Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLSTN1O94985 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLSTN1O94985 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLSTN1O94985 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLSTN1O94985 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLSTN1O94985 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLSTN1O94985 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLSTN1O94985 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLSTN1O94985 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLSTN1O94985 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLSTN1O94985 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLSTN1O94985 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CLSTN1O94985 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLSTN1O94985 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLSTN1O94985 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLSTN1O94985 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLSTN1O94985 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLSTN1O94985 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLSTN1O94985 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CLSTN1O94985 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CLSTN1O94985 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CLSTN1O94985 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLSTN1O94985 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLSTN1O94985 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLSTN1O94985 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLSTN1O94985 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLSTN1O94985 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CLSTN1O94985 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CLSTN1O94985 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLSTN1O94985 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLSTN1O94985 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLSTN1O94985 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLSTN1O94985 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLSTN1O94985 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLSTN1O94985 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLSTN1O94985 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CLSTN1O94985 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLSTN1O94985 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLSTN1O94985 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLSTN1O94985 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLSTN1O94985 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CLSTN1O94985 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLSTN1O94985 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLSTN1O94985 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CLSTN1O94985 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CLSTN1O94985 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLSTN1O94985 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLSTN1O94985 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLSTN1O94985 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLSTN1O94985 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLSTN1O94985 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLSTN1O94985 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLSTN1O94985 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLSTN1O94985 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLSTN1O94985 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CLSTN1O94985 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLSTN1O94985 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms