Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REREQ9P2R6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms