Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAPAQ9P0L0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAPAQ9P0L0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms