Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAF6Q9Y4K3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms