Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
L1RE1Q9UN81 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms