Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HDGFL3Q9Y3E1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms