Protein–RNA interactions for Protein: P36123

SAP190, SIT4-associating protein SAP190, yeastyeast

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SAP190P36123 YDL221WYDL221W 552 nt13.64□□□□□ -0.23
SAP190P36123 RKM5YLR137W 1104 nt13.6□□□□□ -0.23
SAP190P36123 YBR220CYBR220C 1683 nt13.59□□□□□ -0.23
SAP190P36123 FPS1YLL043W 2010 nt13.59□□□□□ -0.23
SAP190P36123 SDH1YKL148C 1923 nt13.53□□□□□ -0.24
SAP190P36123 ART5YGR068C 1761 nt13.5□□□□□ -0.25
SAP190P36123 IRC15YPL017C 1500 nt13.46□□□□□ -0.25
SAP190P36123 GFD2YCL036W 1701 nt13.45□□□□□ -0.26
SAP190P36123 YOR139CYOR139C 393 nt13.43□□□□□ -0.26
SAP190P36123 PET9YBL030C 957 nt13.42□□□□□ -0.26
SAP190P36123 SCC4YER147C 1875 nt13.42□□□□□ -0.26
SAP190P36123 GIS3YLR094C 1509 nt13.39□□□□□ -0.27
SAP190P36123 YCH1YGR203W 447 nt13.38□□□□□ -0.27
SAP190P36123 YOL037CYOL037C 354 nt13.34□□□□□ -0.27
SAP190P36123 TIR4YOR009W 1464 nt13.34□□□□□ -0.27
SAP190P36123 RTS2YOR077W 699 nt13.32□□□□□ -0.28
SAP190P36123 NPL3YDR432W 1245 nt13.27□□□□□ -0.29
SAP190P36123 YMR057CYMR057C 372 nt13.26□□□□□ -0.29
SAP190P36123 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.24□□□□□ -0.29
SAP190P36123 CUE1YMR264W 612 nt13.22□□□□□ -0.29
SAP190P36123 YJL152WYJL152W 360 nt13.21□□□□□ -0.29
SAP190P36123 SEC11YIR022W 504 nt13.19□□□□□ -0.3
SAP190P36123 PCH2YBR186W 1695 nt13.13□□□□□ -0.31
SAP190P36123 YSC84YHR016C 1407 nt13.11□□□□□ -0.31
SAP190P36123 YIL100WYIL100W 354 nt13.09□□□□□ -0.31
SAP190P36123 Q0182Q0182 405 nt13.07□□□□□ -0.32
SAP190P36123 WHI5YOR083W 888 nt13.07□□□□□ -0.32
SAP190P36123 GUT2YIL155C 1950 nt13.07□□□□□ -0.32
SAP190P36123 YLR236CYLR236C 324 nt13.06□□□□□ -0.32
SAP190P36123 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.06□□□□□ -0.32
SAP190P36123 YLR281CYLR281C 468 nt13.05□□□□□ -0.32
SAP190P36123 YNL195CYNL195C 786 nt13.04□□□□□ -0.32
SAP190P36123 YHL050CYHL050C 2094 nt13.04□□□□□ -0.32
SAP190P36123 RRT12YCR045C 1476 nt13.02□□□□□ -0.33
SAP190P36123 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.88□□□□□ -0.35
SAP190P36123 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.88□□□□□ -0.35
SAP190P36123 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.88□□□□□ -0.35
SAP190P36123 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.88□□□□□ -0.35
SAP190P36123 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.88□□□□□ -0.35
SAP190P36123 IDH1YNL037C 1083 nt12.88□□□□□ -0.35
SAP190P36123 PIB2YGL023C 1908 nt12.85□□□□□ -0.35
SAP190P36123 PUS2YGL063W 1113 nt12.83□□□□□ -0.36
SAP190P36123 GBP2YCL011C 1284 nt12.82□□□□□ -0.36
SAP190P36123 RTF1YGL244W 1677 nt12.82□□□□□ -0.36
SAP190P36123 IMP2'YIL154C 1041 nt12.81□□□□□ -0.36
SAP190P36123 BOP3YNL042W 1191 nt12.77□□□□□ -0.37
SAP190P36123 UME6YDR207C 2511 nt12.76□□□□□ -0.37
SAP190P36123 DSK2YMR276W 1122 nt12.76□□□□□ -0.37
SAP190P36123 RRD1YIL153W 1182 nt12.75□□□□□ -0.37
SAP190P36123 TCD2YKL027W 1344 nt12.73□□□□□ -0.37
SAP190P36123 DED1YOR204W 1815 nt12.68□□□□□ -0.38
SAP190P36123 NCP1YHR042W 2076 nt12.67□□□□□ -0.38
SAP190P36123 FMP52YER004W 696 nt12.67□□□□□ -0.38
SAP190P36123 YDR433WYDR433W 441 nt12.65□□□□□ -0.38
SAP190P36123 YPR011CYPR011C 981 nt12.64□□□□□ -0.39
SAP190P36123 MOT3YMR070W 1473 nt12.64□□□□□ -0.39
SAP190P36123 PTK1YKL198C 1989 nt12.63□□□□□ -0.39
SAP190P36123 PCM1YEL058W 1674 nt12.58□□□□□ -0.4
SAP190P36123 LCB1YMR296C 1677 nt12.58□□□□□ -0.4
SAP190P36123 FMP45YDL222C 930 nt12.58□□□□□ -0.4
SAP190P36123 FMT1YBL013W 1206 nt12.58□□□□□ -0.4
SAP190P36123 YJL225CYJL225C 5277 nt12.56□□□□□ -0.4
SAP190P36123 MXR2YCL033C 507 nt12.55□□□□□ -0.4
SAP190P36123 ERV46YAL042W 1248 nt12.52□□□□□ -0.41
SAP190P36123 CWP1YKL096W 720 nt12.52□□□□□ -0.41
SAP190P36123 ADH2YMR303C 1047 nt12.5□□□□□ -0.41
SAP190P36123 SIM1YIL123W 1431 nt12.49□□□□□ -0.41
SAP190P36123 YKR040CYKR040C 504 nt12.49□□□□□ -0.41
SAP190P36123 LPX1YOR084W 1164 nt12.49□□□□□ -0.41
SAP190P36123 SNF6YHL025W 999 nt12.47□□□□□ -0.41
SAP190P36123 YCL042WYCL042W 360 nt12.46□□□□□ -0.41
SAP190P36123 SOR2YDL246C 1074 nt12.44□□□□□ -0.42
SAP190P36123 SOR1YJR159W 1074 nt12.44□□□□□ -0.42
SAP190P36123 YFL054CYFL054C 1941 nt12.41□□□□□ -0.42
SAP190P36123 BIO4YNR057C 714 nt12.38□□□□□ -0.43
SAP190P36123 FRD1YEL047C 1413 nt12.37□□□□□ -0.43
SAP190P36123 BOR1YNL275W 1731 nt12.35□□□□□ -0.43
SAP190P36123 LYS4YDR234W 2082 nt12.34□□□□□ -0.43
SAP190P36123 YIH1YCR059C 777 nt12.3□□□□□ -0.44
SAP190P36123 SPT8YLR055C 1809 nt12.29□□□□□ -0.44
SAP190P36123 RNQ1YCL028W 1218 nt12.28□□□□□ -0.44
SAP190P36123 ERF2YLR246W 1080 nt12.25□□□□□ -0.45
SAP190P36123 YLL053CYLL053C 459 nt12.24□□□□□ -0.45
SAP190P36123 MCH5YOR306C 1566 nt12.22□□□□□ -0.45
SAP190P36123 MRPL8YJL063C 717 nt12.18□□□□□ -0.46
SAP190P36123 CRR1YLR213C 1269 nt12.18□□□□□ -0.46
SAP190P36123 DIC1YLR348C 897 nt12.16□□□□□ -0.46
SAP190P36123 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.14□□□□□ -0.47
SAP190P36123 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.14□□□□□ -0.47
SAP190P36123 FTR1YER145C 1215 nt12.12□□□□□ -0.47
SAP190P36123 SPP1YPL138C 1062 nt12.12□□□□□ -0.47
SAP190P36123 ATF2YGR177C 1608 nt12.11□□□□□ -0.47
SAP190P36123 YFL067WYFL067W 528 nt12.11□□□□□ -0.47
SAP190P36123 GAL1YBR020W 1587 nt12.09□□□□□ -0.47
SAP190P36123 HEM12YDR047W 1089 nt12.09□□□□□ -0.47
SAP190P36123 SWE1YJL187C 2460 nt12.09□□□□□ -0.47
SAP190P36123 TRM5YHR070W 1500 nt12.07□□□□□ -0.48
SAP190P36123 PTH1YHR189W 573 nt12.07□□□□□ -0.48
SAP190P36123 YLR235CYLR235C 399 nt12.07□□□□□ -0.48
SAP190P36123 DDR2YOL052C-A 186 nt12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms