Protein–RNA interactions for Protein: P38138

ROT2, Glucosidase 2 subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT2P38138 IRC15YPL017C 1500 nt11.93□□□□□ -0.5
ROT2P38138 ART5YGR068C 1761 nt11.91□□□□□ -0.5
ROT2P38138 GFD2YCL036W 1701 nt11.88□□□□□ -0.51
ROT2P38138 SCC4YER147C 1875 nt11.87□□□□□ -0.51
ROT2P38138 YKL097CYKL097C 411 nt11.87□□□□□ -0.51
ROT2P38138 GIS3YLR094C 1509 nt11.86□□□□□ -0.51
ROT2P38138 RKM5YLR137W 1104 nt11.85□□□□□ -0.51
ROT2P38138 RTS2YOR077W 699 nt11.82□□□□□ -0.52
ROT2P38138 PET9YBL030C 957 nt11.78□□□□□ -0.52
ROT2P38138 TIR4YOR009W 1464 nt11.76□□□□□ -0.53
ROT2P38138 YCH1YGR203W 447 nt11.69□□□□□ -0.54
ROT2P38138 YMR057CYMR057C 372 nt11.69□□□□□ -0.54
ROT2P38138 PCH2YBR186W 1695 nt11.66□□□□□ -0.54
ROT2P38138 SEC11YIR022W 504 nt11.65□□□□□ -0.54
ROT2P38138 CUE1YMR264W 612 nt11.65□□□□□ -0.54
ROT2P38138 YSC84YHR016C 1407 nt11.64□□□□□ -0.55
ROT2P38138 NPL3YDR432W 1245 nt11.63□□□□□ -0.55
ROT2P38138 GUT2YIL155C 1950 nt11.61□□□□□ -0.55
ROT2P38138 YJL152WYJL152W 360 nt11.58□□□□□ -0.56
ROT2P38138 YHL050CYHL050C 2094 nt11.57□□□□□ -0.56
ROT2P38138 FPS1YLL043W 2010 nt11.56□□□□□ -0.56
ROT2P38138 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.56□□□□□ -0.56
ROT2P38138 RRT12YCR045C 1476 nt11.56□□□□□ -0.56
ROT2P38138 YOL037CYOL037C 354 nt11.55□□□□□ -0.56
ROT2P38138 YIL100WYIL100W 354 nt11.52□□□□□ -0.57
ROT2P38138 YOR139CYOR139C 393 nt11.48□□□□□ -0.57
ROT2P38138 YLR236CYLR236C 324 nt11.47□□□□□ -0.57
ROT2P38138 YNL195CYNL195C 786 nt11.47□□□□□ -0.57
ROT2P38138 PIB2YGL023C 1908 nt11.45□□□□□ -0.58
ROT2P38138 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.44□□□□□ -0.58
ROT2P38138 WHI5YOR083W 888 nt11.38□□□□□ -0.59
ROT2P38138 RTF1YGL244W 1677 nt11.37□□□□□ -0.59
ROT2P38138 PAC11YDR488C 1602 nt11.35□□□□□ -0.59
ROT2P38138 YLR281CYLR281C 468 nt11.34□□□□□ -0.59
ROT2P38138 BOP3YNL042W 1191 nt11.3□□□□□ -0.6
ROT2P38138 IDH1YNL037C 1083 nt11.23□□□□□ -0.61
ROT2P38138 NCP1YHR042W 2076 nt11.22□□□□□ -0.61
ROT2P38138 RRD1YIL153W 1182 nt11.22□□□□□ -0.61
ROT2P38138 PTK1YKL198C 1989 nt11.22□□□□□ -0.61
ROT2P38138 Q0182Q0182 405 nt11.21□□□□□ -0.61
ROT2P38138 GBP2YCL011C 1284 nt11.21□□□□□ -0.61
ROT2P38138 PUS2YGL063W 1113 nt11.15□□□□□ -0.62
ROT2P38138 DED1YOR204W 1815 nt11.14□□□□□ -0.63
ROT2P38138 LCB1YMR296C 1677 nt11.14□□□□□ -0.63
ROT2P38138 TCD2YKL027W 1344 nt11.12□□□□□ -0.63
ROT2P38138 FMT1YBL013W 1206 nt11.08□□□□□ -0.64
ROT2P38138 DSK2YMR276W 1122 nt11.08□□□□□ -0.64
ROT2P38138 FMP52YER004W 696 nt11.07□□□□□ -0.64
ROT2P38138 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.07□□□□□ -0.64
ROT2P38138 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.07□□□□□ -0.64
ROT2P38138 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.07□□□□□ -0.64
ROT2P38138 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.07□□□□□ -0.64
ROT2P38138 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.07□□□□□ -0.64
ROT2P38138 IMP2'YIL154C 1041 nt11.07□□□□□ -0.64
ROT2P38138 PCM1YEL058W 1674 nt11.06□□□□□ -0.64
ROT2P38138 YPR011CYPR011C 981 nt11.06□□□□□ -0.64
ROT2P38138 YDR433WYDR433W 441 nt11.04□□□□□ -0.64
ROT2P38138 MXR2YCL033C 507 nt11.03□□□□□ -0.64
ROT2P38138 YFL054CYFL054C 1941 nt11.02□□□□□ -0.65
ROT2P38138 SIM1YIL123W 1431 nt11.01□□□□□ -0.65
ROT2P38138 ADH2YMR303C 1047 nt11.01□□□□□ -0.65
ROT2P38138 FMP45YDL222C 930 nt11□□□□□ -0.65
ROT2P38138 CWP1YKL096W 720 nt11□□□□□ -0.65
ROT2P38138 SNF6YHL025W 999 nt10.94□□□□□ -0.66
ROT2P38138 LPX1YOR084W 1164 nt10.93□□□□□ -0.66
ROT2P38138 BIO4YNR057C 714 nt10.92□□□□□ -0.66
ROT2P38138 SPT8YLR055C 1809 nt10.91□□□□□ -0.66
ROT2P38138 LYS4YDR234W 2082 nt10.9□□□□□ -0.66
ROT2P38138 SOR2YDL246C 1074 nt10.89□□□□□ -0.67
ROT2P38138 SOR1YJR159W 1074 nt10.89□□□□□ -0.67
ROT2P38138 ERV46YAL042W 1248 nt10.89□□□□□ -0.67
ROT2P38138 YCL042WYCL042W 360 nt10.88□□□□□ -0.67
ROT2P38138 YKR040CYKR040C 504 nt10.87□□□□□ -0.67
ROT2P38138 FRD1YEL047C 1413 nt10.84□□□□□ -0.67
ROT2P38138 NVJ2YPR091C 2313 nt10.82□□□□□ -0.68
ROT2P38138 YIH1YCR059C 777 nt10.78□□□□□ -0.68
ROT2P38138 YLL053CYLL053C 459 nt10.76□□□□□ -0.69
ROT2P38138 ERF2YLR246W 1080 nt10.75□□□□□ -0.69
ROT2P38138 RNQ1YCL028W 1218 nt10.75□□□□□ -0.69
ROT2P38138 SWE1YJL187C 2460 nt10.74□□□□□ -0.69
ROT2P38138 CRR1YLR213C 1269 nt10.73□□□□□ -0.69
ROT2P38138 MOT3YMR070W 1473 nt10.72□□□□□ -0.69
ROT2P38138 ATF2YGR177C 1608 nt10.69□□□□□ -0.7
ROT2P38138 DIC1YLR348C 897 nt10.66□□□□□ -0.7
ROT2P38138 MIC10YCL057C-A 294 nt10.66□□□□□ -0.7
ROT2P38138 HEM12YDR047W 1089 nt10.65□□□□□ -0.7
ROT2P38138 FTR1YER145C 1215 nt10.65□□□□□ -0.7
ROT2P38138 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.62□□□□□ -0.71
ROT2P38138 TRM5YHR070W 1500 nt10.62□□□□□ -0.71
ROT2P38138 BOR1YNL275W 1731 nt10.61□□□□□ -0.71
ROT2P38138 GAL1YBR020W 1587 nt10.61□□□□□ -0.71
ROT2P38138 SPP1YPL138C 1062 nt10.61□□□□□ -0.71
ROT2P38138 SNG1YGR197C 1644 nt10.61□□□□□ -0.71
ROT2P38138 YFL067WYFL067W 528 nt10.6□□□□□ -0.71
ROT2P38138 PTH1YHR189W 573 nt10.59□□□□□ -0.71
ROT2P38138 DDR2YOL052C-A 186 nt10.57□□□□□ -0.72
ROT2P38138 RAX1YOR301W 1308 nt10.54□□□□□ -0.72
ROT2P38138 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.52□□□□□ -0.73
ROT2P38138 CCA1YER168C 1641 nt10.51□□□□□ -0.73
ROT2P38138 HSP60YLR259C 1719 nt10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms