Protein–RNA interactions for Protein: P36070

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, yeastyeast

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3P36070 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.42□□□□□ -0.42
RRN3P36070 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.42□□□□□ -0.42
RRN3P36070 IRC15YPL017C 1500 nt12.37□□□□□ -0.43
RRN3P36070 MNP1YGL068W 585 nt12.37□□□□□ -0.43
RRN3P36070 RKM5YLR137W 1104 nt12.32□□□□□ -0.44
RRN3P36070 GFD2YCL036W 1701 nt12.31□□□□□ -0.44
RRN3P36070 ART5YGR068C 1761 nt12.3□□□□□ -0.44
RRN3P36070 SCC4YER147C 1875 nt12.28□□□□□ -0.44
RRN3P36070 GIS3YLR094C 1509 nt12.27□□□□□ -0.44
RRN3P36070 PET9YBL030C 957 nt12.22□□□□□ -0.45
RRN3P36070 TIR4YOR009W 1464 nt12.18□□□□□ -0.46
RRN3P36070 YCH1YGR203W 447 nt12.14□□□□□ -0.47
RRN3P36070 RTS2YOR077W 699 nt12.13□□□□□ -0.47
RRN3P36070 NPL3YDR432W 1245 nt12.12□□□□□ -0.47
RRN3P36070 PCH2YBR186W 1695 nt12.1□□□□□ -0.47
RRN3P36070 SEC11YIR022W 504 nt12.07□□□□□ -0.48
RRN3P36070 CUE1YMR264W 612 nt12.07□□□□□ -0.48
RRN3P36070 GUT2YIL155C 1950 nt12.07□□□□□ -0.48
RRN3P36070 YOR139CYOR139C 393 nt12.06□□□□□ -0.48
RRN3P36070 YMR057CYMR057C 372 nt12.04□□□□□ -0.48
RRN3P36070 YOL037CYOL037C 354 nt12.03□□□□□ -0.48
RRN3P36070 FPS1YLL043W 2010 nt12.03□□□□□ -0.48
RRN3P36070 YHL050CYHL050C 2094 nt12.02□□□□□ -0.49
RRN3P36070 YSC84YHR016C 1407 nt12.01□□□□□ -0.49
RRN3P36070 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.99□□□□□ -0.49
RRN3P36070 PIB2YGL023C 1908 nt11.99□□□□□ -0.49
RRN3P36070 RRT12YCR045C 1476 nt11.93□□□□□ -0.5
RRN3P36070 YJL152WYJL152W 360 nt11.86□□□□□ -0.51
RRN3P36070 YIL100WYIL100W 354 nt11.84□□□□□ -0.51
RRN3P36070 YLR281CYLR281C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
RRN3P36070 YLR236CYLR236C 324 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN3P36070 WHI5YOR083W 888 nt11.81□□□□□ -0.52
RRN3P36070 RTF1YGL244W 1677 nt11.78□□□□□ -0.52
RRN3P36070 YNL195CYNL195C 786 nt11.77□□□□□ -0.53
RRN3P36070 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.75□□□□□ -0.53
RRN3P36070 NCP1YHR042W 2076 nt11.75□□□□□ -0.53
RRN3P36070 PTK1YKL198C 1989 nt11.7□□□□□ -0.54
RRN3P36070 PAC11YDR488C 1602 nt11.68□□□□□ -0.54
RRN3P36070 BOP3YNL042W 1191 nt11.68□□□□□ -0.54
RRN3P36070 RRD1YIL153W 1182 nt11.67□□□□□ -0.54
RRN3P36070 NVJ2YPR091C 2313 nt11.66□□□□□ -0.54
RRN3P36070 YJL225CYJL225C 5277 nt11.64□□□□□ -0.55
RRN3P36070 DED1YOR204W 1815 nt11.62□□□□□ -0.55
RRN3P36070 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN3P36070 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN3P36070 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN3P36070 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN3P36070 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN3P36070 IDH1YNL037C 1083 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN3P36070 LCB1YMR296C 1677 nt11.56□□□□□ -0.56
RRN3P36070 GBP2YCL011C 1284 nt11.56□□□□□ -0.56
RRN3P36070 PUS2YGL063W 1113 nt11.54□□□□□ -0.56
RRN3P36070 IMP2'YIL154C 1041 nt11.54□□□□□ -0.56
RRN3P36070 YPR011CYPR011C 981 nt11.54□□□□□ -0.56
RRN3P36070 FMP52YER004W 696 nt11.53□□□□□ -0.56
RRN3P36070 FMT1YBL013W 1206 nt11.52□□□□□ -0.57
RRN3P36070 DSK2YMR276W 1122 nt11.52□□□□□ -0.57
RRN3P36070 TCD2YKL027W 1344 nt11.48□□□□□ -0.57
RRN3P36070 PCM1YEL058W 1674 nt11.46□□□□□ -0.58
RRN3P36070 FMP45YDL222C 930 nt11.43□□□□□ -0.58
RRN3P36070 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.39□□□□□ -0.59
RRN3P36070 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.39□□□□□ -0.59
RRN3P36070 LYS4YDR234W 2082 nt11.39□□□□□ -0.59
RRN3P36070 ERV46YAL042W 1248 nt11.39□□□□□ -0.59
RRN3P36070 SOR2YDL246C 1074 nt11.38□□□□□ -0.59
RRN3P36070 SOR1YJR159W 1074 nt11.38□□□□□ -0.59
RRN3P36070 MXR2YCL033C 507 nt11.38□□□□□ -0.59
RRN3P36070 ADH2YMR303C 1047 nt11.37□□□□□ -0.59
RRN3P36070 YDR433WYDR433W 441 nt11.36□□□□□ -0.59
RRN3P36070 RPM1RPM1 483 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN3P36070 SIM1YIL123W 1431 nt11.34□□□□□ -0.59
RRN3P36070 YFL054CYFL054C 1941 nt11.33□□□□□ -0.6
RRN3P36070 CWP1YKL096W 720 nt11.33□□□□□ -0.6
RRN3P36070 SPT8YLR055C 1809 nt11.32□□□□□ -0.6
RRN3P36070 LPX1YOR084W 1164 nt11.32□□□□□ -0.6
RRN3P36070 BIO4YNR057C 714 nt11.31□□□□□ -0.6
RRN3P36070 YKR040CYKR040C 504 nt11.3□□□□□ -0.6
RRN3P36070 SNF6YHL025W 999 nt11.29□□□□□ -0.6
RRN3P36070 FRD1YEL047C 1413 nt11.28□□□□□ -0.6
RRN3P36070 YIH1YCR059C 777 nt11.24□□□□□ -0.61
RRN3P36070 YCL042WYCL042W 360 nt11.22□□□□□ -0.61
RRN3P36070 RNQ1YCL028W 1218 nt11.18□□□□□ -0.62
RRN3P36070 CRR1YLR213C 1269 nt11.16□□□□□ -0.62
RRN3P36070 YLL053CYLL053C 459 nt11.14□□□□□ -0.63
RRN3P36070 ERF2YLR246W 1080 nt11.14□□□□□ -0.63
RRN3P36070 SWE1YJL187C 2460 nt11.14□□□□□ -0.63
RRN3P36070 ATF2YGR177C 1608 nt11.09□□□□□ -0.63
RRN3P36070 FTR1YER145C 1215 nt11.05□□□□□ -0.64
RRN3P36070 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.04□□□□□ -0.64
RRN3P36070 DIC1YLR348C 897 nt11.04□□□□□ -0.64
RRN3P36070 MIC10YCL057C-A 294 nt11.03□□□□□ -0.64
RRN3P36070 GAL1YBR020W 1587 nt11.01□□□□□ -0.65
RRN3P36070 SNG1YGR197C 1644 nt11□□□□□ -0.65
RRN3P36070 SPP1YPL138C 1062 nt11□□□□□ -0.65
RRN3P36070 FRE6YLL051C 2139 nt10.99□□□□□ -0.65
RRN3P36070 HEM12YDR047W 1089 nt10.98□□□□□ -0.65
RRN3P36070 YFL067WYFL067W 528 nt10.98□□□□□ -0.65
RRN3P36070 TRM5YHR070W 1500 nt10.98□□□□□ -0.65
RRN3P36070 ANP1YEL036C 1503 nt10.92□□□□□ -0.66
RRN3P36070 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.9□□□□□ -0.66
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