Protein–RNA interactions for Protein: P23246

SFPQ, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFPQP23246 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 THUMPD3-AS1-208ENST00000498199 511 ntTSL 217.84■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 THUMPD3-AS1-213ENST00000520629 415 ntTSL 317.77■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 04e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 AKT2-213ENST00000452077 577 ntTSL 313.28□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 AKT2-229ENST00000578123 564 ntTSL 412.19□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 AKT2-202ENST00000358335 546 ntTSL 411.19□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-207ENST00000421427 804 ntTSL 310.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 AKT2-241ENST00000596634 583 ntTSL 510.85□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 AKT2-209ENST00000423127 798 ntTSL 510.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-206ENST00000420747 685 ntTSL 38.67□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 58.39□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.434e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-209ENST00000437725 545 ntTSL 45.73□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.514e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-210ENST00000453013 733 ntTSL 25.61□□□□□ -1.514e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 THUMPD3-AS1-214ENST00000521267 851 ntTSL 35.27□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-205ENST00000417013 554 ntTSL 24.77□□□□□ -1.654e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 550 ntTSL 34.06□□□□□ -1.764e-7■■■■■ 30.9
SFPQP23246 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.756e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.426e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.356e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 522.91■■□□□ 1.266e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 221.44■■□□□ 1.026e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 219.9■□□□□ 0.786e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 415.13■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 PQLC1-209ENST00000589000 558 ntTSL 412.86□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 30.8
SFPQP23246 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 30.5
SFPQP23246 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 30.2
SFPQP23246 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 30
SFPQP23246 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 39.29□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 29.7
SFPQP23246 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 29.1
SFPQP23246 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.951e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.321e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 322.6■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 221.06■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 420.2■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 TAF4-206ENST00000608458 2147 ntTSL 220.09■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-212ENST00000588381 484 ntTSL 319.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 519.52■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-224ENST00000568435 935 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 218.56■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CCNI-205ENST00000507788 595 ntTSL 418.52■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 518.09■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 417.16■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ACTN1-217ENST00000556203 564 ntTSL 316.9■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 FADS2-213ENST00000523235 5073 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.8■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.37■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 215.81■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDH2-203ENST00000413878 563 ntTSL 415.62■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-203ENST00000562579 577 ntTSL 515.52■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 515.48■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 AC098617.1-201ENST00000424116 500 ntTSL 214.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 FADS2-203ENST00000355484 2107 ntTSL 214.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-211ENST00000586768 548 ntTSL 413.8□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CCNI-209ENST00000515790 390 ntTSL 212.3□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-210ENST00000563987 586 ntTSL 212.1□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 ALDOA-205ENST00000562168 666 ntTSL 311.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CDIP1-210ENST00000586728 756 ntTSL 511.12□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CCNI-207ENST00000513774 517 ntTSL 48.9□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 SORBS2-249ENST00000476878 595 ntTSL 38.33□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 FADS2-208ENST00000521571 799 ntTSL 37.74□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 29
SFPQP23246 CCNI-203ENST00000505609 541 ntTSL 47.12□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 29
Retrieved 100 of 4,991 protein–RNA pairs in 28.6 ms