Protein–RNA interactions for Protein: P19516

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COX11P19516 SIS1YNL007C 1059 nt13.14□□□□□ -0.31
COX11P19516 RPP2AYOL039W 321 nt13.12□□□□□ -0.31
COX11P19516 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.11□□□□□ -0.31
COX11P19516 PUS2YGL063W 1113 nt13.1□□□□□ -0.31
COX11P19516 MOT3YMR070W 1473 nt13.09□□□□□ -0.31
COX11P19516 DCW1YKL046C 1350 nt13.04□□□□□ -0.32
COX11P19516 PTP1YDL230W 1008 nt13.03□□□□□ -0.32
COX11P19516 YJL152WYJL152W 360 nt13.03□□□□□ -0.32
COX11P19516 TIR4YOR009W 1464 nt12.97□□□□□ -0.33
COX11P19516 ART5YGR068C 1761 nt12.95□□□□□ -0.34
COX11P19516 CAC2YML102W 1407 nt12.92□□□□□ -0.34
COX11P19516 DSK2YMR276W 1122 nt12.89□□□□□ -0.35
COX11P19516 EMI2YDR516C 1503 nt12.88□□□□□ -0.35
COX11P19516 GFD2YCL036W 1701 nt12.88□□□□□ -0.35
COX11P19516 YCH1YGR203W 447 nt12.88□□□□□ -0.35
COX11P19516 PET9YBL030C 957 nt12.88□□□□□ -0.35
COX11P19516 IMP2'YIL154C 1041 nt12.85□□□□□ -0.35
COX11P19516 SSA4YER103W 1929 nt12.85□□□□□ -0.35
COX11P19516 YLR236CYLR236C 324 nt12.84□□□□□ -0.35
COX11P19516 YMR057CYMR057C 372 nt12.83□□□□□ -0.36
COX11P19516 YPR011CYPR011C 981 nt12.81□□□□□ -0.36
COX11P19516 YMR090WYMR090W 684 nt12.8□□□□□ -0.36
COX11P19516 YDL221WYDL221W 552 nt12.79□□□□□ -0.36
COX11P19516 IDH1YNL037C 1083 nt12.79□□□□□ -0.36
COX11P19516 FMP45YDL222C 930 nt12.78□□□□□ -0.36
COX11P19516 RTS2YOR077W 699 nt12.77□□□□□ -0.37
COX11P19516 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.74□□□□□ -0.37
COX11P19516 IRC15YPL017C 1500 nt12.72□□□□□ -0.37
COX11P19516 GBP2YCL011C 1284 nt12.68□□□□□ -0.38
COX11P19516 YDR433WYDR433W 441 nt12.65□□□□□ -0.38
COX11P19516 GIS3YLR094C 1509 nt12.64□□□□□ -0.39
COX11P19516 LPX1YOR084W 1164 nt12.63□□□□□ -0.39
COX11P19516 FPS1YLL043W 2010 nt12.61□□□□□ -0.39
COX11P19516 CUE1YMR264W 612 nt12.61□□□□□ -0.39
COX11P19516 SDH1YKL148C 1923 nt12.6□□□□□ -0.39
COX11P19516 YBR220CYBR220C 1683 nt12.58□□□□□ -0.4
COX11P19516 ERV46YAL042W 1248 nt12.58□□□□□ -0.4
COX11P19516 SCC4YER147C 1875 nt12.56□□□□□ -0.4
COX11P19516 MXR2YCL033C 507 nt12.53□□□□□ -0.4
COX11P19516 TCD2YKL027W 1344 nt12.53□□□□□ -0.4
COX11P19516 YKR040CYKR040C 504 nt12.5□□□□□ -0.41
COX11P19516 YIL100WYIL100W 354 nt12.49□□□□□ -0.41
COX11P19516 RRD1YIL153W 1182 nt12.45□□□□□ -0.42
COX11P19516 DED1YOR204W 1815 nt12.41□□□□□ -0.42
COX11P19516 SPP1YPL138C 1062 nt12.4□□□□□ -0.42
COX11P19516 FMT1YBL013W 1206 nt12.31□□□□□ -0.44
COX11P19516 YNL195CYNL195C 786 nt12.3□□□□□ -0.44
COX11P19516 YCL042WYCL042W 360 nt12.3□□□□□ -0.44
COX11P19516 BDF1YLR399C 2061 nt12.28□□□□□ -0.44
COX11P19516 FRD1YEL047C 1413 nt12.28□□□□□ -0.44
COX11P19516 FMP52YER004W 696 nt12.27□□□□□ -0.45
COX11P19516 YSC84YHR016C 1407 nt12.24□□□□□ -0.45
COX11P19516 RRT12YCR045C 1476 nt12.23□□□□□ -0.45
COX11P19516 SOR2YDL246C 1074 nt12.23□□□□□ -0.45
COX11P19516 SOR1YJR159W 1074 nt12.23□□□□□ -0.45
COX11P19516 CWP1YKL096W 720 nt12.23□□□□□ -0.45
COX11P19516 ADH2YMR303C 1047 nt12.18□□□□□ -0.46
COX11P19516 YHL050CYHL050C 2094 nt12.15□□□□□ -0.46
COX11P19516 PCM1YEL058W 1674 nt12.14□□□□□ -0.47
COX11P19516 PTH1YHR189W 573 nt12.14□□□□□ -0.47
COX11P19516 TAT1YBR069C 1860 nt12.14□□□□□ -0.47
COX11P19516 SEC11YIR022W 504 nt12.13□□□□□ -0.47
COX11P19516 MRPL8YJL063C 717 nt12.13□□□□□ -0.47
COX11P19516 RTG1YOL067C 534 nt12.13□□□□□ -0.47
COX11P19516 SNF6YHL025W 999 nt12.11□□□□□ -0.47
COX11P19516 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.1□□□□□ -0.47
COX11P19516 YEL076CYEL076C 651 nt12.1□□□□□ -0.47
COX11P19516 YLR464WYLR464W 651 nt12.1□□□□□ -0.47
COX11P19516 YLR235CYLR235C 399 nt12.06□□□□□ -0.48
COX11P19516 ADO1YJR105W 1023 nt12.04□□□□□ -0.48
COX11P19516 PCH2YBR186W 1695 nt12.03□□□□□ -0.48
COX11P19516 YKL030WYKL030W 606 nt12□□□□□ -0.49
COX11P19516 DIC1YLR348C 897 nt11.99□□□□□ -0.49
COX11P19516 SIM1YIL123W 1431 nt11.96□□□□□ -0.49
COX11P19516 LCB1YMR296C 1677 nt11.95□□□□□ -0.5
COX11P19516 HUA1YGR268C 597 nt11.95□□□□□ -0.5
COX11P19516 RNQ1YCL028W 1218 nt11.95□□□□□ -0.5
COX11P19516 GUT2YIL155C 1950 nt11.94□□□□□ -0.5
COX11P19516 YIH1YCR059C 777 nt11.94□□□□□ -0.5
COX11P19516 BIO4YNR057C 714 nt11.92□□□□□ -0.5
COX11P19516 TIM23YNR017W 669 nt11.91□□□□□ -0.5
COX11P19516 YLL053CYLL053C 459 nt11.87□□□□□ -0.51
COX11P19516 YLR179CYLR179C 606 nt11.86□□□□□ -0.51
COX11P19516 BOP3YNL042W 1191 nt11.81□□□□□ -0.52
COX11P19516 RTF1YGL244W 1677 nt11.8□□□□□ -0.52
COX11P19516 FTR1YER145C 1215 nt11.78□□□□□ -0.52
COX11P19516 NCP1YHR042W 2076 nt11.77□□□□□ -0.52
COX11P19516 YPR064WYPR064W 420 nt11.75□□□□□ -0.53
COX11P19516 GAL1YBR020W 1587 nt11.75□□□□□ -0.53
COX11P19516 PIB2YGL023C 1908 nt11.73□□□□□ -0.53
COX11P19516 ERF2YLR246W 1080 nt11.73□□□□□ -0.53
COX11P19516 TRM5YHR070W 1500 nt11.72□□□□□ -0.53
COX11P19516 AQY1YPR192W 918 nt11.72□□□□□ -0.53
COX11P19516 WSC2YNL283C 1512 nt11.7□□□□□ -0.54
COX11P19516 ATF2YGR177C 1608 nt11.69□□□□□ -0.54
COX11P19516 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.69□□□□□ -0.54
COX11P19516 AHT1YHR093W 549 nt11.69□□□□□ -0.54
COX11P19516 DDR2YOL052C-A 186 nt11.68□□□□□ -0.54
COX11P19516 CRR1YLR213C 1269 nt11.67□□□□□ -0.54
COX11P19516 TAD3YLR316C 969 nt11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.7 ms