Protein–RNA interactions for Protein: P38255

RXT2, Transcriptional regulatory protein RXT2, yeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RXT2	P38255	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		14	□□□□□ -0.17
RXT2	P38255	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		14	□□□□□ -0.17
RXT2	P38255	PTP1	YDL230W	1008 nt		13.98	□□□□□ -0.17
RXT2	P38255	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		13.97	□□□□□ -0.17
RXT2	P38255	PUS2	YGL063W	1113 nt		13.92	□□□□□ -0.18
RXT2	P38255	CAC2	YML102W	1407 nt		13.88	□□□□□ -0.19
RXT2	P38255	YJL152W	YJL152W	360 nt		13.87	□□□□□ -0.19
RXT2	P38255	TIR4	YOR009W	1464 nt		13.87	□□□□□ -0.19
RXT2	P38255	ART5	YGR068C	1761 nt		13.86	□□□□□ -0.19
RXT2	P38255	SSA4	YER103W	1929 nt		13.84	□□□□□ -0.19
RXT2	P38255	EMI2	YDR516C	1503 nt		13.8	□□□□□ -0.2
RXT2	P38255	GFD2	YCL036W	1701 nt		13.79	□□□□□ -0.2
RXT2	P38255	YCH1	YGR203W	447 nt		13.79	□□□□□ -0.2
RXT2	P38255	PET9	YBL030C	957 nt		13.75	□□□□□ -0.21
RXT2	P38255	YMR057C	YMR057C	372 nt		13.71	□□□□□ -0.21
RXT2	P38255	DSK2	YMR276W	1122 nt		13.71	□□□□□ -0.21
RXT2	P38255	YDL221W	YDL221W	552 nt		13.7	□□□□□ -0.22
RXT2	P38255	YLR236C	YLR236C	324 nt		13.7	□□□□□ -0.22
RXT2	P38255	YPR011C	YPR011C	981 nt		13.7	□□□□□ -0.22
RXT2	P38255	YMR090W	YMR090W	684 nt		13.66	□□□□□ -0.22
RXT2	P38255	RTS2	YOR077W	699 nt		13.66	□□□□□ -0.22
RXT2	P38255	IRC15	YPL017C	1500 nt		13.65	□□□□□ -0.22
RXT2	P38255	IMP2'	YIL154C	1041 nt		13.64	□□□□□ -0.23
RXT2	P38255	IDH1	YNL037C	1083 nt		13.6	□□□□□ -0.23
RXT2	P38255	FMP45	YDL222C	930 nt		13.58	□□□□□ -0.24
RXT2	P38255	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		13.56	□□□□□ -0.24
RXT2	P38255	GIS3	YLR094C	1509 nt		13.55	□□□□□ -0.24
RXT2	P38255	YBR220C	YBR220C	1683 nt		13.52	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	SDH1	YKL148C	1923 nt		13.52	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	FPS1	YLL043W	2010 nt		13.51	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	GBP2	YCL011C	1284 nt		13.51	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	CUE1	YMR264W	612 nt		13.48	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	LPX1	YOR084W	1164 nt		13.47	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	SCC4	YER147C	1875 nt		13.46	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	YDR433W	YDR433W	441 nt		13.46	□□□□□ -0.25
RXT2	P38255	MOT3	YMR070W	1473 nt		13.44	□□□□□ -0.26
RXT2	P38255	ERV46	YAL042W	1248 nt		13.41	□□□□□ -0.26
RXT2	P38255	MXR2	YCL033C	507 nt		13.38	□□□□□ -0.27
RXT2	P38255	TCD2	YKL027W	1344 nt		13.34	□□□□□ -0.27
RXT2	P38255	YIL100W	YIL100W	354 nt		13.32	□□□□□ -0.28
RXT2	P38255	RRD1	YIL153W	1182 nt		13.32	□□□□□ -0.28
RXT2	P38255	YKR040C	YKR040C	504 nt		13.31	□□□□□ -0.28
RXT2	P38255	DED1	YOR204W	1815 nt		13.3	□□□□□ -0.28
RXT2	P38255	BDF1	YLR399C	2061 nt		13.28	□□□□□ -0.28
RXT2	P38255	SPP1	YPL138C	1062 nt		13.24	□□□□□ -0.29
RXT2	P38255	Q0182	Q0182	405 nt		13.18	□□□□□ -0.3
RXT2	P38255	FMT1	YBL013W	1206 nt		13.18	□□□□□ -0.3
RXT2	P38255	YSC84	YHR016C	1407 nt		13.13	□□□□□ -0.31
RXT2	P38255	RRT12	YCR045C	1476 nt		13.13	□□□□□ -0.31
RXT2	P38255	FRD1	YEL047C	1413 nt		13.12	□□□□□ -0.31
RXT2	P38255	TAT1	YBR069C	1860 nt		13.11	□□□□□ -0.31
RXT2	P38255	YNL195C	YNL195C	786 nt		13.11	□□□□□ -0.31
RXT2	P38255	FMP52	YER004W	696 nt		13.09	□□□□□ -0.31
RXT2	P38255	YCL042W	YCL042W	360 nt		13.07	□□□□□ -0.32
RXT2	P38255	YHL050C	YHL050C	2094 nt		13.07	□□□□□ -0.32
RXT2	P38255	SOR2	YDL246C	1074 nt		13.06	□□□□□ -0.32
RXT2	P38255	SOR1	YJR159W	1074 nt		13.06	□□□□□ -0.32
RXT2	P38255	CWP1	YKL096W	720 nt		13.05	□□□□□ -0.32
RXT2	P38255	ADH2	YMR303C	1047 nt		13.03	□□□□□ -0.32
RXT2	P38255	SEC11	YIR022W	504 nt		12.98	□□□□□ -0.33
RXT2	P38255	PCM1	YEL058W	1674 nt		12.98	□□□□□ -0.33
RXT2	P38255	PTH1	YHR189W	573 nt		12.93	□□□□□ -0.34
RXT2	P38255	RTG1	YOL067C	534 nt		12.93	□□□□□ -0.34
RXT2	P38255	PCH2	YBR186W	1695 nt		12.93	□□□□□ -0.34
RXT2	P38255	MRPL8	YJL063C	717 nt		12.92	□□□□□ -0.34
RXT2	P38255	SNF6	YHL025W	999 nt		12.91	□□□□□ -0.34
RXT2	P38255	GUT2	YIL155C	1950 nt		12.85	□□□□□ -0.35
RXT2	P38255	YEL076C-A	YEL076C-A	651 nt		12.84	□□□□□ -0.35
RXT2	P38255	YEL076C	YEL076C	651 nt		12.84	□□□□□ -0.35
RXT2	P38255	YLR464W	YLR464W	651 nt		12.84	□□□□□ -0.35
RXT2	P38255	YLR235C	YLR235C	399 nt		12.82	□□□□□ -0.36
RXT2	P38255	ADO1	YJR105W	1023 nt		12.79	□□□□□ -0.36
RXT2	P38255	DIC1	YLR348C	897 nt		12.79	□□□□□ -0.36
RXT2	P38255	LCB1	YMR296C	1677 nt		12.78	□□□□□ -0.36
RXT2	P38255	SIM1	YIL123W	1431 nt		12.78	□□□□□ -0.36
RXT2	P38255	YIH1	YCR059C	777 nt		12.76	□□□□□ -0.37
RXT2	P38255	YKL030W	YKL030W	606 nt		12.76	□□□□□ -0.37
RXT2	P38255	BIO4	YNR057C	714 nt		12.76	□□□□□ -0.37
RXT2	P38255	RNQ1	YCL028W	1218 nt		12.75	□□□□□ -0.37
RXT2	P38255	TIM23	YNR017W	669 nt		12.69	□□□□□ -0.38
RXT2	P38255	NCP1	YHR042W	2076 nt		12.69	□□□□□ -0.38
RXT2	P38255	YLL053C	YLL053C	459 nt		12.68	□□□□□ -0.38
RXT2	P38255	PIB2	YGL023C	1908 nt		12.68	□□□□□ -0.38
RXT2	P38255	HUA1	YGR268C	597 nt		12.67	□□□□□ -0.38
RXT2	P38255	RTF1	YGL244W	1677 nt		12.67	□□□□□ -0.38
RXT2	P38255	BOP3	YNL042W	1191 nt		12.65	□□□□□ -0.38
RXT2	P38255	YLR179C	YLR179C	606 nt		12.63	□□□□□ -0.39
RXT2	P38255	FTR1	YER145C	1215 nt		12.58	□□□□□ -0.4
RXT2	P38255	GAL1	YBR020W	1587 nt		12.56	□□□□□ -0.4
RXT2	P38255	TRM5	YHR070W	1500 nt		12.53	□□□□□ -0.4
RXT2	P38255	ERF2	YLR246W	1080 nt		12.52	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	WSC2	YNL283C	1512 nt		12.52	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	ATF2	YGR177C	1608 nt		12.51	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	LYS4	YDR234W	2082 nt		12.49	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	CRR1	YLR213C	1269 nt		12.49	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	YPR064W	YPR064W	420 nt		12.49	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	PTK1	YKL198C	1989 nt		12.49	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	AHT1	YHR093W	549 nt		12.48	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	AQY1	YPR192W	918 nt		12.47	□□□□□ -0.41
RXT2	P38255	UBX6	YJL048C	1191 nt		12.45	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.7 ms