Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms