Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP25Q9UHP3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms