Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NDUFA12Q9UI09 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms