Protein–RNA interactions for Protein: P24276

SSD1, Protein SSD1, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSD1P24276 PUS2YGL063W 1113 nt13.42□□□□□ -0.26
SSD1P24276 MEP2YNL142W 1500 nt13.39□□□□□ -0.27
SSD1P24276 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.38□□□□□ -0.27
SSD1P24276 SIS1YNL007C 1059 nt13.38□□□□□ -0.27
SSD1P24276 RPP2AYOL039W 321 nt13.3□□□□□ -0.28
SSD1P24276 PTP1YDL230W 1008 nt13.25□□□□□ -0.29
SSD1P24276 IMP2'YIL154C 1041 nt13.22□□□□□ -0.29
SSD1P24276 DSK2YMR276W 1122 nt13.22□□□□□ -0.29
SSD1P24276 TIR4YOR009W 1464 nt13.19□□□□□ -0.3
SSD1P24276 YJL152WYJL152W 360 nt13.18□□□□□ -0.3
SSD1P24276 YLR236CYLR236C 324 nt13.18□□□□□ -0.3
SSD1P24276 YCH1YGR203W 447 nt13.17□□□□□ -0.3 RIP-Chip
SSD1P24276 YPR011CYPR011C 981 nt13.17□□□□□ -0.3
SSD1P24276 DCW1YKL046C 1350 nt13.16□□□□□ -0.3
SSD1P24276 ART5YGR068C 1761 nt13.13□□□□□ -0.31
SSD1P24276 PET9YBL030C 957 nt13.1□□□□□ -0.31
SSD1P24276 FMP45YDL222C 930 nt13.09□□□□□ -0.31
SSD1P24276 CAC2YML102W 1407 nt13.09□□□□□ -0.31
SSD1P24276 GFD2YCL036W 1701 nt13.09□□□□□ -0.31
SSD1P24276 IDH1YNL037C 1083 nt13.04□□□□□ -0.32
SSD1P24276 EMI2YDR516C 1503 nt13.02□□□□□ -0.33
SSD1P24276 YMR057CYMR057C 372 nt13□□□□□ -0.33
SSD1P24276 ERV46YAL042W 1248 nt12.96□□□□□ -0.33
SSD1P24276 YDL221WYDL221W 552 nt12.95□□□□□ -0.34
SSD1P24276 SSA4YER103W 1929 nt12.95□□□□□ -0.34
SSD1P24276 LPX1YOR084W 1164 nt12.92□□□□□ -0.34
SSD1P24276 GBP2YCL011C 1284 nt12.91□□□□□ -0.34
SSD1P24276 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.91□□□□□ -0.34
SSD1P24276 IRC15YPL017C 1500 nt12.91□□□□□ -0.34
SSD1P24276 YMR090WYMR090W 684 nt12.9□□□□□ -0.34
SSD1P24276 RTS2YOR077W 699 nt12.88□□□□□ -0.35
SSD1P24276 YDR433WYDR433W 441 nt12.87□□□□□ -0.35
SSD1P24276 FPS1YLL043W 2010 nt12.85□□□□□ -0.35
SSD1P24276 YKR040CYKR040C 504 nt12.81□□□□□ -0.36
SSD1P24276 CUE1YMR264W 612 nt12.81□□□□□ -0.36
SSD1P24276 GIS3YLR094C 1509 nt12.79□□□□□ -0.36
SSD1P24276 MXR2YCL033C 507 nt12.77□□□□□ -0.37
SSD1P24276 TCD2YKL027W 1344 nt12.76□□□□□ -0.37
SSD1P24276 SDH1YKL148C 1923 nt12.76□□□□□ -0.37
SSD1P24276 YBR220CYBR220C 1683 nt12.73□□□□□ -0.37
SSD1P24276 RRD1YIL153W 1182 nt12.72□□□□□ -0.37
SSD1P24276 SPP1YPL138C 1062 nt12.71□□□□□ -0.37
SSD1P24276 DED1YOR204W 1815 nt12.71□□□□□ -0.38
SSD1P24276 SCC4YER147C 1875 nt12.7□□□□□ -0.38
SSD1P24276 MRPL8YJL063C 717 nt12.63□□□□□ -0.39
SSD1P24276 YIL100WYIL100W 354 nt12.62□□□□□ -0.39
SSD1P24276 FRD1YEL047C 1413 nt12.58□□□□□ -0.4
SSD1P24276 FMT1YBL013W 1206 nt12.57□□□□□ -0.4
SSD1P24276 SOR2YDL246C 1074 nt12.55□□□□□ -0.4
SSD1P24276 FMP52YER004W 696 nt12.55□□□□□ -0.4
SSD1P24276 SOR1YJR159W 1074 nt12.55□□□□□ -0.4
SSD1P24276 RTG1YOL067C 534 nt12.55□□□□□ -0.4
SSD1P24276 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.5□□□□□ -0.41
SSD1P24276 YEL076CYEL076C 651 nt12.5□□□□□ -0.41
SSD1P24276 YLR464WYLR464W 651 nt12.5□□□□□ -0.41
SSD1P24276 YCL042WYCL042W 360 nt12.5□□□□□ -0.41
SSD1P24276 ADO1YJR105W 1023 nt12.47□□□□□ -0.41
SSD1P24276 BDF1YLR399C 2061 nt12.43□□□□□ -0.42
SSD1P24276 CWP1YKL096W 720 nt12.4□□□□□ -0.42
SSD1P24276 ADH2YMR303C 1047 nt12.39□□□□□ -0.43
SSD1P24276 YNL195CYNL195C 786 nt12.39□□□□□ -0.43
SSD1P24276 PTH1YHR189W 573 nt12.35□□□□□ -0.43
SSD1P24276 YSC84YHR016C 1407 nt12.35□□□□□ -0.43
SSD1P24276 PCM1YEL058W 1674 nt12.35□□□□□ -0.43
SSD1P24276 RRT12YCR045C 1476 nt12.34□□□□□ -0.43
SSD1P24276 YLR235CYLR235C 399 nt12.34□□□□□ -0.43
SSD1P24276 YHL050CYHL050C 2094 nt12.32□□□□□ -0.44
SSD1P24276 HUA1YGR268C 597 nt12.29□□□□□ -0.44
SSD1P24276 SNF6YHL025W 999 nt12.29□□□□□ -0.44
SSD1P24276 YKL030WYKL030W 606 nt12.29□□□□□ -0.44
SSD1P24276 TAT1YBR069C 1860 nt12.29□□□□□ -0.44
SSD1P24276 SEC11YIR022W 504 nt12.26□□□□□ -0.45
SSD1P24276 LCB1YMR296C 1677 nt12.22□□□□□ -0.45
SSD1P24276 DIC1YLR348C 897 nt12.22□□□□□ -0.45
SSD1P24276 YIH1YCR059C 777 nt12.21□□□□□ -0.45
SSD1P24276 RNQ1YCL028W 1218 nt12.2□□□□□ -0.46
SSD1P24276 TIM23YNR017W 669 nt12.16□□□□□ -0.46
SSD1P24276 PCH2YBR186W 1695 nt12.14□□□□□ -0.47
SSD1P24276 BIO4YNR057C 714 nt12.12□□□□□ -0.47
SSD1P24276 SIM1YIL123W 1431 nt12.11□□□□□ -0.47 RIP-Chip
SSD1P24276 UBX6YJL048C 1191 nt12.09□□□□□ -0.47
SSD1P24276 YLR179CYLR179C 606 nt12.08□□□□□ -0.48
SSD1P24276 GUT2YIL155C 1950 nt12.07□□□□□ -0.48
SSD1P24276 YLL053CYLL053C 459 nt12.06□□□□□ -0.48
SSD1P24276 YDR094WYDR094W 336 nt12.04□□□□□ -0.48
SSD1P24276 FTR1YER145C 1215 nt12.01□□□□□ -0.49
SSD1P24276 WSC2YNL283C 1512 nt12.01□□□□□ -0.49 RIP-Chip
SSD1P24276 NCP1YHR042W 2076 nt12□□□□□ -0.49
SSD1P24276 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12□□□□□ -0.49
SSD1P24276 AHT1YHR093W 549 nt12□□□□□ -0.49
SSD1P24276 YPR064WYPR064W 420 nt12□□□□□ -0.49
SSD1P24276 AQY1YPR192W 918 nt11.99□□□□□ -0.49
SSD1P24276 GAL1YBR020W 1587 nt11.96□□□□□ -0.49
SSD1P24276 TAD3YLR316C 969 nt11.94□□□□□ -0.5
SSD1P24276 ERF2YLR246W 1080 nt11.93□□□□□ -0.5
SSD1P24276 PIB2YGL023C 1908 nt11.92□□□□□ -0.5
SSD1P24276 BOP3YNL042W 1191 nt11.92□□□□□ -0.5
SSD1P24276 TRM5YHR070W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
SSD1P24276 RTF1YGL244W 1677 nt11.91□□□□□ -0.5
SSD1P24276 CRR1YLR213C 1269 nt11.89□□□□□ -0.51
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