Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms