Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DNMT3BQ9UBC3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms