Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS7AQ9UBW8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS7AQ9UBW8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS7AQ9UBW8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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