Protein–RNA interactions for Protein: P32259

SIN4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, yeastyeast

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN4P32259 YGR021WYGR021W 873 nt12.21□□□□□ -0.45
SIN4P32259 SIS1YNL007C 1059 nt12.21□□□□□ -0.45
SIN4P32259 WWM1YFL010C 636 nt12.2□□□□□ -0.46
SIN4P32259 NVJ2YPR091C 2313 nt12.2□□□□□ -0.46
SIN4P32259 HOM6YJR139C 1080 nt12.19□□□□□ -0.46
SIN4P32259 CCT6YDR188W 1641 nt12.18□□□□□ -0.46
SIN4P32259 MNP1YGL068W 585 nt12.17□□□□□ -0.46
SIN4P32259 YSC84YHR016C 1407 nt12.15□□□□□ -0.46
SIN4P32259 PIB2YGL023C 1908 nt12.13□□□□□ -0.47
SIN4P32259 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.13□□□□□ -0.47
SIN4P32259 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.13□□□□□ -0.47
SIN4P32259 GFD2YCL036W 1701 nt12.1□□□□□ -0.47
SIN4P32259 LSM3YLR438C-A 270 nt12.09□□□□□ -0.47
SIN4P32259 YOL037CYOL037C 354 nt12.09□□□□□ -0.47
SIN4P32259 ART5YGR068C 1761 nt12.08□□□□□ -0.48
SIN4P32259 YHL050CYHL050C 2094 nt12.06□□□□□ -0.48
SIN4P32259 RTS2YOR077W 699 nt12.05□□□□□ -0.48
SIN4P32259 RTF1YGL244W 1677 nt12.03□□□□□ -0.48
SIN4P32259 RKM5YLR137W 1104 nt12.01□□□□□ -0.49
SIN4P32259 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.99□□□□□ -0.49
SIN4P32259 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.99□□□□□ -0.49
SIN4P32259 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.99□□□□□ -0.49
SIN4P32259 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.99□□□□□ -0.49
SIN4P32259 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.99□□□□□ -0.49
SIN4P32259 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.99□□□□□ -0.49
SIN4P32259 PET9YBL030C 957 nt11.97□□□□□ -0.49
SIN4P32259 RRT12YCR045C 1476 nt11.96□□□□□ -0.49
SIN4P32259 CUE1YMR264W 612 nt11.93□□□□□ -0.5
SIN4P32259 BOP3YNL042W 1191 nt11.93□□□□□ -0.5
SIN4P32259 YNL195CYNL195C 786 nt11.89□□□□□ -0.51
SIN4P32259 PTK1YKL198C 1989 nt11.86□□□□□ -0.51
SIN4P32259 YCH1YGR203W 447 nt11.85□□□□□ -0.51
SIN4P32259 YIL100WYIL100W 354 nt11.81□□□□□ -0.52
SIN4P32259 YLR281CYLR281C 468 nt11.81□□□□□ -0.52
SIN4P32259 PUS2YGL063W 1113 nt11.8□□□□□ -0.52
SIN4P32259 TIR4YOR009W 1464 nt11.79□□□□□ -0.52
SIN4P32259 YMR057CYMR057C 372 nt11.74□□□□□ -0.53
SIN4P32259 WHI5YOR083W 888 nt11.72□□□□□ -0.53
SIN4P32259 FPS1YLL043W 2010 nt11.69□□□□□ -0.54
SIN4P32259 NCP1YHR042W 2076 nt11.69□□□□□ -0.54
SIN4P32259 YLR236CYLR236C 324 nt11.67□□□□□ -0.54
SIN4P32259 MOT3YMR070W 1473 nt11.63□□□□□ -0.55
SIN4P32259 YFL054CYFL054C 1941 nt11.62□□□□□ -0.55
SIN4P32259 BOR1YNL275W 1731 nt11.59□□□□□ -0.55
SIN4P32259 SPT8YLR055C 1809 nt11.55□□□□□ -0.56
SIN4P32259 YJL225CYJL225C 5277 nt11.51□□□□□ -0.57
SIN4P32259 Q0182Q0182 405 nt11.51□□□□□ -0.57
SIN4P32259 YPR011CYPR011C 981 nt11.51□□□□□ -0.57
SIN4P32259 FMP45YDL222C 930 nt11.49□□□□□ -0.57
SIN4P32259 DSK2YMR276W 1122 nt11.49□□□□□ -0.57
SIN4P32259 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.48□□□□□ -0.57
SIN4P32259 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.46□□□□□ -0.57
SIN4P32259 LCB1YMR296C 1677 nt11.46□□□□□ -0.58
SIN4P32259 IMP2'YIL154C 1041 nt11.45□□□□□ -0.58
SIN4P32259 YJL152WYJL152W 360 nt11.43□□□□□ -0.58
SIN4P32259 UME6YDR207C 2511 nt11.36□□□□□ -0.59
SIN4P32259 SWE1YJL187C 2460 nt11.32□□□□□ -0.6
SIN4P32259 HSP60YLR259C 1719 nt11.29□□□□□ -0.6
SIN4P32259 MRPL8YJL063C 717 nt11.28□□□□□ -0.6
SIN4P32259 LPX1YOR084W 1164 nt11.24□□□□□ -0.61
SIN4P32259 LYS4YDR234W 2082 nt11.23□□□□□ -0.61
SIN4P32259 SIM1YIL123W 1431 nt11.22□□□□□ -0.61
SIN4P32259 ERV46YAL042W 1248 nt11.21□□□□□ -0.61
SIN4P32259 IDH1YNL037C 1083 nt11.21□□□□□ -0.61
SIN4P32259 RRD1YIL153W 1182 nt11.17□□□□□ -0.62
SIN4P32259 SPP1YPL138C 1062 nt11.17□□□□□ -0.62
SIN4P32259 ALG12YNR030W 1656 nt11.15□□□□□ -0.62
SIN4P32259 YDR433WYDR433W 441 nt11.15□□□□□ -0.62
SIN4P32259 FMP52YER004W 696 nt11.15□□□□□ -0.62
SIN4P32259 GLK1YCL040W 1503 nt11.14□□□□□ -0.63
SIN4P32259 PCM1YEL058W 1674 nt11.14□□□□□ -0.63
SIN4P32259 MCH5YOR306C 1566 nt11.12□□□□□ -0.63
SIN4P32259 ADO1YJR105W 1023 nt11.12□□□□□ -0.63
SIN4P32259 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.1□□□□□ -0.63
SIN4P32259 YEL076CYEL076C 651 nt11.1□□□□□ -0.63
SIN4P32259 YKR040CYKR040C 504 nt11.1□□□□□ -0.63
SIN4P32259 YLR464WYLR464W 651 nt11.1□□□□□ -0.63
SIN4P32259 GBP2YCL011C 1284 nt11.08□□□□□ -0.64
SIN4P32259 BIO4YNR057C 714 nt11.06□□□□□ -0.64
SIN4P32259 RTG1YOL067C 534 nt11.06□□□□□ -0.64
SIN4P32259 FUR4YBR021W 1902 nt11.03□□□□□ -0.64
SIN4P32259 DED1YOR204W 1815 nt11.03□□□□□ -0.64
SIN4P32259 MXR2YCL033C 507 nt11.03□□□□□ -0.64
SIN4P32259 TCD2YKL027W 1344 nt11□□□□□ -0.65
SIN4P32259 SNF6YHL025W 999 nt10.99□□□□□ -0.65
SIN4P32259 FMT1YBL013W 1206 nt10.99□□□□□ -0.65
SIN4P32259 UBX6YJL048C 1191 nt10.98□□□□□ -0.65
SIN4P32259 ADH2YMR303C 1047 nt10.98□□□□□ -0.65
SIN4P32259 CWP1YKL096W 720 nt10.97□□□□□ -0.65
SIN4P32259 ERF2YLR246W 1080 nt10.97□□□□□ -0.65
SIN4P32259 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.94□□□□□ -0.66
SIN4P32259 CRR1YLR213C 1269 nt10.94□□□□□ -0.66
SIN4P32259 PRP4YPR178W 1398 nt10.91□□□□□ -0.66
SIN4P32259 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.9□□□□□ -0.66
SIN4P32259 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.9□□□□□ -0.66
SIN4P32259 CCA1YER168C 1641 nt10.89□□□□□ -0.67
SIN4P32259 AAC1YMR056C 930 nt10.89□□□□□ -0.67
SIN4P32259 HUA1YGR268C 597 nt10.86□□□□□ -0.67
SIN4P32259 RAX1YOR301W 1308 nt10.85□□□□□ -0.67
SIN4P32259 HEM12YDR047W 1089 nt10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms