Protein–RNA interactions for Protein: P20485

CKI1, Choline kinase, yeastyeast

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CKI1P20485 IRC15YPL017C 1500 nt13.18□□□□□ -0.3
CKI1P20485 ART5YGR068C 1761 nt13.16□□□□□ -0.3
CKI1P20485 YKL097CYKL097C 411 nt13.15□□□□□ -0.3
CKI1P20485 GFD2YCL036W 1701 nt13.13□□□□□ -0.31
CKI1P20485 SCC4YER147C 1875 nt13.13□□□□□ -0.31
CKI1P20485 RKM5YLR137W 1104 nt13.13□□□□□ -0.31
CKI1P20485 GIS3YLR094C 1509 nt13.1□□□□□ -0.31
CKI1P20485 RTS2YOR077W 699 nt13.07□□□□□ -0.32
CKI1P20485 PET9YBL030C 957 nt13.04□□□□□ -0.32
CKI1P20485 TIR4YOR009W 1464 nt13□□□□□ -0.33
CKI1P20485 YCH1YGR203W 447 nt12.97□□□□□ -0.33
CKI1P20485 SEC11YIR022W 504 nt12.92□□□□□ -0.34
CKI1P20485 YMR057CYMR057C 372 nt12.91□□□□□ -0.34
CKI1P20485 PCH2YBR186W 1695 nt12.9□□□□□ -0.34
CKI1P20485 CUE1YMR264W 612 nt12.9□□□□□ -0.34
CKI1P20485 YSC84YHR016C 1407 nt12.88□□□□□ -0.35
CKI1P20485 NPL3YDR432W 1245 nt12.86□□□□□ -0.35
CKI1P20485 GUT2YIL155C 1950 nt12.83□□□□□ -0.35
CKI1P20485 YJL152WYJL152W 360 nt12.83□□□□□ -0.36
CKI1P20485 YOL037CYOL037C 354 nt12.82□□□□□ -0.36
CKI1P20485 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.81□□□□□ -0.36
CKI1P20485 YIL100WYIL100W 354 nt12.78□□□□□ -0.36
CKI1P20485 YHL050CYHL050C 2094 nt12.77□□□□□ -0.36
CKI1P20485 FPS1YLL043W 2010 nt12.77□□□□□ -0.37
CKI1P20485 RRT12YCR045C 1476 nt12.76□□□□□ -0.37
CKI1P20485 YNL195CYNL195C 786 nt12.74□□□□□ -0.37
CKI1P20485 YLR236CYLR236C 324 nt12.71□□□□□ -0.37
CKI1P20485 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.7□□□□□ -0.38
CKI1P20485 YOR139CYOR139C 393 nt12.68□□□□□ -0.38
CKI1P20485 PIB2YGL023C 1908 nt12.61□□□□□ -0.39
CKI1P20485 RTF1YGL244W 1677 nt12.59□□□□□ -0.39
CKI1P20485 WHI5YOR083W 888 nt12.59□□□□□ -0.39
CKI1P20485 PAC11YDR488C 1602 nt12.55□□□□□ -0.4
CKI1P20485 YLR281CYLR281C 468 nt12.55□□□□□ -0.4
CKI1P20485 BOP3YNL042W 1191 nt12.52□□□□□ -0.41
CKI1P20485 IDH1YNL037C 1083 nt12.45□□□□□ -0.42
CKI1P20485 GBP2YCL011C 1284 nt12.41□□□□□ -0.42
CKI1P20485 PTK1YKL198C 1989 nt12.38□□□□□ -0.43
CKI1P20485 RRD1YIL153W 1182 nt12.38□□□□□ -0.43
CKI1P20485 NCP1YHR042W 2076 nt12.36□□□□□ -0.43
CKI1P20485 PUS2YGL063W 1113 nt12.33□□□□□ -0.44
CKI1P20485 TCD2YKL027W 1344 nt12.33□□□□□ -0.44
CKI1P20485 LCB1YMR296C 1677 nt12.31□□□□□ -0.44
CKI1P20485 DED1YOR204W 1815 nt12.3□□□□□ -0.44
CKI1P20485 IMP2'YIL154C 1041 nt12.29□□□□□ -0.44
CKI1P20485 DSK2YMR276W 1122 nt12.29□□□□□ -0.44
CKI1P20485 FMP52YER004W 696 nt12.28□□□□□ -0.44
CKI1P20485 YDR433WYDR433W 441 nt12.23□□□□□ -0.45
CKI1P20485 PCM1YEL058W 1674 nt12.22□□□□□ -0.45
CKI1P20485 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CKI1P20485 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CKI1P20485 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CKI1P20485 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CKI1P20485 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.22□□□□□ -0.45
CKI1P20485 FMT1YBL013W 1206 nt12.22□□□□□ -0.45
CKI1P20485 SIM1YIL123W 1431 nt12.2□□□□□ -0.46
CKI1P20485 YFL054CYFL054C 1941 nt12.19□□□□□ -0.46
CKI1P20485 YPR011CYPR011C 981 nt12.18□□□□□ -0.46
CKI1P20485 MXR2YCL033C 507 nt12.18□□□□□ -0.46
CKI1P20485 NVJ2YPR091C 2313 nt12.18□□□□□ -0.46
CKI1P20485 CWP1YKL096W 720 nt12.17□□□□□ -0.46
CKI1P20485 ADH2YMR303C 1047 nt12.16□□□□□ -0.46
CKI1P20485 FMP45YDL222C 930 nt12.15□□□□□ -0.46
CKI1P20485 SNF6YHL025W 999 nt12.13□□□□□ -0.47
CKI1P20485 BIO4YNR057C 714 nt12.08□□□□□ -0.48
CKI1P20485 LPX1YOR084W 1164 nt12.08□□□□□ -0.48
CKI1P20485 YCL042WYCL042W 360 nt12.07□□□□□ -0.48
CKI1P20485 SPT8YLR055C 1809 nt12.07□□□□□ -0.48
CKI1P20485 SOR2YDL246C 1074 nt12.06□□□□□ -0.48
CKI1P20485 SOR1YJR159W 1074 nt12.06□□□□□ -0.48
CKI1P20485 ERV46YAL042W 1248 nt12.06□□□□□ -0.48
CKI1P20485 LYS4YDR234W 2082 nt12.02□□□□□ -0.48
CKI1P20485 YKR040CYKR040C 504 nt12.02□□□□□ -0.49
CKI1P20485 FRD1YEL047C 1413 nt11.97□□□□□ -0.49
CKI1P20485 YIH1YCR059C 777 nt11.94□□□□□ -0.5
CKI1P20485 ERF2YLR246W 1080 nt11.92□□□□□ -0.5
CKI1P20485 YLL053CYLL053C 459 nt11.91□□□□□ -0.5
CKI1P20485 RNQ1YCL028W 1218 nt11.9□□□□□ -0.5
CKI1P20485 CRR1YLR213C 1269 nt11.88□□□□□ -0.51
CKI1P20485 SWE1YJL187C 2460 nt11.88□□□□□ -0.51
CKI1P20485 DIC1YLR348C 897 nt11.81□□□□□ -0.52
CKI1P20485 ATF2YGR177C 1608 nt11.81□□□□□ -0.52
CKI1P20485 HEM12YDR047W 1089 nt11.79□□□□□ -0.52
CKI1P20485 FTR1YER145C 1215 nt11.78□□□□□ -0.52
CKI1P20485 MIC10YCL057C-A 294 nt11.78□□□□□ -0.52
CKI1P20485 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.76□□□□□ -0.53
CKI1P20485 BOR1YNL275W 1731 nt11.75□□□□□ -0.53
CKI1P20485 YFL067WYFL067W 528 nt11.75□□□□□ -0.53
CKI1P20485 TRM5YHR070W 1500 nt11.75□□□□□ -0.53
CKI1P20485 GAL1YBR020W 1587 nt11.75□□□□□ -0.53
CKI1P20485 SNG1YGR197C 1644 nt11.74□□□□□ -0.53
CKI1P20485 PTH1YHR189W 573 nt11.71□□□□□ -0.53
CKI1P20485 DDR2YOL052C-A 186 nt11.71□□□□□ -0.53
CKI1P20485 SPP1YPL138C 1062 nt11.69□□□□□ -0.54
CKI1P20485 RAX1YOR301W 1308 nt11.68□□□□□ -0.54
CKI1P20485 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.64□□□□□ -0.55
CKI1P20485 YLR235CYLR235C 399 nt11.63□□□□□ -0.55
CKI1P20485 CCA1YER168C 1641 nt11.62□□□□□ -0.55
CKI1P20485 HSP60YLR259C 1719 nt11.61□□□□□ -0.55
CKI1P20485 TIM23YNR017W 669 nt11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms