W 888 nt10.82□□□□□ -0.68
RTC2P38279 YIL100WYIL100W 354 nt10.8□□□□□ -0.68
RTC2P38279 YLR236CYLR236C 324 nt10.77□□□□□ -0.69
RTC2P38279 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.76□□□□□ -0.69
RTC2P38279 YNL195CYNL195C 786 nt10.71□□□□□ -0.69
RTC2P38279 RTF1YGL244W 1677 nt10.67□□□□□ -0.7
RTC2P38279 RRD1YIL153W 1182 nt10.65□□□□□ -0.7
RTC2P38279 NVJ2YPR091C 2313 nt10.64□□□□□ -0.71
RTC2P38279 IDH1YNL037C 1083 nt10.62□□□□□ -0.71
RTC2P38279 NCP1YHR042W 2076 nt10.62□□□□□ -0.71
RTC2P38279 MOT3YMR070W 1473 nt10.61□□□□□ -0.71
RTC2P38279 DED1YOR204W 1815 nt10.61□□□□□ -0.71
RTC2P38279 PUS2YGL063W 1113 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC2P38279 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC2P38279 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC2P38279 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC2P38279 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC2P38279 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC2P38279 YPR011CYPR011C 981 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC2P38279 BOP3YNL042W 1191 nt10.59□□□□□ -0.71
RTC2P38279 GBP2YCL011C 1284 nt10.59□□□□□ -0.71
RTC2P38279 PTK1YKL198C 1989 nt10.57□□□□□ -0.72
RTC2P38279 DSK2YMR276W 1122 nt10.56□□□□□ -0.72
RTC2P38279 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.55□□□□□ -0.72
RTC2P38279 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.55□□□□□ -0.72
RTC2P38279 IMP2'YIL154C 1041 nt10.53□□□□□ -0.72
RTC2P38279 FMT1YBL013W 1206 nt10.53□□□□□ -0.72
RTC2P38279 LCB1YMR296C 1677 nt10.52□□□□□ -0.73
RTC2P38279 TCD2YKL027W 1344 nt10.5□□□□□ -0.73
RTC2P38279 FMP52YER004W 696 nt10.49□□□□□ -0.73
RTC2P38279 FMP45YDL222C 930 nt10.47□□□□□ -0.73
RTC2P38279 MXR2YCL033C 507 nt10.46□□□□□ -0.73
RTC2P38279 PCM1YEL058W 1674 nt10.44□□□□□ -0.74
RTC2P38279 YDR433WYDR433W 441 nt10.43□□□□□ -0.74
RTC2P38279 ERV46YAL042W 1248 nt10.42□□□□□ -0.74
RTC2P38279 ADH2YMR303C 1047 nt10.41□□□□□ -0.74
RTC2P38279 LPX1YOR084W 1164 nt10.41□□□□□ -0.74
RTC2P38279 SOR2YDL246C 1074 nt10.37□□□□□ -0.75
RTC2P38279 SOR1YJR159W 1074 nt10.37□□□□□ -0.75
RTC2P38279 CWP1YKL096W 720 nt10.37□□□□□ -0.75
RTC2P38279 SIM1YIL123W 1431 nt10.34□□□□□ -0.75
RTC2P38279 YKR040CYKR040C 504 nt10.33□□□□□ -0.76
RTC2P38279 BIO4YNR057C 714 nt10.33□□□□□ -0.76
RTC2P38279 LYS4YDR234W 2082 nt10.32□□□□□ -0.76
RTC2P38279 FRD1YEL047C 1413 nt10.32□□□□□ -0.76
RTC2P38279 SNF6YHL025W 999 nt10.31□□□□□ -0.76
RTC2P38279 YFL054CYFL054C 1941 nt10.29□□□□□ -0.76
RTC2P38279 YCL042WYCL042W 360 nt10.26□□□□□ -0.77
RTC2P38279 YIH1YCR059C 777 nt10.25□□□□□ -0.77
RTC2P38279 SPT8YLR055C 1809 nt10.25□□□□□ -0.77
RTC2P38279 BOR1YNL275W 1731 nt10.2□□□□□ -0.78
RTC2P38279 RNQ1YCL028W 1218 nt10.19□□□□□ -0.78
RTC2P38279 YLL053CYLL053C 459 nt10.17□□□□□ -0.78
RTC2P38279 CRR1YLR213C 1269 nt10.17□□□□□ -0.78
RTC2P38279 ERF2YLR246W 1080 nt10.14□□□□□ -0.79
RTC2P38279 SPP1YPL138C 1062 nt10.14□□□□□ -0.79
RTC2P38279 DIC1YLR348C 897 nt10.11□□□□□ -0.79
RTC2P38279 SWE1YJL187C 2460 nt10.11□□□□□ -0.79
RTC2P38279 ATF2YGR177C 1608 nt10.11□□□□□ -0.79
RTC2P38279 FTR1YER145C 1215 nt10.08□□□□□ -0.8
RTC2P38279 MIC10YCL057C-A 294 nt10.07□□□□□ -0.8
RTC2P38279 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.05□□□□□ -0.8
RTC2P38279 GAL1YBR020W 1587 nt10.05□□□□□ -0.8
RTC2P38279 PTH1YHR189W 573 nt10.03□□□□□ -0.8
RTC2P38279 SNG1YGR197C 1644 nt10.03□□□□□ -0.8
RTC2P38279 TRM5YHR070W 1500 nt10.02□□□□□ -0.8
RTC2P38279 HEM12YDR047W 1089 nt10.01□□□□□ -0.81
RTC2P38279 YFL067WYFL067W 528 nt9.99□□□□□ -0.81
RTC2P38279 YLR235CYLR235C 399 nt9.95□□□□□ -0.82
RTC2P38279 ANP1YEL036C 1503 nt9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.1 ms