Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN7L1Q9ULK2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms