Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF4O60810 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRAMEF4O60810 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRAMEF4O60810 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF4O60810 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF4O60810 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF4O60810 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF4O60810 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF4O60810 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF4O60810 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF4O60810 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAMEF4O60810 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF4O60810 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF4O60810 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF4O60810 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF4O60810 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF4O60810 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF4O60810 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF4O60810 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF4O60810 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF4O60810 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF4O60810 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF4O60810 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF4O60810 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF4O60810 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF4O60810 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF4O60810 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF4O60810 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF4O60810 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF4O60810 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF4O60810 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF4O60810 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF4O60810 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF4O60810 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF4O60810 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF4O60810 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF4O60810 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF4O60810 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF4O60810 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF4O60810 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF4O60810 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF4O60810 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF4O60810 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF4O60810 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF4O60810 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF4O60810 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF4O60810 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF4O60810 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF4O60810 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF4O60810 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF4O60810 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF4O60810 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms