Protein–RNA interactions for Protein: P08432

SPE1, Ornithine decarboxylase, yeastyeast

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE1P08432 SSA4YER103W 1929 nt12.88□□□□□ -0.35
SPE1P08432 YCH1YGR203W 447 nt12.84□□□□□ -0.35
SPE1P08432 MRPL8YJL063C 717 nt12.79□□□□□ -0.36
SPE1P08432 MEP2YNL142W 1500 nt12.73□□□□□ -0.37
SPE1P08432 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.73□□□□□ -0.37
SPE1P08432 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.73□□□□□ -0.37
SPE1P08432 ALF1YNL148C 765 nt12.7□□□□□ -0.38
SPE1P08432 YPS1YLR120C 1710 nt12.67□□□□□ -0.38
SPE1P08432 YJL152WYJL152W 360 nt12.65□□□□□ -0.38
SPE1P08432 LPX1YOR084W 1164 nt12.65□□□□□ -0.38
SPE1P08432 ERV46YAL042W 1248 nt12.62□□□□□ -0.39
SPE1P08432 ADO1YJR105W 1023 nt12.59□□□□□ -0.39
SPE1P08432 IDH1YNL037C 1083 nt12.58□□□□□ -0.4
SPE1P08432 SPP1YPL138C 1062 nt12.58□□□□□ -0.4
SPE1P08432 YDR095CYDR095C 411 nt12.56□□□□□ -0.4
SPE1P08432 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.56□□□□□ -0.4
SPE1P08432 YEL076CYEL076C 651 nt12.56□□□□□ -0.4
SPE1P08432 YLR464WYLR464W 651 nt12.56□□□□□ -0.4
SPE1P08432 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
SPE1P08432 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.51□□□□□ -0.41
SPE1P08432 SIS1YNL007C 1059 nt12.51□□□□□ -0.41
SPE1P08432 YDR433WYDR433W 441 nt12.5□□□□□ -0.41
SPE1P08432 RTG1YOL067C 534 nt12.5□□□□□ -0.41
SPE1P08432 UBX6YJL048C 1191 nt12.47□□□□□ -0.41
SPE1P08432 YKR040CYKR040C 504 nt12.47□□□□□ -0.41
SPE1P08432 BDF1YLR399C 2061 nt12.45□□□□□ -0.42
SPE1P08432 TIR4YOR009W 1464 nt12.45□□□□□ -0.42
SPE1P08432 GBP2YCL011C 1284 nt12.42□□□□□ -0.42
SPE1P08432 MXR2YCL033C 507 nt12.37□□□□□ -0.43
SPE1P08432 EMI2YDR516C 1503 nt12.35□□□□□ -0.43
SPE1P08432 PTP1YDL230W 1008 nt12.33□□□□□ -0.44
SPE1P08432 Q0182Q0182 405 nt12.33□□□□□ -0.44
SPE1P08432 RPP2AYOL039W 321 nt12.33□□□□□ -0.44
SPE1P08432 CAC2YML102W 1407 nt12.3□□□□□ -0.44
SPE1P08432 ART5YGR068C 1761 nt12.28□□□□□ -0.44
SPE1P08432 YBR220CYBR220C 1683 nt12.27□□□□□ -0.45
SPE1P08432 HUA1YGR268C 597 nt12.26□□□□□ -0.45
SPE1P08432 YMR057CYMR057C 372 nt12.26□□□□□ -0.45
SPE1P08432 TAT1YBR069C 1860 nt12.25□□□□□ -0.45
SPE1P08432 PET9YBL030C 957 nt12.25□□□□□ -0.45
SPE1P08432 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.24□□□□□ -0.45
SPE1P08432 YDL221WYDL221W 552 nt12.23□□□□□ -0.45
SPE1P08432 YMR090WYMR090W 684 nt12.22□□□□□ -0.45
SPE1P08432 TCD2YKL027W 1344 nt12.21□□□□□ -0.45
SPE1P08432 YDR094WYDR094W 336 nt12.19□□□□□ -0.46
SPE1P08432 GFD2YCL036W 1701 nt12.18□□□□□ -0.46
SPE1P08432 SDH1YKL148C 1923 nt12.15□□□□□ -0.46
SPE1P08432 FRD1YEL047C 1413 nt12.13□□□□□ -0.47
SPE1P08432 DED1YOR204W 1815 nt12.11□□□□□ -0.47
SPE1P08432 IRC15YPL017C 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
SPE1P08432 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.07□□□□□ -0.48
SPE1P08432 RRD1YIL153W 1182 nt12.07□□□□□ -0.48
SPE1P08432 FPS1YLL043W 2010 nt12.04□□□□□ -0.48
SPE1P08432 SCC4YER147C 1875 nt12.03□□□□□ -0.48
SPE1P08432 PTH1YHR189W 573 nt12.02□□□□□ -0.49
SPE1P08432 GIS3YLR094C 1509 nt12.01□□□□□ -0.49
SPE1P08432 YKL030WYKL030W 606 nt12□□□□□ -0.49
SPE1P08432 YLR235CYLR235C 399 nt11.98□□□□□ -0.49
SPE1P08432 YCL042WYCL042W 360 nt11.98□□□□□ -0.49
SPE1P08432 RTS2YOR077W 699 nt11.97□□□□□ -0.49
SPE1P08432 SOR2YDL246C 1074 nt11.96□□□□□ -0.49
SPE1P08432 SOR1YJR159W 1074 nt11.96□□□□□ -0.49
SPE1P08432 FMT1YBL013W 1206 nt11.96□□□□□ -0.49
SPE1P08432 LCB1YMR296C 1677 nt11.91□□□□□ -0.5
SPE1P08432 CUE1YMR264W 612 nt11.87□□□□□ -0.51
SPE1P08432 PCH2YBR186W 1695 nt11.84□□□□□ -0.51
SPE1P08432 FMP52YER004W 696 nt11.82□□□□□ -0.52
SPE1P08432 GUT2YIL155C 1950 nt11.8□□□□□ -0.52
SPE1P08432 SEC11YIR022W 504 nt11.8□□□□□ -0.52
SPE1P08432 CWP1YKL096W 720 nt11.79□□□□□ -0.52
SPE1P08432 YSC84YHR016C 1407 nt11.78□□□□□ -0.52
SPE1P08432 PAU16YKL224C 372 nt11.76□□□□□ -0.53
SPE1P08432 YHL050CYHL050C 2094 nt11.75□□□□□ -0.53
SPE1P08432 ADH2YMR303C 1047 nt11.75□□□□□ -0.53
SPE1P08432 YFR018CYFR018C 1092 nt11.74□□□□□ -0.53
SPE1P08432 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.73□□□□□ -0.53
SPE1P08432 RRT12YCR045C 1476 nt11.72□□□□□ -0.53
SPE1P08432 SBA1YKL117W 651 nt11.72□□□□□ -0.53
SPE1P08432 TIM23YNR017W 669 nt11.72□□□□□ -0.53
SPE1P08432 YIL100WYIL100W 354 nt11.71□□□□□ -0.53
SPE1P08432 RRT5YFR032C 870 nt11.69□□□□□ -0.54
SPE1P08432 PIB2YGL023C 1908 nt11.68□□□□□ -0.54
SPE1P08432 DIC1YLR348C 897 nt11.68□□□□□ -0.54
SPE1P08432 PRE6YOL038W 765 nt11.66□□□□□ -0.54
SPE1P08432 YLR179CYLR179C 606 nt11.64□□□□□ -0.55
SPE1P08432 PCM1YEL058W 1674 nt11.62□□□□□ -0.55
SPE1P08432 SNF6YHL025W 999 nt11.61□□□□□ -0.55
SPE1P08432 YPR064WYPR064W 420 nt11.61□□□□□ -0.55
SPE1P08432 YNL195CYNL195C 786 nt11.57□□□□□ -0.56
SPE1P08432 TAD3YLR316C 969 nt11.56□□□□□ -0.56
SPE1P08432 RNQ1YCL028W 1218 nt11.56□□□□□ -0.56
SPE1P08432 WSC2YNL283C 1512 nt11.54□□□□□ -0.56
SPE1P08432 RTF1YGL244W 1677 nt11.53□□□□□ -0.56
SPE1P08432 YIH1YCR059C 777 nt11.53□□□□□ -0.56
SPE1P08432 AHT1YHR093W 549 nt11.52□□□□□ -0.57
SPE1P08432 PAC11YDR488C 1602 nt11.52□□□□□ -0.57
SPE1P08432 YFL066CYFL066C 1179 nt11.46□□□□□ -0.57
SPE1P08432 BOP3YNL042W 1191 nt11.45□□□□□ -0.58
SPE1P08432 PEX25YPL112C 1185 nt11.43□□□□□ -0.58
SPE1P08432 NCP1YHR042W 2076 nt11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms