Protein–RNA interactions for Protein: P32829

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, yeastyeast

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRE11P32829 SEC11YIR022W 504 nt12.44□□□□□ -0.42
MRE11P32829 GIS3YLR094C 1509 nt12.4□□□□□ -0.42
MRE11P32829 PCH2YBR186W 1695 nt12.39□□□□□ -0.43
MRE11P32829 NVJ2YPR091C 2313 nt12.39□□□□□ -0.43
MRE11P32829 ART5YGR068C 1761 nt12.37□□□□□ -0.43
MRE11P32829 GFD2YCL036W 1701 nt12.37□□□□□ -0.43
MRE11P32829 YJL225CYJL225C 5277 nt12.33□□□□□ -0.43
MRE11P32829 GUT2YIL155C 1950 nt12.32□□□□□ -0.44
MRE11P32829 HOM6YJR139C 1080 nt12.32□□□□□ -0.44
MRE11P32829 PET9YBL030C 957 nt12.32□□□□□ -0.44
MRE11P32829 YCH1YGR203W 447 nt12.27□□□□□ -0.45
MRE11P32829 SHU1YHL006C 453 nt12.27□□□□□ -0.45
MRE11P32829 RTS2YOR077W 699 nt12.26□□□□□ -0.45
MRE11P32829 YSC84YHR016C 1407 nt12.23□□□□□ -0.45
MRE11P32829 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.21□□□□□ -0.45
MRE11P32829 CUE1YMR264W 612 nt12.2□□□□□ -0.46
MRE11P32829 YHL050CYHL050C 2094 nt12.14□□□□□ -0.47
MRE11P32829 Q0182Q0182 405 nt12.14□□□□□ -0.47
MRE11P32829 RKM5YLR137W 1104 nt12.14□□□□□ -0.47
MRE11P32829 TIR4YOR009W 1464 nt12.14□□□□□ -0.47
MRE11P32829 MNP1YGL068W 585 nt12.13□□□□□ -0.47
MRE11P32829 YNL195CYNL195C 786 nt12.13□□□□□ -0.47
MRE11P32829 YIL100WYIL100W 354 nt12.09□□□□□ -0.47
MRE11P32829 PIB2YGL023C 1908 nt12.08□□□□□ -0.48
MRE11P32829 YMR057CYMR057C 372 nt12.08□□□□□ -0.48
MRE11P32829 RRT12YCR045C 1476 nt12.07□□□□□ -0.48
MRE11P32829 RTF1YGL244W 1677 nt12.06□□□□□ -0.48
MRE11P32829 YLR236CYLR236C 324 nt12.01□□□□□ -0.49
MRE11P32829 BOP3YNL042W 1191 nt12.01□□□□□ -0.49
MRE11P32829 NPL3YDR432W 1245 nt11.95□□□□□ -0.5
MRE11P32829 YKL097CYKL097C 411 nt11.95□□□□□ -0.5
MRE11P32829 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
MRE11P32829 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.94□□□□□ -0.5
MRE11P32829 YJL152WYJL152W 360 nt11.92□□□□□ -0.5
MRE11P32829 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.9□□□□□ -0.5
MRE11P32829 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.89□□□□□ -0.51
MRE11P32829 PTK1YKL198C 1989 nt11.85□□□□□ -0.51
MRE11P32829 YOL037CYOL037C 354 nt11.83□□□□□ -0.52
MRE11P32829 NCP1YHR042W 2076 nt11.77□□□□□ -0.52
MRE11P32829 YFL054CYFL054C 1941 nt11.64□□□□□ -0.55
MRE11P32829 LCB1YMR296C 1677 nt11.62□□□□□ -0.55
MRE11P32829 WHI5YOR083W 888 nt11.6□□□□□ -0.55
MRE11P32829 FMP52YER004W 696 nt11.58□□□□□ -0.56
MRE11P32829 IDH1YNL037C 1083 nt11.58□□□□□ -0.56
MRE11P32829 SPT8YLR055C 1809 nt11.56□□□□□ -0.56
MRE11P32829 YLR281CYLR281C 468 nt11.56□□□□□ -0.56
MRE11P32829 UME6YDR207C 2511 nt11.55□□□□□ -0.56
MRE11P32829 RRD1YIL153W 1182 nt11.55□□□□□ -0.56
MRE11P32829 MOT3YMR070W 1473 nt11.55□□□□□ -0.56
MRE11P32829 GBP2YCL011C 1284 nt11.53□□□□□ -0.56
MRE11P32829 YOR139CYOR139C 393 nt11.5□□□□□ -0.57
MRE11P32829 TCD2YKL027W 1344 nt11.49□□□□□ -0.57
MRE11P32829 SIM1YIL123W 1431 nt11.49□□□□□ -0.57
MRE11P32829 PCM1YEL058W 1674 nt11.48□□□□□ -0.57
MRE11P32829 DED1YOR204W 1815 nt11.44□□□□□ -0.58
MRE11P32829 IMP2'YIL154C 1041 nt11.43□□□□□ -0.58
MRE11P32829 BOR1YNL275W 1731 nt11.43□□□□□ -0.58
MRE11P32829 LYS4YDR234W 2082 nt11.39□□□□□ -0.59
MRE11P32829 SNF6YHL025W 999 nt11.37□□□□□ -0.59
MRE11P32829 FMT1YBL013W 1206 nt11.36□□□□□ -0.59
MRE11P32829 CWP1YKL096W 720 nt11.35□□□□□ -0.59
MRE11P32829 SWE1YJL187C 2460 nt11.34□□□□□ -0.59
MRE11P32829 ADH2YMR303C 1047 nt11.34□□□□□ -0.59
MRE11P32829 BIO4YNR057C 714 nt11.34□□□□□ -0.59
MRE11P32829 DSK2YMR276W 1122 nt11.31□□□□□ -0.6
MRE11P32829 YDR433WYDR433W 441 nt11.28□□□□□ -0.6
MRE11P32829 ERF2YLR246W 1080 nt11.28□□□□□ -0.6
MRE11P32829 PUS2YGL063W 1113 nt11.27□□□□□ -0.61
MRE11P32829 SOR2YDL246C 1074 nt11.26□□□□□ -0.61
MRE11P32829 SOR1YJR159W 1074 nt11.26□□□□□ -0.61
MRE11P32829 YCL042WYCL042W 360 nt11.26□□□□□ -0.61
MRE11P32829 CRR1YLR213C 1269 nt11.21□□□□□ -0.61
MRE11P32829 YIH1YCR059C 777 nt11.2□□□□□ -0.62
MRE11P32829 FMP45YDL222C 930 nt11.2□□□□□ -0.62
MRE11P32829 MXR2YCL033C 507 nt11.2□□□□□ -0.62
MRE11P32829 HSP60YLR259C 1719 nt11.18□□□□□ -0.62
MRE11P32829 RNQ1YCL028W 1218 nt11.16□□□□□ -0.62
MRE11P32829 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.15□□□□□ -0.62
MRE11P32829 YLL053CYLL053C 459 nt11.14□□□□□ -0.63
MRE11P32829 ERV46YAL042W 1248 nt11.13□□□□□ -0.63
MRE11P32829 YKR040CYKR040C 504 nt11.13□□□□□ -0.63
MRE11P32829 RPM1RPM1 483 nt11.13□□□□□ -0.63
MRE11P32829 HEM12YDR047W 1089 nt11.12□□□□□ -0.63
MRE11P32829 GLK1YCL040W 1503 nt11.12□□□□□ -0.63
MRE11P32829 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.11□□□□□ -0.63
MRE11P32829 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.11□□□□□ -0.63
MRE11P32829 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.11□□□□□ -0.63
MRE11P32829 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.11□□□□□ -0.63
MRE11P32829 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.11□□□□□ -0.63
MRE11P32829 YPR011CYPR011C 981 nt11.11□□□□□ -0.63
MRE11P32829 YFL067WYFL067W 528 nt11.1□□□□□ -0.63
MRE11P32829 MCH5YOR306C 1566 nt11.1□□□□□ -0.63
MRE11P32829 FRD1YEL047C 1413 nt11.09□□□□□ -0.63
MRE11P32829 RAX1YOR301W 1308 nt11.09□□□□□ -0.63
MRE11P32829 ATF2YGR177C 1608 nt11.07□□□□□ -0.64
MRE11P32829 LPX1YOR084W 1164 nt11.06□□□□□ -0.64
MRE11P32829 MIC10YCL057C-A 294 nt11.05□□□□□ -0.64
MRE11P32829 FUR4YBR021W 1902 nt11.04□□□□□ -0.64
MRE11P32829 FTR1YER145C 1215 nt11.04□□□□□ -0.64
MRE11P32829 SNG1YGR197C 1644 nt11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68 ms