Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 GUT2YIL155C 1950 nt11.31□□□□□ -0.6
NIC96P34077 RKM5YLR137W 1104 nt11.3□□□□□ -0.6
NIC96P34077 SDH1YKL148C 1923 nt11.29□□□□□ -0.6
NIC96P34077 RPP2AYOL039W 321 nt11.28□□□□□ -0.6
NIC96P34077 SEC11YIR022W 504 nt11.26□□□□□ -0.61
NIC96P34077 YDL221WYDL221W 552 nt11.25□□□□□ -0.61
NIC96P34077 SIS1YNL007C 1059 nt11.21□□□□□ -0.61
NIC96P34077 PTP1YDL230W 1008 nt11.19□□□□□ -0.62
NIC96P34077 FPS1YLL043W 2010 nt11.19□□□□□ -0.62
NIC96P34077 YOL037CYOL037C 354 nt11.15□□□□□ -0.62
NIC96P34077 CAC2YML102W 1407 nt11.13□□□□□ -0.63
NIC96P34077 NPL3YDR432W 1245 nt11.11□□□□□ -0.63
NIC96P34077 PIB2YGL023C 1908 nt11.09□□□□□ -0.63
NIC96P34077 YOR139CYOR139C 393 nt11.09□□□□□ -0.63
NIC96P34077 SCC4YER147C 1875 nt11.08□□□□□ -0.64
NIC96P34077 ART5YGR068C 1761 nt11.05□□□□□ -0.64
NIC96P34077 GFD2YCL036W 1701 nt11.02□□□□□ -0.65
NIC96P34077 PET9YBL030C 957 nt11□□□□□ -0.65
NIC96P34077 YCH1YGR203W 447 nt10.99□□□□□ -0.65
NIC96P34077 TIR4YOR009W 1464 nt10.98□□□□□ -0.65
NIC96P34077 IRC15YPL017C 1500 nt10.97□□□□□ -0.65
NIC96P34077 RTF1YGL244W 1677 nt10.97□□□□□ -0.65
NIC96P34077 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.96□□□□□ -0.65
NIC96P34077 YJL152WYJL152W 360 nt10.95□□□□□ -0.66
NIC96P34077 YSC84YHR016C 1407 nt10.94□□□□□ -0.66
NIC96P34077 RTS2YOR077W 699 nt10.93□□□□□ -0.66
NIC96P34077 UME6YDR207C 2511 nt10.92□□□□□ -0.66
NIC96P34077 GIS3YLR094C 1509 nt10.9□□□□□ -0.66
NIC96P34077 YMR057CYMR057C 372 nt10.88□□□□□ -0.67
NIC96P34077 WHI5YOR083W 888 nt10.87□□□□□ -0.67
NIC96P34077 BOR1YNL275W 1731 nt10.87□□□□□ -0.67
NIC96P34077 YLR281CYLR281C 468 nt10.86□□□□□ -0.67
NIC96P34077 YHL050CYHL050C 2094 nt10.85□□□□□ -0.67
NIC96P34077 CUE1YMR264W 612 nt10.83□□□□□ -0.68
NIC96P34077 BOP3YNL042W 1191 nt10.83□□□□□ -0.68
NIC96P34077 YJL225CYJL225C 5277 nt10.83□□□□□ -0.68
NIC96P34077 PTK1YKL198C 1989 nt10.8□□□□□ -0.68
NIC96P34077 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.79□□□□□ -0.68
NIC96P34077 YIL100WYIL100W 354 nt10.75□□□□□ -0.69
NIC96P34077 YLR236CYLR236C 324 nt10.73□□□□□ -0.69
NIC96P34077 PUS2YGL063W 1113 nt10.72□□□□□ -0.69
NIC96P34077 IDH1YNL037C 1083 nt10.7□□□□□ -0.7
NIC96P34077 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
NIC96P34077 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
NIC96P34077 RRT12YCR045C 1476 nt10.69□□□□□ -0.7
NIC96P34077 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.67□□□□□ -0.7
NIC96P34077 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.67□□□□□ -0.7
NIC96P34077 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.67□□□□□ -0.7
NIC96P34077 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.67□□□□□ -0.7
NIC96P34077 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.67□□□□□ -0.7
NIC96P34077 IMP2'YIL154C 1041 nt10.67□□□□□ -0.7
NIC96P34077 YNL195CYNL195C 786 nt10.67□□□□□ -0.7
NIC96P34077 RPM1RPM1 483 nt10.66□□□□□ -0.7
NIC96P34077 DSK2YMR276W 1122 nt10.64□□□□□ -0.71
NIC96P34077 GBP2YCL011C 1284 nt10.62□□□□□ -0.71
NIC96P34077 FRE6YLL051C 2139 nt10.58□□□□□ -0.72
NIC96P34077 MCH5YOR306C 1566 nt10.57□□□□□ -0.72
NIC96P34077 YFL054CYFL054C 1941 nt10.56□□□□□ -0.72
NIC96P34077 TCD2YKL027W 1344 nt10.54□□□□□ -0.72
NIC96P34077 SPT8YLR055C 1809 nt10.52□□□□□ -0.73
NIC96P34077 YDR433WYDR433W 441 nt10.52□□□□□ -0.73
NIC96P34077 NCP1YHR042W 2076 nt10.49□□□□□ -0.73
NIC96P34077 RRD1YIL153W 1182 nt10.49□□□□□ -0.73
NIC96P34077 YPR011CYPR011C 981 nt10.49□□□□□ -0.73
NIC96P34077 FMP45YDL222C 930 nt10.47□□□□□ -0.73
NIC96P34077 ALG12YNR030W 1656 nt10.46□□□□□ -0.74
NIC96P34077 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
NIC96P34077 FMP52YER004W 696 nt10.43□□□□□ -0.74
NIC96P34077 DED1YOR204W 1815 nt10.42□□□□□ -0.74
NIC96P34077 ERV46YAL042W 1248 nt10.41□□□□□ -0.74
NIC96P34077 LPX1YOR084W 1164 nt10.41□□□□□ -0.74
NIC96P34077 MXR2YCL033C 507 nt10.41□□□□□ -0.74
NIC96P34077 YKR040CYKR040C 504 nt10.36□□□□□ -0.75
NIC96P34077 FMT1YBL013W 1206 nt10.34□□□□□ -0.75
NIC96P34077 YCL042WYCL042W 360 nt10.33□□□□□ -0.76
NIC96P34077 CWP1YKL096W 720 nt10.32□□□□□ -0.76
NIC96P34077 PCM1YEL058W 1674 nt10.31□□□□□ -0.76
NIC96P34077 ADH2YMR303C 1047 nt10.29□□□□□ -0.76
NIC96P34077 SOR2YDL246C 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
NIC96P34077 SNF6YHL025W 999 nt10.28□□□□□ -0.76
NIC96P34077 SOR1YJR159W 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
NIC96P34077 SWE1YJL187C 2460 nt10.27□□□□□ -0.77
NIC96P34077 GLK1YCL040W 1503 nt10.25□□□□□ -0.77
NIC96P34077 LCB1YMR296C 1677 nt10.25□□□□□ -0.77
NIC96P34077 SIM1YIL123W 1431 nt10.24□□□□□ -0.77
NIC96P34077 FRD1YEL047C 1413 nt10.24□□□□□ -0.77
NIC96P34077 BIO4YNR057C 714 nt10.16□□□□□ -0.78
NIC96P34077 NAR1YNL240C 1476 nt10.16□□□□□ -0.78
NIC96P34077 YIH1YCR059C 777 nt10.12□□□□□ -0.79
NIC96P34077 SPP1YPL138C 1062 nt10.11□□□□□ -0.79
NIC96P34077 RNQ1YCL028W 1218 nt10.1□□□□□ -0.79
NIC96P34077 NME1NME1 340 nt10.08□□□□□ -0.8
NIC96P34077 DIC1YLR348C 897 nt10.07□□□□□ -0.8
NIC96P34077 YLL053CYLL053C 459 nt10.06□□□□□ -0.8
NIC96P34077 PTH1YHR189W 573 nt10.05□□□□□ -0.8
NIC96P34077 ERF2YLR246W 1080 nt10.05□□□□□ -0.8
NIC96P34077 FUR4YBR021W 1902 nt10.04□□□□□ -0.8
NIC96P34077 YLR235CYLR235C 399 nt10.04□□□□□ -0.8
NIC96P34077 AAC1YMR056C 930 nt10.02□□□□□ -0.81
NIC96P34077 LYS4YDR234W 2082 nt10.01□□□□□ -0.81
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