Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCAP17252 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCAP17252 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCAP17252 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCAP17252 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCAP17252 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCAP17252 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKCAP17252 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCAP17252 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCAP17252 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCAP17252 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCAP17252 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCAP17252 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKCAP17252 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKCAP17252 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKCAP17252 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKCAP17252 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKCAP17252 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKCAP17252 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCAP17252 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCAP17252 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKCAP17252 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCAP17252 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKCAP17252 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCAP17252 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCAP17252 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCAP17252 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCAP17252 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCAP17252 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCAP17252 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCAP17252 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCAP17252 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCAP17252 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKCAP17252 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCAP17252 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCAP17252 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKCAP17252 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKCAP17252 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCAP17252 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCAP17252 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKCAP17252 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCAP17252 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms