Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RCE1Q9Y256 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RCE1Q9Y256 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RCE1Q9Y256 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RCE1Q9Y256 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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