Protein–RNA interactions for Protein: P0CS90

SSC1, Heat shock protein SSC1, mitochondrial, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSC1P0CS90 YKL097CYKL097C 411 nt12.6□□□□□ -0.39
SSC1P0CS90 NVJ2YPR091C 2313 nt12.57□□□□□ -0.4
SSC1P0CS90 SDH1YKL148C 1923 nt12.56□□□□□ -0.4
SSC1P0CS90 RKM5YLR137W 1104 nt12.54□□□□□ -0.4
SSC1P0CS90 IRC15YPL017C 1500 nt12.52□□□□□ -0.4
SSC1P0CS90 ART5YGR068C 1761 nt12.5□□□□□ -0.41
SSC1P0CS90 GFD2YCL036W 1701 nt12.49□□□□□ -0.41
SSC1P0CS90 SCC4YER147C 1875 nt12.44□□□□□ -0.42
SSC1P0CS90 GIS3YLR094C 1509 nt12.43□□□□□ -0.42
SSC1P0CS90 PET9YBL030C 957 nt12.39□□□□□ -0.43
SSC1P0CS90 RTS2YOR077W 699 nt12.39□□□□□ -0.43
SSC1P0CS90 TIR4YOR009W 1464 nt12.38□□□□□ -0.43
SSC1P0CS90 YCH1YGR203W 447 nt12.32□□□□□ -0.44
SSC1P0CS90 NPL3YDR432W 1245 nt12.28□□□□□ -0.44
SSC1P0CS90 YMR057CYMR057C 372 nt12.26□□□□□ -0.45
SSC1P0CS90 YOL037CYOL037C 354 nt12.26□□□□□ -0.45
SSC1P0CS90 FPS1YLL043W 2010 nt12.25□□□□□ -0.45
SSC1P0CS90 CUE1YMR264W 612 nt12.25□□□□□ -0.45
SSC1P0CS90 SEC11YIR022W 504 nt12.21□□□□□ -0.45
SSC1P0CS90 PCH2YBR186W 1695 nt12.21□□□□□ -0.45
SSC1P0CS90 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.2□□□□□ -0.46
SSC1P0CS90 YOR139CYOR139C 393 nt12.19□□□□□ -0.46
SSC1P0CS90 YSC84YHR016C 1407 nt12.19□□□□□ -0.46
SSC1P0CS90 GUT2YIL155C 1950 nt12.16□□□□□ -0.46
SSC1P0CS90 YJL152WYJL152W 360 nt12.15□□□□□ -0.46
SSC1P0CS90 YHL050CYHL050C 2094 nt12.14□□□□□ -0.47
SSC1P0CS90 RRT12YCR045C 1476 nt12.09□□□□□ -0.47
SSC1P0CS90 YIL100WYIL100W 354 nt12.08□□□□□ -0.48
SSC1P0CS90 YLR236CYLR236C 324 nt12.04□□□□□ -0.48
SSC1P0CS90 WHI5YOR083W 888 nt12.02□□□□□ -0.49
SSC1P0CS90 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.02□□□□□ -0.49
SSC1P0CS90 YLR281CYLR281C 468 nt12.01□□□□□ -0.49
SSC1P0CS90 YNL195CYNL195C 786 nt12.01□□□□□ -0.49
SSC1P0CS90 PIB2YGL023C 1908 nt12.01□□□□□ -0.49
SSC1P0CS90 RTF1YGL244W 1677 nt11.91□□□□□ -0.5
SSC1P0CS90 IDH1YNL037C 1083 nt11.84□□□□□ -0.51
SSC1P0CS90 BOP3YNL042W 1191 nt11.84□□□□□ -0.51
SSC1P0CS90 RRD1YIL153W 1182 nt11.82□□□□□ -0.52
SSC1P0CS90 GBP2YCL011C 1284 nt11.8□□□□□ -0.52
SSC1P0CS90 NCP1YHR042W 2076 nt11.79□□□□□ -0.52
SSC1P0CS90 PUS2YGL063W 1113 nt11.78□□□□□ -0.52
SSC1P0CS90 DED1YOR204W 1815 nt11.76□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 PTK1YKL198C 1989 nt11.76□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 DSK2YMR276W 1122 nt11.74□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.73□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.73□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.73□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.73□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.73□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 IMP2'YIL154C 1041 nt11.73□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 TCD2YKL027W 1344 nt11.71□□□□□ -0.53
SSC1P0CS90 LCB1YMR296C 1677 nt11.7□□□□□ -0.54
SSC1P0CS90 FMP52YER004W 696 nt11.69□□□□□ -0.54
SSC1P0CS90 YPR011CYPR011C 981 nt11.69□□□□□ -0.54
SSC1P0CS90 FMT1YBL013W 1206 nt11.67□□□□□ -0.54
SSC1P0CS90 PCM1YEL058W 1674 nt11.62□□□□□ -0.55
SSC1P0CS90 YDR433WYDR433W 441 nt11.62□□□□□ -0.55
SSC1P0CS90 FMP45YDL222C 930 nt11.61□□□□□ -0.55
SSC1P0CS90 MXR2YCL033C 507 nt11.61□□□□□ -0.55
SSC1P0CS90 UME6YDR207C 2511 nt11.6□□□□□ -0.55
SSC1P0CS90 ADH2YMR303C 1047 nt11.57□□□□□ -0.56
SSC1P0CS90 CWP1YKL096W 720 nt11.56□□□□□ -0.56
SSC1P0CS90 ERV46YAL042W 1248 nt11.55□□□□□ -0.56
SSC1P0CS90 SIM1YIL123W 1431 nt11.54□□□□□ -0.56
SSC1P0CS90 LPX1YOR084W 1164 nt11.54□□□□□ -0.56
SSC1P0CS90 SOR2YDL246C 1074 nt11.52□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 SOR1YJR159W 1074 nt11.52□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 YFL054CYFL054C 1941 nt11.5□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 SNF6YHL025W 999 nt11.5□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 BIO4YNR057C 714 nt11.49□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 YKR040CYKR040C 504 nt11.48□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 YCL042WYCL042W 360 nt11.46□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 LYS4YDR234W 2082 nt11.46□□□□□ -0.57
SSC1P0CS90 FRD1YEL047C 1413 nt11.44□□□□□ -0.58
SSC1P0CS90 SPT8YLR055C 1809 nt11.43□□□□□ -0.58
SSC1P0CS90 YIH1YCR059C 777 nt11.38□□□□□ -0.59
SSC1P0CS90 RNQ1YCL028W 1218 nt11.33□□□□□ -0.6
SSC1P0CS90 ERF2YLR246W 1080 nt11.32□□□□□ -0.6
SSC1P0CS90 YLL053CYLL053C 459 nt11.31□□□□□ -0.6
SSC1P0CS90 CRR1YLR213C 1269 nt11.31□□□□□ -0.6
SSC1P0CS90 SWE1YJL187C 2460 nt11.26□□□□□ -0.61
SSC1P0CS90 DIC1YLR348C 897 nt11.25□□□□□ -0.61
SSC1P0CS90 ATF2YGR177C 1608 nt11.24□□□□□ -0.61
SSC1P0CS90 FTR1YER145C 1215 nt11.21□□□□□ -0.61
SSC1P0CS90 SPP1YPL138C 1062 nt11.21□□□□□ -0.61
SSC1P0CS90 MIC10YCL057C-A 294 nt11.2□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.19□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 YJL225CYJL225C 5277 nt11.18□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 HEM12YDR047W 1089 nt11.18□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 MOT3YMR070W 1473 nt11.18□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 GAL1YBR020W 1587 nt11.17□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 BOR1YNL275W 1731 nt11.17□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 TRM5YHR070W 1500 nt11.16□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 PTH1YHR189W 573 nt11.16□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 SNG1YGR197C 1644 nt11.16□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 YFL067WYFL067W 528 nt11.15□□□□□ -0.62
SSC1P0CS90 DDR2YOL052C-A 186 nt11.09□□□□□ -0.63
SSC1P0CS90 YLR235CYLR235C 399 nt11.08□□□□□ -0.64
SSC1P0CS90 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.06□□□□□ -0.64
SSC1P0CS90 RAX1YOR301W 1308 nt11.06□□□□□ -0.64
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