Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf92A6NGG3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf92A6NGG3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C9orf92A6NGG3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf92A6NGG3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf92A6NGG3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf92A6NGG3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf92A6NGG3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf92A6NGG3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf92A6NGG3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf92A6NGG3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C9orf92A6NGG3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf92A6NGG3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf92A6NGG3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms